合成PMT和BBR衍生物
获得O-9位修饰的PMT和BBR衍生物,用于筛选PD-L1降解活性。
以BBR和PMT为原料,通过选择性去甲基化、烷基链引入和Boc脱保护合成系列氨基取代衍生物;通过NMR、HPLC-MS和HR-MS表征。
Advancing Cancer Immunotherapy through Engineering New PD-L1 Degraders: A Comprehensive Study from Small Molecules to PD-L1-Specific Peptide-Drug Conjugates.
包含体外细胞实验(PD-L1表达、功能、机制)、体内动物模型(LLC荷瘤小鼠)及分子模拟与SPR验证等多种独立证据层级,并明确功能与机制验证。
非小细胞肺癌细胞系H460、PC-9、LLC LLC荷瘤小鼠模型 正常细胞系293T、3T3-L1、Htoir-3
PMT-O9-1A的O-9位修饰对PD-L1降解能力的增强作用 PMT-O9-1A通过抑制去泛素化酶CSN5诱导PD-L1泛素-蛋白酶体降解 DppA1-DTEU-PMT在1 mM GSH下约90%的PMT释放率,在5 μM GSH下几乎无释放 LLC荷瘤小鼠模型中,DppA1-DTEU-PMT(29.5 mg/kg)给药后肿瘤生长抑制率达89% PMT-O9-1A(10 μM)处理增强活化T细胞对H460细胞的杀伤
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得O-9位修饰的PMT和BBR衍生物,用于筛选PD-L1降解活性。
以BBR和PMT为原料,通过选择性去甲基化、烷基链引入和Boc脱保护合成系列氨基取代衍生物;通过NMR、HPLC-MS和HR-MS表征。
筛选能显著下调PD-L1蛋白水平的衍生物。
用Western blot检测H460细胞中BBR和PMT衍生物(10 μM)处理24 h后的PD-L1表达,并评估PMT-O9-1A的剂量和时间依赖性以及对IFN-γ诱导的PD-L1表达的影响。
评估PMT-O9-1A对肿瘤细胞增殖和T细胞杀伤的影响。
通过MTT法测定IC50和细胞增殖,通过结晶紫染色检测与活化T细胞共培养后H460细胞的存活率。
验证PMT-O9-1A在LLC荷瘤小鼠中的肿瘤抑制作用及免疫调节效应。
建立LLC皮下荷瘤模型,腹腔注射PMT-O9-1A(10 mg/kg)或对照,每日一次,共10 d;记录肿瘤体积和重量,通过IHC检测Ki-67和PD-L1,流式分析TILs,ELISA检测细胞因子。
阐明PMT-O9-1A下调PD-L1的分子机制。
检测mRNA水平和蛋白稳定性;使用CHX、MG132、CQ探究降解途径;通过生物素化探针(PMT-O9-1Bio)进行链霉亲和素pull-down验证与CSN5的结合;通过CSN5过表达和SPR分析进一步验证。
构建肿瘤微环境GSH响应性释放PMT-O9-1A的肽-药物偶联物。
将PMT-O9-1A与PD-L1靶向肽DppA1通过两种不同的二硫键连接子(NPDEC和NPDBC)偶联,得到DppA1-DTEU-PMT和DppA1-DTBU-PMT,并通过HPLC-MS、MALDI-TOF-MS和HR-MS表征。
验证PDC的GSH响应性释放行为及其PD-L1降解能力。
在不同GSH浓度下用HPLC检测PMT释放率;用Western blot评估PDC对H460细胞PD-L1的影响;用MTT评估对正常细胞增殖的影响。
评估DppA1-DTEU-PMT在LLC荷瘤小鼠中的抗肿瘤疗效和免疫调节作用。
建立LLC皮下荷瘤模型,腹腔注射DppA1-DTEU-PMT(29.5 mg/kg)或对照,每日一次,共8 d;记录肿瘤生长,IHC检测Ki-67和PD-L1,流式分析TILs,ELISA检测细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化合物合成 | 盐酸小檗碱 | Aladdin | -- |
| 盐酸巴马汀 | Aladdin | -- | |
| 羟基苯并三唑 | Aladdin | -- | |
| 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺 | Aladdin | -- | |
| 溴代叔丁基氨基甲酸酯 | Annaiji Chemistry | -- | |
| 氯化氢甲醇溶液 | Admas-beta | -- | |
| DppA1肽 | GL Biochem Ltd. | -- | |
| 细胞培养 | F12K培养基 | Gibco | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gemini | -- | |
| 胰蛋白酶 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 溶酶体红色荧光探针 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT粉末 | Sigma | -- |
| 机制研究 | 氯喹粉末 | Selleck | -- |
| pull-down实验 | Pierce链霉亲和素磁珠 | Thermo Scientific | -- |
| 流式细胞术 | 胶原酶IV | Thermo Scientific | -- |
| 核酸酶粉末 | Solarbio | -- | |
| 机制研究 | pEnCMV-CSN5-3×Myc质粒 | Miaoling Biology | -- |
| 转染 | E-trans转染试剂 | GeneChem Technology | -- |
| 化合物表征 | Bruker AVANCE III HD波谱仪 | Bruker | -- |
| Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 化合物分离纯化 | Waters Arc高效液相色谱仪 | Waters | -- |
| XBridge C18色谱柱 | Waters | -- | |
| Prep 150液相色谱系统 | Waters | -- | |
