建立LICD模型并检测TSPO表达
验证LPS诱导心功能障碍模型中TSPO是否上调
C57BL/6小鼠腹腔注射LPS(25 mg/kg)建立LICD模型,12小时后通过Western blot、RT-qPCR和免疫荧光检测心脏TSPO表达。
Effect of mitochondrial translocator protein TSPO on LPS-induced cardiac dysfunction.
包含TSPO敲除小鼠体内模型、H9c2细胞体外模型、IP-MS机制验证及TSPO-PROTAC干预实验,多层次功能与机制验证。
C57BL/6小鼠LPS诱导的脓毒症心功能障碍模型 TSPO基因敲除小鼠 H9c2心肌细胞 HEK-293细胞
LPS剂量25 mg/kg腹腔注射诱导LICD模型 TSPO敲除小鼠的构建与验证 TSPO-PROTAC给药剂量(5-20 mg/kg)与处理时间 VDAC寡聚化检测条件(EGS交联剂浓度0.5 mM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LPS诱导心功能障碍模型中TSPO是否上调
C57BL/6小鼠腹腔注射LPS(25 mg/kg)建立LICD模型,12小时后通过Western blot、RT-qPCR和免疫荧光检测心脏TSPO表达。
评估TSPO缺失对心脏功能、存活率和病理损伤的影响
使用TSPO基因敲除小鼠,给予LPS诱导LICD,通过Kaplan-Meier生存分析、超声心动图、HE染色、TUNEL染色和Western blot检测心脏功能、病理和凋亡指标。
评估TSPO敲除对线粒体形态和功能的影响
通过透射电镜观察线粒体形态,检测柠檬酸合酶和复合物IV活性,细胞色素c释放和mtDNA水平,NLRP3表达以及心肌细胞凋亡。
寻找TSPO的结合蛋白以揭示其机制
采用免疫沉淀结合LC-MS/MS分析,从LICD小鼠心脏中鉴定TSPO相互作用蛋白,并通过Venn图筛选线粒体外膜蛋白。
验证TSPO是否调控VDAC寡聚化及其机制
在体内(TSPO敲除小鼠)和体外(H9c2细胞siRNA敲低)检测VDAC寡聚化,并通过分子对接、位点突变和PKA抑制剂H89验证TSPO Trp107与VDAC Ser162的相互作用。
评估TSPO-PROTAC能否降解TSPO并改善LPS诱导的细胞损伤
用TSPO-PROTAC处理H9c2细胞,检测TSPO表达、细胞活力、VDAC寡聚化、线粒体功能及凋亡。
评估TSPO-PROTAC在LICD小鼠中的疗效和安全性
给予LICD小鼠TSPO-PROTAC,检测TSPO表达、存活率、心脏功能、心肌损伤标志物、炎症因子和VDAC寡聚化;同时检测正常小鼠的体重、器官重量、组织学和血清生化指标以评估安全性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 脂多糖 | -- | -- |
| 细胞培养 | H9c2细胞专用培养基 | Procell | CM-0089 |
| HEK-293细胞专用培养基 | Procell | CM-0001 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞培养 | G418 | -- | -- |
| siRNA转染 | 小干扰RNA | Sangon Biotech | -- |
| 线粒体分离 | 组织线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| 病理染色 | HE染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光封闭 | QuickBlock免疫染色封闭液 | Beyotime | -- |
| 抗体验证 | 抗心肌肌钙蛋白T抗体 | Invitrogen | MA5-12960 |
| 抗TSPO抗体 | Abcam | ab109497 | |
| 抗VDAC抗体 | Abcam | ab186321 | |
| 抗VDAC1抗体 | Abcam | ab306581 | |
| 抗细胞色素C抗体 | Abcam | ab133504 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Abcam | ab184787 | |
| 抗活化的Caspase 3抗体 | Beyotime | AC033 | |
| 抗COX IV抗体 | Abcam | ab202554 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| 抗磷酸化(Ser/Thr) Phe抗体 | Abcam | ab17464 | |
| 抗GAPDH抗体 | CUSABIO | -- | |
| 免疫荧光二抗 | 山羊抗小鼠IgG (Cy3) | -- | -- |
| 山羊抗兔IgG (FITC) | -- | -- | |
| 山羊抗兔IgG (Cy3) | -- | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG (FITC) | -- | -- | |
| 细胞核染色 | DAPI | -- | -- |
| 凋亡检测 | 细胞死亡检测试剂盒 | Roche | -- |
| 线粒体功能检测 | 柠檬酸合酶检测试剂盒 | Sigma | -- |
| 复合物IV啮齿动物酶活性微孔板检测试剂盒 | Abcam | -- | |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX Red | Invitrogen | -- |
| 膜电位检测 | JC-1检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| DNA提取 | DNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | cDNA合成试剂盒 | TAKARA | -- |
| qPCR | SYBR Green染料 | TAKARA | -- |
| CFX-Connect实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫共沉淀 | BeaverBeads蛋白A(或A/G)免疫沉淀试剂盒 | BeaverBeads | -- |
| VDAC交联检测 | EGS交联剂 | Thermo Fisher | -- |
| Western blot封闭 | 封闭液 | Beyotime | -- |
| Western blot二抗 | 二抗 | Li-Cor Biosciences | -- |
| 成像系统 | Vevo3100成像系统 | Fujifilm VisualSonics | -- |
| 显微镜 | Olympus IX83显微镜 | Olympus | -- |
| 电子显微镜 | FEI Tecnai G2 F20电子显微镜 | FEI | -- |
| 蛋白质降解 | TSPO-PROTAC | -- | -- |
| PK11195 | PK11195 | -- | -- |
| Pomalidomide | 泊马度胺 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6)、周龄(8周)、体重(20±2g)、LPS剂量(25 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、溶剂(无菌生理盐水)、处理时间(12小时) 阅读提示:Materials and methods: Animals and models; Figure legends: Fig. 2 |
| TSPO敲除小鼠 | TSPO敲除策略(CRISPR/Cas介导)、基因型验证(PCR)、敲除小鼠基本表型(体重、心脏重量、心功能正常) 阅读提示:Materials and methods: Animals and models; Results: Fig. S2A-D |
| 心脏功能检测 | 超声心动图设备(Vevo3100)、麻醉(2%异氟醚)、测量参数(LVEF、LVFS、LVEDD、LVESD)、分析软件(VisualSonics) 阅读提示:Materials and methods: Echocardiography; Figure legends: Fig. 2B |
| VDAC寡聚化检测 | 交联剂EGS浓度(0.5 mM)、处理时间(20分钟)、检测抗体(anti-VDAC1,ab306581)、样品来源(心肌组织或H9c2细胞) 阅读提示:Materials and methods: VDAC cross-linking assay; Figure legends: Fig. 4B, 7B |
| 细胞模型 | 细胞系(H9c2,HEK-293)、培养基(Procell specific medium)、LPS浓度(10 μg/mL)、处理时间(12小时)、siRNA-TSPO转染时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Figure legends: Fig. 4C-H |