构建脓毒症模型并检测miR-181a-2-3p表达
评估miR-181a-2-3p在脓毒症中的表达变化及其与肾损伤的相关性
构建LPS诱导的细胞模型和CLP小鼠模型,通过qRT-PCR检测miR-181a-2-3p表达;在CLP小鼠中通过尾静脉注射agomir/antagomir进行体内转染。
MicroRNA 181a-2-3p Alleviates the Apoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells via Targeting GJB2 in Sepsis-Induced Acute Kidney Injury.
包含患者数据、CLP小鼠模型和LPS诱导的细胞模型,并通过功能获得/丧失、双荧光素酶报告基因、RIP和Western blot等验证机制。
CLP诱导的脓毒症小鼠模型 TCMK-1细胞 HK2细胞 GSE46955数据集
miR-181a-2-3p在患者和小鼠模型中的表达下调 CLP小鼠模型中使用agomir/antagomir进行体内转染 LPS处理浓度和时间(50或100 μg/ml,24小时) GJB2作为miR-181a-2-3p靶标的验证 GJB2过表达或敲低对脓毒症炎症和凋亡的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估miR-181a-2-3p在脓毒症中的表达变化及其与肾损伤的相关性
构建LPS诱导的细胞模型和CLP小鼠模型,通过qRT-PCR检测miR-181a-2-3p表达;在CLP小鼠中通过尾静脉注射agomir/antagomir进行体内转染。
确定miR-181a-2-3p对脓毒症诱导的肾损伤和炎症的功能作用
通过H&E染色、ELISA检测肾功能标志物和炎症因子、caspase-3活性测定。
验证miR-181a-2-3p在体外对细胞凋亡和炎症的调节作用
使用miR-181a-2-3p mimic或inhibitor转染TCMK-1和HK2细胞,检测细胞活力、凋亡和炎症因子表达。
确定miR-181a-2-3p直接靶向GJB2并调节其表达
利用GSE46955数据集和TargetScan预测靶基因,双荧光素酶报告基因和RIP实验验证直接结合,Western blot检测GJB2蛋白表达。
评估GJB2对脓毒症肾损伤的功能影响及与miR-181a-2-3p的关系
在CLP小鼠中敲低或过表达GJB2,检测肾损伤指标;在HK2细胞中共转染miR-181a-2-3p和GJB2载体,检测细胞凋亡和炎症。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Life Technology | -- |
| 胎牛血清 | Life Technology | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Life Technology | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Entranster-in vivo试剂 | Engreen Biosystem, Ltd. | -- | |
| 疼痛控制 | 卡洛芬 | MedChemExpress | -- |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | ThermoFisher | -- |
| cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR Green预混试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TaqMan microRNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 血液总RNA提取试剂盒 | BioTeke Corporation | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗Bax抗体 | Beyotime | -- | |
| 抗Bcl-2抗体 | Beyotime | -- | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Abcam | -- | |
| 抗cleaved caspase-9抗体 | Abcam | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Beyotime | -- | |
| HRP标记的二抗 | Abcam | -- | |
| 细胞凋亡检测 | FITC膜联蛋白V和碘化丙啶双染色试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| 分光光度计(Multiskan MK3) | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因试剂盒 | Promega | -- |
| RIP实验 | Magna RIP RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗Ago2抗体 | Millipore | -- | |
| 抗IgG抗体 | Millipore | -- | |
| caspase-3活性检测 | caspase-3活性检测试剂盒 | Bestbio | -- |
| ELISA | IL-1β、IL-6、TNF-α ELISA试剂盒 | BioLegend | -- |
| Cr和BUN ELISA试剂盒 | Jiancheng | -- | |
| NGAL和KIM-1 ELISA试剂盒 | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脓毒症动物模型构建 | 小鼠品系、性别、体重、分组、每组数量;CLP手术细节(结扎位置、穿刺次数、针头规格);疼痛控制药物及剂量 阅读提示:Materials and Methods: Construction of cecal ligation and puncture (CLP) mouse models and transfection. |
| 体内转染 | 转染试剂、剂量、注射途径、时间点 阅读提示:Materials and Methods: Construction of cecal ligation and puncture (CLP) mouse models and transfection. |
| 细胞培养与LPS处理 | 细胞系;培养基成分;LPS浓度和处理时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and constructing sepsis cell models. |
| 细胞转染 | 转染试剂、miRNA模拟物/抑制剂或siRNA/载体浓度、转染时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell transfection. |
| 肾损伤和炎症评估 | 肾功能标志物(Cr、BUN、NGAL、KIM-1)和炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)检测方法;caspase-3活性检测 阅读提示:Materials and Methods: Enzyme-linked immunosorbent assay, Caspase-3 activity assay. |
| 靶基因验证 | 双荧光素酶报告基因实验的细胞系、转染方法、荧光素酶活性检测时间;RIP实验的抗体和试剂盒 阅读提示:Materials and Methods: Dual-luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation assay. |
| 蛋白质表达检测 | 抗体稀释比例、孵育条件和检测试剂 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting. |
| 数据统计 | 统计软件、检验方法、显著性阈值 阅读提示:Materials and Methods: Statistical analysis. |