| 化合物分析 | TSQ Fortis Plus质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 光学性质测定 | UV-4802分光光度计 | Unico Shanghai Instruments Co., Ltd. | -- |
| 荧光测定 | FLS980瞬态稳态荧光光谱仪 | Edinburgh Instruments | -- |
| 细胞成像 | Cytation 5细胞成像系统 | BioTek Agilent | -- |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 流式细胞术 | BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- |
| RT-qPCR | CFX96热循环仪 | Bio-Rad | -- |
| SPR分析 | Biacore 8K表面等离子体共振仪 | GE Healthcare | -- |
| 小动物活体成像 | VISQUE活体成像系统 | Vieworks | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | New Cell & Molecular Biotech Co | -- |
| PVDF膜 | Roche Diagnostics | -- | |
| PD-L1抗体 | Abcam | ab213524 | |
| PD-L1抗体 | Abmart | M033179 | |
| CSN5抗体 | Zen-bioscience | R382330 | |
| GAPDH抗体 | Abways | AB0037 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor Plus 488荧光二抗 | Invitrogen | -- |
| Hoechst 33342染液 | Invitrogen | -- | |
| T细胞毒性实验 | 重组人IL-2 | Proteintech | -- |
| CD3/CD28/CD2 T细胞激活剂 | STEMCELL Technologies | 10970 | |
| qPCR | RNAiso Plus试剂 | TAKARA | -- |
| PrimeScript逆转录试剂 | TAKARA | -- | |
| StarLighter SYBR Green qPCR预混液 | Forever Star | -- | |
| SPR分析 | CM5芯片 | Cytiva | -- |
| 动物实验 | Cy5.5荧光染料 | -- | -- |
| 免疫组化 | PD-L1抗体 | Abclonal | A11273 |
| Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 流式细胞术 | PE标记抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | -- |
| APC标记抗小鼠CD3抗体 | Biolegend | -- | |
| FITC标记抗小鼠CD4抗体 | Biolegend | -- | |
| FITC标记抗小鼠CD8a抗体 | Biolegend | -- | |
| ELISA | 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | shfksc | -- |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | shfksc | -- | |
| 小鼠GrB ELISA试剂盒 | shfksc | -- | |
| 安全性评估 | ALT检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| AST检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| CRE检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| BUN检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 体外模拟 | AlphaFold | -- | -- |
| 分子模拟 | Gaussian 09 | -- | -- |
| Amber18 | -- | -- | |
| Discovery Studio客户端 | -- | -- | |
| UCSF Chimera | -- | -- | |
| 数据分析 | ImageJ | -- | -- |
| 流式数据分析 | FlowJo X | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基;PMT-O9-1A处理浓度和时间 阅读提示:Experimental Section 中的 Cell Culture 部分 |
| PD-L1表达检测 | 抗体稀释比例,处理浓度(10 μM),处理时间(24 h) 阅读提示:Figure 3 图注及 Western Blotting Analysis 部分 |
| 体外T细胞杀伤 | Jurkat T细胞激活条件,H460与T细胞比例,共培养时间(2 d) 阅读提示:Experimental Section 中的 T Cell Toxicity 部分 |
| 体内肿瘤模型 | 小鼠品系(C57BL/6),细胞接种数(1×10^6),给药剂量(PMT衍生物10 mg/kg,PDC 29.5 mg/kg),给药频率和周期 阅读提示:Experimental Section 中的 Animal Studies 部分 |
| GSH响应性释放实验 | PDC浓度(50 μM),GSH浓度(5 μM、1 mM、5 mM),孵育温度(37 °C) 阅读提示:Experimental Section 中的 GSH-Responsive Drug Release Experiments 部分 |