临床样本检测circ-FBXW12和miR-31-5p表达
评估circ-FBXW12和miR-31-5p在糖尿病肾病患者血清中的表达水平及其与疾病的关系
收集正常、DM和DN患者血清,通过RT-qPCR检测circ-FBXW12、miR-31-5p和LIN28B mRNA水平,并进行相关性分析
Circ-FBXW12 aggravates the development of diabetic nephropathy by binding to miR-31-5p to induce LIN28B.
研究包含体外细胞实验(高糖诱导HMCs)、临床血清样本检测,以及功能验证(敲低/过表达)和机制验证(双荧光素酶、RIP),但缺少动物模型验证。
人肾小球系膜细胞(HMCs) 糖尿病肾病患者血清样本
高糖(30 mM葡萄糖)处理HMCs circ-FBXW12敲低(si-circ-FBXW12)及miR-31-5p抑制/过表达、LIN28B过表达/敲低 CCK-8、EdU、流式细胞术、ELISA、Western blot、SOD/MDA检测 双荧光素酶报告实验和RIP实验验证靶向关系 临床样本分组:正常组、DM组、DN组(UAER和Scr标准)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估circ-FBXW12和miR-31-5p在糖尿病肾病患者血清中的表达水平及其与疾病的关系
收集正常、DM和DN患者血清,通过RT-qPCR检测circ-FBXW12、miR-31-5p和LIN28B mRNA水平,并进行相关性分析
验证高糖处理的HMCs中circ-FBXW12的表达变化
用30 mM葡萄糖处理HMCs,RT-qPCR检测circ-FBXW12表达;RNase R实验验证环状结构;亚细胞分离实验定位
探究circ-FBXW12敲低对HG诱导的HMCs增殖、炎症、细胞周期、ECM和氧化应激的影响
转染si-circ-FBXW12后,进行CCK-8、ELISA、流式、EdU、Western blot、SOD/MDA检测
验证circ-FBXW12是否作为miR-31-5p的海绵
利用circinteractome预测结合位点;双荧光素酶报告实验和RIP实验验证结合;检测miR-31-5p表达及调控关系
验证circ-FBXW12通过miR-31-5p发挥作用
在HG条件下共转染si-circ-FBXW12和anti-miR-31-5p,检测细胞功能及蛋白表达
验证LIN28B是否为miR-31-5p的直接靶基因
starBase预测靶基因;双荧光素酶报告实验和RIP实验验证;检测LIN28B表达及调控关系
探究LIN28B在HG诱导的HMCs中的作用
转染si-LIN28B后,检测细胞活力、炎症、细胞周期、增殖、ECM和氧化应激指标
验证miR-31-5p通过靶向LIN28B发挥抑制作用
在HG条件下转染miR-31-5p和LIN28B过表达载体,检测细胞功能及蛋白表达
验证circ-FBXW12通过miR-31-5p调控LIN28B表达
在HG条件下转染si-circ-FBXW12和anti-miR-31-5p,检测LIN28B mRNA和蛋白水平
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | -- |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | -- | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| All-in-One™ miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | GeneCopoeia | -- | |
| PrimeScript™ RT试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Premix DimerEraser | Takara | -- | |
| RNase R assay | RNase R | Epicentre | -- |
| 亚细胞分离 | PARIS试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab178013 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Abcam | ab181421 | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | Beyotime | -- |
| RNase A | Sigma-Aldrich | -- | |
| FACScan®流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| EdU assay | EdU掺入试剂盒 | RiboBio | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| CyclinD1抗体 | Abcam | ab226977 | |
| P21抗体 | Abcam | ab109520 | |
| Collagen I抗体 | Abcam | ab34710 | |
| Collagen IV抗体 | Abcam | ab6586 | |
| TGF-β1抗体 | Abcam | ab215715 | |
| LIN28B抗体 | Abcam | ab115698 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab37168 | |
| 二抗 | Abcam | ab205719 | |
| ECL试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 氧化应激检测 | SOD检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| MDA检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | psiCHECK-2质粒 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告实验试剂盒 | Promega | -- | |
| RIP实验 | IgG偶联磁珠 | Abcam | -- |
| Ago2偶联磁珠 | Abcam | -- | |
| 蛋白酶K | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者分组标准(正常、DM、DN)、UAER和Scr阈值、排除标准 阅读提示:Methods: Clinical sample acquisition |
| 细胞培养与高糖处理 | HMCs来源、培养基成分(DMEM+10% FBS+1% P/S)、葡萄糖浓度(5.5 mM对照,30 mM HG)、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000)、siRNA/mimic/inhibitor/质粒的序列或来源(GenePharma) 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 功能检测 | CCK-8孵育时间2小时,EdU孵育2小时,细胞周期固定条件(75%乙醇4°C 8小时),ELISA试剂盒编号,Western blot抗体信息 阅读提示:Methods: CCK-8 assay, EdU assay, Flow cytometry, ELISA, Western blot |
| 机制验证 | 双荧光素酶报告实验的质粒构建(WT/MUT)、共转染时间(48h),RIP实验的抗体(IgG/Ago2)及处理 阅读提示:Methods: Dual-luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation assay |