电穿孔递送Cas9 sgRNA核糖核蛋白介导的绵羊IVF受精卵基因组编辑

Electroporation Delivery of Cas9 sgRNA Ribonucleoprotein-Mediated Genome Editing in Sheep IVF Zygotes.

作者信息Wenhui Pi, Guangyu Feng, Minghui Liu, Cunxi Nie, Cheng Chen, Jingjing Wang, Limin Wang, Pengcheng Wan, Changbin Liu, Yi Liu, Ping Zhou
PMID39273092
发布时间2024-08-23
DOI10.3390/ijms25179145

实验完整度

高

包含体外受精、电穿孔参数优化、基因编辑效率对比、ssODN敲入以及胚胎移植产生基因编辑羔羊等多个独立实验层级,并进行了功能验证和机制验证(如RNP质量影响)。

主要模型

绵羊IVF受精卵 绵羊囊胚 MSTN基因编辑羔羊

重点核对

电穿孔参数:Settings 1和3(电压40 V/42 V,脉冲长度3.5 ms/3.0 ms) 电穿孔时间:受精后6小时 Cas9 RNP类型:预孵育的sf-Cas9 RNPs+sgRNA或完全体外组装的Cas9 RNPs ssODN浓度:420 ng/μL,长度99 nt 胚胎移植:5枚囊胚移植入1只受体母羊

摘要

利用电穿孔递送CRISPR/Cas9系统组分,已在哺乳动物受精卵中实现高效基因编辑,促进了基因组编辑动物的开发。在本研究中,我们以绵羊ACTG1和MSTN基因为靶点,揭示了电穿孔中的阈值现象,即绵羊体外受精(IVF)受精卵存在电压耐受性。研究了接近40 V的不同穿孔电压和脉冲持续时间对绵羊受精卵电穿孔的影响。研究得出结论,较强的电场需要较短的脉冲持续时间,以达到高基因突变率和合理囊胚发育的最佳条件。本研究还评估了Cas9/sgRNA核糖核蛋白复合物(Cas9 RNPs)的质量及其对绵羊早期胚胎基因组编辑效率的影响。研究强调,在电穿孔前将Cas9蛋白与单向导RNA(sgRNA)预先复合对于实现高突变率至关重要。使用适合绵羊IVF受精卵的电穿孔参数,可获得显著高的突变率和杂合子比例。通过电穿孔将Cas9 RNPs和单链寡脱氧核苷酸(ssODNs)递送至受精卵,靶向MSTN(肌生成抑制素)基因,达到了26%的敲入效率。通过电穿孔将Cas9 RNPs递送至IVF受精卵,成功生成了MSTN修饰羔羊。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何通过电穿孔将Cas9 RNP高效递送至绵羊IVF受精卵,实现基因敲除和敲入?
核心机制
电穿孔参数(电压和脉冲长度)存在阈值现象,需匹配;Cas9蛋白与sgRNA预复合是高效编辑的关键。
主要证据
通过优化电穿孔参数,ACTG1基因突变率从30.28%提高到87.78%或82.14%;MSTN基因突变率约84%;ssODN敲入效率达26%;胚胎移植后获得两只MSTN基因编辑羔羊,突变率94%以上。
研究意义
证明了电穿孔递送Cas9 RNP可用于绵羊基因组编辑,为绵羊育种和基因改良提供了有效工具。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外受精(IVF)

获取绵羊受精卵用于电穿孔基因编辑。

从屠宰场收集绵羊卵巢,体外成熟卵母细胞,采用上游法选择精子,进行IVF,培养受精卵。

2

电穿孔参数优化

确定适合绵羊IVF受精卵的最佳电穿孔参数。

使用ACTG1基因的sf-Cas9 RNPs,比较了三种不同电穿孔设置(电压和脉冲长度)对卵裂率和囊胚率的影响。

3

比较不同Cas9 RNP配方的基因编辑效率

评估Cas9 RNP质量对基因编辑效率的影响。

比较了三种Cas9 RNP配方(sf-Cas9 RNPs、sf-Cas9 RNPs+sgRNA、完全体外组装的Cas9 RNPs)在ACTG1位点的突变率。

4

MSTN基因敲除

验证电穿孔在另一个基因位点的编辑效率。

使用完全体外组装的Cas9 RNPs靶向MSTN基因,采用设置1和3进行电穿孔,评估突变率。

5

ssODN介导的敲入

评估Cas9 RNP和ssODN通过电穿孔在MSTN位点实现精准敲入的效率。

将Cas9 RNPs和针对MSTN的ssODNs共同电穿孔进入受精卵,通过TIDER和Sanger测序分析敲入效率。

6

胚胎移植及后代鉴定

验证电穿孔基因编辑胚胎能否发育为基因编辑个体。

将5枚经电穿孔处理的MSTN基因编辑囊胚移植入一只受体母羊,分娩后对羔羊进行基因型鉴定。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
NEPA21超级电穿孔仪Nepagene--
Nepa电穿孔比色皿(1mm间隙)NepageneEC-001
Opti-MEM培养基Thermo Fisher Scientific31985062
TCM-199培养基Thermo Fisher Scientific11150059
胎牛血清Gibco10100147C
促卵泡激素ICP--
MEM非必需氨基酸溶液(100X)Thermo Fisher Scientific11140035
MEM氨基酸溶液EAA(50X)Thermo Fisher Scientific11130051
HEPES缓冲的TCM-199ProcellPM150612
DNA提取缓冲液EpicentreQE09050
Taq PCR预混液(2X,含蓝染料)Sangon BiotechB639295
重组Cas9蛋白Thermo Fisher ScientificA36498
sgRNAGenebiogist--
ssODNSangon Biotech--
EcoR I限制性内切酶TAKARA1611
EcoR V限制性内切酶TAKARA1612

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外受精(IVF)
卵母细胞来源、成熟培养时间(24小时)、精子浓度(5×10^6/mL)、受精时间(6小时)
阅读提示:Materials and Methods 4.3, 4.4
电穿孔
电穿孔参数(设置1:40V,3.5ms;设置3:42V,3.0ms),电穿孔时间(受精后6小时),细胞数量(每个电穿孔20μL体系)
阅读提示:Materials and Methods 4.9, 4.10
Cas9 RNP制备
RNP类型、浓度(sf-Cas9 RNPs 120 ng/μL;Cas9 RNPs 250 ng/μL)、预孵育条件(摩尔比1:2,室温10分钟)
阅读提示:Materials and Methods 4.7
基因编辑检测
PCR引物、测序方法(Sanger)、分析软件(TIDE/TIDER)
阅读提示:Materials and Methods 4.11
胚胎移植
移植囊胚数量(5枚)、受体母羊处理(CIDR同步发情)、移植时间(IVF后第6天)
阅读提示:Materials and Methods 4.12