EPC培养与鉴定
验证所用细胞为内皮祖细胞。
人脐带血EPCs购买后,通过免疫荧光检测CD133和VEGFR-2表达,以及Dil-AcLDL摄取和UEA-1结合实验进行鉴定。
Downregulation of microRNA‑221‑3p promotes angiogenesis of lipoprotein(a)‑injured endothelial progenitor cells by targeting silent information regulator 1 to activate the RAF/MEK/ERK signaling pathway.
体外细胞实验验证miR-221-3p和SIRT1功能及下游通路,包含双荧光素酶报告、Western blot等,但缺乏体内模型和其他独立证据层级。
人脐带血来源内皮祖细胞(EPC)
EPC经LP(a)处理浓度10 µg/ml,37°C孵育6小时 miR-221-3p抑制剂转染浓度为50 nM,孵育6小时 SIRT1过表达质粒转染浓度为1 µg/孔 CH5126766处理浓度1 µM,孵育24小时 细胞功能实验重复三次(n=3)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证所用细胞为内皮祖细胞。
人脐带血EPCs购买后,通过免疫荧光检测CD133和VEGFR-2表达,以及Dil-AcLDL摄取和UEA-1结合实验进行鉴定。
模拟LP(a)对EPC的损伤,评估对细胞功能的影响。
EPCs用LP(a)处理,检测miR-221-3p表达及细胞增殖、迁移、凋亡、黏附和血管生成的变化。
确定miR-221-3p的直接靶基因。
使用PITA、miRanda、GeneCards和DisGeNET数据库筛选,ENCORI预测结合位点,双荧光素酶报告实验验证靶向关系。
验证抑制miR-221-3p对LP(a)诱导的EPC功能障碍的影响。
转染miR-221-3p抑制剂后,检测细胞增殖(EdU)、迁移(Transwell)、凋亡(流式)、黏附、血管生成。
验证SIRT1过表达能否逆转LP(a)对EPC的负面影响。
转染pc-SIRT1过表达质粒后,检测细胞功能。
验证SIRT1是否通过RAF/MEK/ERK通路发挥作用。
用CH5126766(MEK/RAF抑制剂)处理SIRT1过表达细胞,检测通路蛋白磷酸化水平及细胞功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞生长培养基 | Lonza | CC-3162 |
| 胎牛血清 | Shanghai ExCell Biology | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | 脂蛋白(a) | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | EPC生长培养基 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗CD133抗体 | Abcam | ab19898 |
| 抗VEGFR-2抗体 | Cell Signaling Technology | 2479 | |
| Alexa Fluor 488抗兔二抗 | Thermo Fisher Scientific | A11008 | |
| 细胞鉴定 | Dil标记乙酰化低密度脂蛋白 | Thermo Fisher Scientific | L3484 |
| FITC标记荆豆凝集素1 | Thermo Fisher Scientific | L32476 | |
| DAPI染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | ProLong Gold防淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞转染 | miR-221-3p模拟物/阴性对照模拟物 | Guangzhou RiboBio | miR10000278-1-5 |
| miR-221-3p抑制剂/阴性对照抑制剂 | Guangzhou RiboBio | miR20000278-1-5 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | Shanghai Yuduo Biotechnology | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| SYBR Green染料 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| EdU实验 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | -- | -- |
| 1X Apollo反应混合液 | Guangzhou RiboBio | -- | |
| Hoechst 33342染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Transwell实验 | 8 µm孔径Transwell小室 | Corning | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 流式凋亡 | TransDetect Annexin V-FITC/PI试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| NovoCyte Advanteon B4流式细胞仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 黏附实验 | 肿瘤坏死因子-α | PeproTech | -- |
| CM-DiI细胞示踪染料 | Invitrogen | -- | |
| 双荧光素酶报告 | 双荧光素酶报告实验 | Promega | -- |
| xMark酶标仪 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 血管生成实验 | Geltrex基质胶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CH5126766 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Roche | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗SIRT1抗体 | Abcam | ab110304 | |
| 抗RAF抗体 | Abcam | ab200653 | |
| 抗p-RAF抗体 | Abcam | ab112053 | |
| 抗MEK抗体 | Proteintech | 11049-1-AP | |
| 抗p-MEK抗体 | Proteintech | 11049-1-AP | |
| 抗ERK抗体 | Proteintech | 66192-1-Ig | |
| 抗p-ERK抗体 | Proteintech | 28733-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | CL488-60004 | |
| HRP偶联二抗 | Proteintech | SA00001-1; | |
| ECL化学发光检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EPC培养与鉴定 | EPC来源:人脐带血,细胞系CP-H181;培养条件:EGM-2、10% FBS、100 U/ml青霉素、100 µg/ml链霉素、37°C、5% CO2;鉴定标志:CD133、VEGFR-2、Dil-AcLDL摄取、UEA-1结合 阅读提示:Methods:Cell culture and modeling;Results:Identification of EPCs |
| LP(a)损伤模型 | LP(a)浓度10 µg/ml,处理时间6小时 阅读提示:Methods:Cell culture and modeling |
| 细胞转染 | miR-221-3p抑制剂/模拟物浓度50 nM;SIRT1过表达质粒浓度1 µg/孔;转染时间6小时,后更换培养基培养24小时 阅读提示:Methods:Cell transfection |
| 细胞功能检测 | EdU实验、Transwell迁移、黏附实验、血管生成实验的具体操作细节和重复次数(n=3) 阅读提示:Methods:EdU assay, Transwell assay, Adhesion assay, Angiogenesis assay |
| 信号通路验证 | CH5126766处理浓度1 µM,处理时间24小时;Western blot检测p-RAF、p-MEK、p-ERK 阅读提示:Methods:Angiogenesis assay, Western blot analysis;Results:Effect of SIRT1... |