体外细胞系中MFAP2表达验证
验证MFAP2在骨肉瘤细胞系中相对于正常成骨细胞的表达差异。
使用qRT-PCR检测人正常成骨细胞系hFOB1.19和骨肉瘤细胞系HOS、U2OS、MG63中MFAP2的mRNA表达水平。
MFAP2 induces epithelial-mesenchymal transformation of osteosarcoma cells by activating the Notch1 pathway.
包含细胞实验、转录组数据分析、异种移植模型等多个证据层级,并有功能验证(增殖、迁移、侵袭)和机制验证(Notch1通路激活)。
U2OS细胞系(人骨肉瘤) hFOB1.19正常成骨细胞系 异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠皮下接种U2OS细胞)
MFAP2敲低效率需通过qRT-PCR验证 EGF浓度50 ng/mL处理30分钟诱导EMT VPA浓度3 mM处理24小时激活Notch1 细胞接种数量:100 µL含2000个细胞/孔(CCK-8),5×10^5细胞/孔(伤口愈合),Transwell上室200 µL含1×10^5细胞/mL 动物模型:BALB/c裸鼠皮下注射4×10^6个U2OS细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MFAP2在骨肉瘤细胞系中相对于正常成骨细胞的表达差异。
使用qRT-PCR检测人正常成骨细胞系hFOB1.19和骨肉瘤细胞系HOS、U2OS、MG63中MFAP2的mRNA表达水平。
评估MFAP2敲低对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响。
使用靶向MFAP2的shRNA转染U2OS细胞,通过CCK-8、伤口愈合和Transwell实验检测细胞活力、迁移和侵袭能力。
验证MFAP2敲低对EMT标志物表达的影响。
通过Western blotting检测U2OS细胞中N-钙黏蛋白、波形蛋白和β-连环蛋白的表达水平。
验证MFAP2敲低对EGF诱导的EMT形态变化的影响。
用EGF处理U2OS细胞,并通过显微镜观察细胞形态变化。
评估MFAP2与Notch1信号通路在骨肉瘤中的相关性。
从GEO数据库获取基因芯片数据,合并去批次效应,进行GSVA富集分析,并使用Pearson相关分析MFAP2与Notch1通路的相关性。
验证Notch1激活是否能逆转MFAP2敲低对骨肉瘤细胞恶性特征和EMT的影响。
将稳定转染sh-MFAP2的U2OS细胞用VPA处理,检测Notch1蛋白表达、细胞活力、侵袭能力和EMT标志物表达。
在体内验证MFAP2敲低对骨肉瘤肿瘤生长和EMT的影响。
将稳定转染sh-NC或sh-MFAP2的U2OS细胞皮下注射到裸鼠,28天后处死,测量肿瘤体积和重量,检测EMT标志物和Notch1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | hFOB1.19细胞系 | -- | -- |
| HOS细胞系 | -- | -- | |
| U2OS细胞系 | -- | -- | |
| MG63细胞系 | -- | -- | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 高糖DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Ephraim | -- | |
| 双抗 | Hyclone | -- | |
| 5% CO2培养箱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞处理 | 表皮生长因子 | -- | -- |
| 丙戊酸 | Solarbio | YZ-1708707 | |
| 基因敲低 | 靶向MFAP2的shRNA | VectorBuilder Inc. | -- |
| 靶向阴性对照的shRNA | VectorBuilder Inc. | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| FastKing gDNA去除RT SuperMix试剂盒 | TIANGEN | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Lifeint | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8反应液 | Beyotime | -- |
| 酶标仪 | Wuxi Hiwell Diatek | -- | |
| 迁移实验 | 显微镜 | Olympus | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | -- | -- |
| Transwell小室 | -- | -- | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA试剂 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Beyotime | -- | |
| ECL检测试剂A和B | Applygen | -- | |
| X光胶片 | Servicebio | -- | |
| GAPDH抗体 | CST | 2118 | |
| β-连环蛋白抗体 | Affinity | AF6266 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Affinity | AF5239 | |
| 波形蛋白抗体 | Affinity | AF7013 | |
| Notch1抗体 | CST | 3608 | |
| 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | ab205718 | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | -- | -- |
| 异氟烷 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、FBS和双抗浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| MFAP2敲低 | shRNA序列、转染方法、转染时间、筛选浓度(嘌呤霉素2.5 µg/mL) 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 活力检测 | 细胞接种数目(2000细胞/孔)、CCK-8孵育时间(2小时)、检测波长(450 nm) 阅读提示:Methods: Cell viability assays |
| 迁移检测 | 细胞密度(5×10^5细胞/孔)、检测时间点(0h, 24h, 48h) 阅读提示:Methods: Migration assays |
| 侵袭检测 | Matrigel浓度(50 mg/L)、细胞密度(1×10^5细胞/mL)、孵育时间(24小时) 阅读提示:Methods: Invasion assays |
| EMT诱导 | EGF浓度(50 ng/mL)、处理时间(30分钟) 阅读提示:Methods: Cell treatment and groups |
| Notch1激活 | VPA浓度(3 mM)、处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell treatment and groups |
| 异种移植模型 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(6周)、体重(18-20g)、细胞数量(4×10^6)、注射部位(右腋窝)、观察时间(28天) 阅读提示:Methods: Animals and diets, Tumor model construction |