体外受精(IVF)
获取绵羊受精卵用于电穿孔基因编辑。
从屠宰场收集绵羊卵巢,体外成熟卵母细胞,采用上游法选择精子,进行IVF,培养受精卵。
Electroporation Delivery of Cas9 sgRNA Ribonucleoprotein-Mediated Genome Editing in Sheep IVF Zygotes.
包含体外受精、电穿孔参数优化、基因编辑效率对比、ssODN敲入以及胚胎移植产生基因编辑羔羊等多个独立实验层级,并进行了功能验证和机制验证(如RNP质量影响)。
绵羊IVF受精卵 绵羊囊胚 MSTN基因编辑羔羊
电穿孔参数:Settings 1和3(电压40 V/42 V,脉冲长度3.5 ms/3.0 ms) 电穿孔时间:受精后6小时 Cas9 RNP类型:预孵育的sf-Cas9 RNPs+sgRNA或完全体外组装的Cas9 RNPs ssODN浓度:420 ng/μL,长度99 nt 胚胎移植:5枚囊胚移植入1只受体母羊
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取绵羊受精卵用于电穿孔基因编辑。
从屠宰场收集绵羊卵巢,体外成熟卵母细胞,采用上游法选择精子,进行IVF,培养受精卵。
确定适合绵羊IVF受精卵的最佳电穿孔参数。
使用ACTG1基因的sf-Cas9 RNPs,比较了三种不同电穿孔设置(电压和脉冲长度)对卵裂率和囊胚率的影响。
评估Cas9 RNP质量对基因编辑效率的影响。
比较了三种Cas9 RNP配方(sf-Cas9 RNPs、sf-Cas9 RNPs+sgRNA、完全体外组装的Cas9 RNPs)在ACTG1位点的突变率。
验证电穿孔在另一个基因位点的编辑效率。
使用完全体外组装的Cas9 RNPs靶向MSTN基因,采用设置1和3进行电穿孔,评估突变率。
评估Cas9 RNP和ssODN通过电穿孔在MSTN位点实现精准敲入的效率。
将Cas9 RNPs和针对MSTN的ssODNs共同电穿孔进入受精卵,通过TIDER和Sanger测序分析敲入效率。
验证电穿孔基因编辑胚胎能否发育为基因编辑个体。
将5枚经电穿孔处理的MSTN基因编辑囊胚移植入一只受体母羊,分娩后对羔羊进行基因型鉴定。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 电穿孔 | NEPA21超级电穿孔仪 | Nepagene | -- |
| Nepa电穿孔比色皿(1mm间隙) | Nepagene | EC-001 | |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985062 | |
| 体外成熟 | TCM-199培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11150059 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10100147C | |
| 促卵泡激素 | ICP | -- | |
| 体外培养 | MEM非必需氨基酸溶液(100X) | Thermo Fisher Scientific | 11140035 |
| MEM氨基酸溶液EAA(50X) | Thermo Fisher Scientific | 11130051 | |
| 卵母细胞回收 | HEPES缓冲的TCM-199 | Procell | PM150612 |
| DNA提取 | DNA提取缓冲液 | Epicentre | QE09050 |
| PCR | Taq PCR预混液(2X,含蓝染料) | Sangon Biotech | B639295 |
| Cas9 RNP制备 | 重组Cas9蛋白 | Thermo Fisher Scientific | A36498 |
| sgRNA合成 | sgRNA | Genebiogist | -- |
| ssODN合成 | ssODN | Sangon Biotech | -- |
| 限制性酶切 | EcoR I限制性内切酶 | TAKARA | 1611 |
| EcoR V限制性内切酶 | TAKARA | 1612 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外受精(IVF) | 卵母细胞来源、成熟培养时间(24小时)、精子浓度(5×10^6/mL)、受精时间(6小时) 阅读提示:Materials and Methods 4.3, 4.4 |
| 电穿孔 | 电穿孔参数(设置1:40V,3.5ms;设置3:42V,3.0ms),电穿孔时间(受精后6小时),细胞数量(每个电穿孔20μL体系) 阅读提示:Materials and Methods 4.9, 4.10 |
| Cas9 RNP制备 | RNP类型、浓度(sf-Cas9 RNPs 120 ng/μL;Cas9 RNPs 250 ng/μL)、预孵育条件(摩尔比1:2,室温10分钟) 阅读提示:Materials and Methods 4.7 |
| 基因编辑检测 | PCR引物、测序方法(Sanger)、分析软件(TIDE/TIDER) 阅读提示:Materials and Methods 4.11 |
| 胚胎移植 | 移植囊胚数量(5枚)、受体母羊处理(CIDR同步发情)、移植时间(IVF后第6天) 阅读提示:Materials and Methods 4.12 |