综合分析揭示关键溶酶体基因作为阿尔茨海默病的潜在治疗靶点

阿尔茨海默病（AD）是一种伴有早期自噬缺陷的神经退行性疾病。我们的研究探讨了溶酶体相关基因（LRGs）在AD中的作用。利用基因表达综合（GEO）数据库，我们分析了AD中的差异表达基因（DEGs）。从公共数据库中提取了AD相关基因和溶酶体相关基因（LRGs）。利用UpSetR包，我们鉴定了差异表达的LRGs（DE-LRGs）。随后，基于DE-LRGs，使用共识聚类分析将AD患者分为不同的分子亚型。通过单样本基因集富集分析（ssGSEA）研究免疫细胞模式。通过基因集变异分析（GSVA）评估分子通路，而孟德尔随机化（MR）则识别潜在的基因-AD因果关系。为了加强我们的生物信息学发现，我们进行了体外实验。总共鉴定出52个DE-LRGs，其中LAMP1、VAMP2和CTSB是突出的核心基因。利用52个DE-LRGs，AD患者被分为三个不同的分子亚型。有趣的是，上述三个核心基因在亚型间对AD区分表现出显著的预测准确性。ssGSEA进一步揭示了LAMP1、VAMP2和CTSB与浆细胞、成纤维细胞、嗜酸性粒细胞和内皮细胞的相关性。GSVA分析强调了LAMP1、VAMP2和CTSB与NOTCH、TGFβ和P53通路的显著关联。令人信服的是，MR研究结果表明LAMP1、CTSB与AD之间存在潜在的因果关系。增强我们的生物信息学结论，体外试验显示LAMP1可能通过增强自噬过程来减轻AD的进展。LAMP1和CTSB成为潜在的AD生物标志物，为创新治疗干预铺平了道路。