建立肠道菌群失调小鼠模型并评估肿瘤生长
确定抗生素暴露引起的肠道菌群失调对前列腺癌生长的影响
C57BL/6J小鼠饮水添加广谱抗生素(Abx组)或普通水(NC组),皮下或原位接种RM-1细胞,测量肿瘤体积和重量。
Gut dysbiosis promotes prostate cancer progression and docetaxel resistance via activating NF-κB-IL6-STAT3 axis.
包含体内动物模型(皮下和原位移植瘤)、体外细胞实验(RM-1和DU145)、粪便微生物移植、16S rRNA测序及临床患者样本分析,并进行功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠皮下移植瘤模型 C57BL/6J小鼠原位移植瘤模型 RM-1小鼠前列腺癌细胞系 DU145人前列腺癌细胞系
抗生素混合物(氨苄青霉素、粘菌素、新霉素、万古霉素)的剂量和给药方式 粪便微生物移植(FMT)的制备和给药 LPS处理浓度和时间 Stattic和docetaxel的剂量和给药方案 患者样本的纳入和排除标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定抗生素暴露引起的肠道菌群失调对前列腺癌生长的影响
C57BL/6J小鼠饮水添加广谱抗生素(Abx组)或普通水(NC组),皮下或原位接种RM-1细胞,测量肿瘤体积和重量。
证明肿瘤生长的促进作用是由肠道菌群介导的
收集Abx或NC组小鼠的新鲜粪便,制备细菌悬液,通过灌胃给受体小鼠,比较肿瘤体积和重量。
鉴定抗生素暴露后肠道菌群的变化,特别是变形菌门的丰度
提取粪便DNA,扩增16S rRNA V3-V4区,进行测序和生物信息学分析,比较各组菌群组成。
探讨肠道菌群失调是否导致LPS易位和瘤内LPS升高
ELISA检测粪便、血清和肿瘤中LPS水平,HE染色评估结肠组织损伤,免疫组化检测肿瘤组织中LPS表达。
证明瘤内LPS激活NF-κB-IL6-STAT3轴
体外用LPS处理RM-1细胞,检测IL6转录和蛋白水平,western blot检测p-p65和p-STAT3,使用BAY-11-7082和IL6抗体处理。体内检测肿瘤和血清中IL6及p-p65/p-STAT3水平。
验证IL6-STAT3通路促进前列腺癌细胞增殖和抵抗凋亡
使用条件培养基(CM)和Stattic处理RM-1和DU145细胞,western blot检测增殖和抗凋亡蛋白,EdU和克隆形成实验评估增殖,TUNEL评估凋亡。
确定抑制STAT3是否能逆转肠道菌群失调介导的肿瘤生长
将小鼠分为NC、Abx、Abx+Stattic组,测量肿瘤体积和重量,免疫组化检测p-STAT3、cyclin D1、c-myc表达。
验证IL6-STAT3通路促进前列腺癌对多西他赛的耐药性
体外用CM和Stattic处理细胞,加入多西他赛,检测细胞活力和凋亡。体内将小鼠分为NC、Docetaxel、Abx+Docetaxel、Abx+Docetaxel+Stattic组,测量肿瘤参数。
验证肠道菌群失调与前列腺癌进展的相关性
收集BPH、非转移性前列腺癌和转移性前列腺癌患者的粪便和临床参数,16S rRNA测序分析菌群组成,进行相关性分析和ROC曲线评估。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 粘菌素 | Rhawn | R002831 |
| 新霉素 | Macklin | N814740 | |
| 万古霉素 | Macklin | V820413 | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Solarbio | L8880 |
| BAY-11-7082 | Beyotime | S1523 | |
| Stattic | APExBIO | A2224 | |
| 多西他赛 | APExBIO | A4394 | |
| 细胞培养 | 二甲基亚砜 | Solarbio | D8370 |
| PEG300 | Solarbio | IP9020 | |
| 吐温-80 | Solarbio | T8360 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Solarbio | C0065 |
| 免疫组化 | DAB | ZSGB-BIO | ZLI-9018 |
| Ki-67抗体 | abcam | ab15580 | |
| LPS抗体 | Cloud-Clone | MAB526Ge22 | |
| p65抗体 | Beyotime | AF1234 | |
| p-p65抗体 | Affinity | AF2006 | |
| p-STAT3抗体 | Affinity | AF3293 | |
| STAT3抗体 | Beyotime | AF1492 | |
| 细胞培养 | IL6抗体 | R&D | AF-406-SP |
| 免疫组化 | C-myc抗体 | Affinity | AF0358 |
| Cyclin D1抗体 | Affinity | AF0931 | |
| Bcl-2抗体 | Beyotime | AF6285 | |
| Survivin抗体 | Affinity | AF6017 | |
| Western blot | β-肌动蛋白抗体 | Beyotime | AF5003 |
| β-微管蛋白抗体 | Beyotime | AF1216 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | CWBIO | cw0103s | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | CWBIO | cw0102s | |
| 免疫荧光 | Cy3标记的山羊抗兔IgG | BOSTER | BA1032 |
| ELISA | LPS ELISA试剂盒 | Cloud-Clone | -- |
| IL6 ELISA试剂盒 | KeyGEN | -- | |
| Western blot | ECL底物 | Millipore | WBKLS0100 |
| RT-qPCR | TriZOL试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596-026 |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR036A | |
| SYBR Green PCR预混液 | Takara | RR820A | |
| ABI QuantStudio 3 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂 | APExBIO | K1018 |
| 16S rRNA测序 | HiPure粪便DNA提取试剂盒 | Magen | -- |
| AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒 | Axygen Biosciences | -- | |
| ABI StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Life Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、年龄、抗生素剂量及给药方式、细胞接种数量和部位 阅读提示:Methods - Animal models |
| 粪便微生物移植 | 供体处理、粪便悬液制备、灌胃体积和频率 阅读提示:Methods - Animal models, FMT部分 |
| 细胞处理 | LPS处理浓度和时间 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 药物处理 | Stattic和docetaxel的剂量、溶解方法、给药途径和频率 阅读提示:Methods - Animal models, Drug treatment部分 |
| 16S rRNA测序 | 引物序列、PCR条件、测序平台、生信分析参数 阅读提示:Methods - 16S rRNA sequencing |