检测circ_0005567在IL-1β处理软骨细胞中的表达
明确circ_0005567是否参与IL-1β诱导的软骨细胞损伤。
用IL-1β(10 ng/mL)处理人原代软骨细胞24小时,通过qRT-PCR检测circ_0005567表达水平。
Hsa_circ_0005567 Activates Autophagy and Suppresses IL-1β-Induced Chondrocyte Apoptosis by Regulating miR-495.
包含细胞模型下的功能获得与缺失实验、自噬抑制实验、RNA pull-down和荧光素酶报告实验等机制验证,但缺乏动物模型或临床样本验证。
人原代软骨细胞 IL-1β诱导的软骨细胞损伤模型
人原代软骨细胞培养条件(Procell #CP-H107) IL-1β处理剂量为10 ng/mL,处理24小时 自噬抑制剂3-MA预处理浓度为10 mM 细胞转染试剂为Lipofectamine 3000,转染后48小时收集细胞 circ_0005567敲低序列为CCTTTTGTTGGCAATCTCT
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确circ_0005567是否参与IL-1β诱导的软骨细胞损伤。
用IL-1β(10 ng/mL)处理人原代软骨细胞24小时,通过qRT-PCR检测circ_0005567表达水平。
确定circ_0005567对软骨细胞凋亡的功能作用。
将circ_0005567过表达载体、空载体、si-circ_0005567或si-Ctrl转染至软骨细胞,在IL-1β存在下,通过流式细胞术检测凋亡率,通过Western blot检测凋亡相关蛋白(caspase-3、Bax、Bcl-2)水平。
验证circ_0005567是否通过诱导自噬抑制凋亡。
通过GFP-LC3免疫荧光和Western blot检测自噬标志物(LC3-II、Beclin-1),并使用自噬抑制剂3-MA处理,检验对circ_0005567过表达抗凋亡作用的影响。
阐明circ_0005567调控miR-495和ATG14的分子机制。
通过RNA pull-down检测circ_0005567与miR-495的直接结合;通过荧光素酶报告实验验证miR-495对ATG14 3'-UTR的直接靶向;通过qRT-PCR和Western blot检测miR-495模拟物/抑制剂对circ_0005567和ATG14表达的影响,以及circ_0005567过表达对miR-495模拟物抑制ATG14的逆转作用。
证实circ_0005567通过miR-495/ATG14轴发挥功能。
在IL-1β处理的软骨细胞中,共转染miR-495模拟物或si-ATG14与circ_0005567过表达载体,检测自噬(GFP-LC3斑点、LC3-II/LC3-I、Beclin-1)和凋亡(凋亡率、caspase-3、Bax、Bcl-2)水平,观察对circ_0005567过表达效应的抵消作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 人原代软骨细胞 | Procell | CP-H107 |
| 人软骨细胞完全培养基 | Procell | CM-H107 | |
| 药物处理 | 重组人IL-1β | 文中未明确说明 | -- |
| 3-甲基腺嘌呤 | 文中未明确说明 | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| FuGENE HD转染试剂 | Promega | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 流式分析 | FACScan流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | 文中未明确说明 | -- |
| 逆转录试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq | Takara | -- | |
| SYBR PrimeScript miRNA RT-PCR试剂盒 | Takara | -- | |
| Western blot | Beclin-1抗体 | Abcam | ab62557 |
| LC3B抗体 | Abcam | ab48394 | |
| ATG14抗体 | Cell Signaling Technology | 5504 | |
| Caspase-3抗体 | Abcam | ab32351 | |
| Bax抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7480 | |
| Bcl-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7382 | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 人原代软骨细胞来源(Procell #CP-H107)和培养基(#CM-H107);IL-1β浓度10 ng/mL处理24小时;3-MA浓度10 mM预处理 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture |
| 细胞转染 | 转染试剂Lipofectamine 3000和FuGENE HD;转染后收集时间48小时;siRNA序列(si-circ_0005567、si-ATG14、si-Ctrl) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Transfection |
| 自噬检测 | GFP-LC3质粒转染;检测LC3斑点计数(至少30个细胞);Western blot检测LC3-II/LC3-I和Beclin-1 阅读提示:Materials and Methods: GFP-LC3 Fluorescence; Results: Circ_0005567 Overexpression Attenuated...; Figure legends 2 and 5 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色;流式细胞仪型号FACScan;凋亡率计算为四次分析的平均值 阅读提示:Materials and Methods: Cell Apoptosis Assay |
| 机制验证 | RNA pull-down实验中生物素标记探针和链霉亲和素磁珠;荧光素酶报告实验中pmirGLO-ATG14野生型/突变型质粒和miR-495模拟物浓度10 nM 阅读提示:Materials and Methods: RNA Pull-Down Assay, Luciferase Reporter Assay |
| 统计分析 | 统计方法(t检验和单因素方差分析);显著性水平P < 0.05 阅读提示:Materials and Methods: Statistical Analysis |