建立细菌感染模型
验证spvC基因对宿主细胞自噬和炎症小体表达的影响
将巨噬细胞J774A.1和上皮HeLa细胞与鼠伤寒沙门氏菌野生型(STM-WT)、spvC缺失株(STM-ΔspvC)、定点突变株(STM-ΔspvC/pspvC K136A)或回补株(STM-ΔspvC/pspvC)共培养,建立感染模型。
Salmonella spvC Gene Inhibits Autophagy of Host Cells and Suppresses NLRP3 as Well as NLRC4.
包含体外细胞感染模型(巨噬细胞J774A.1和上皮HeLa细胞),利用基因缺失、定点突变和回补菌株进行功能验证,并通过Western blot和共聚焦显微镜检测自噬标志物及NLRP3/NLRC4表达,使用抑制剂进行机制验证。
鼠伤寒沙门氏菌野生型及突变株感染的巨噬细胞J774A.1 鼠伤寒沙门氏菌野生型及突变株感染的上皮HeLa细胞
感染复数(MOI):J774A.1细胞为10,HeLa细胞为100(图3C) 感染时间点:2 hpi(自噬相关检测),8 hpi(NLRP3/NLRC4检测) 菌株:STM-WT、STM-ΔspvC、STM-ΔspvC/pspvC K136A(定点突变株)、STM-ΔspvC/pspvC(回补株) 自噬抑制:Bafilomycin A1(100 nM)预处理2小时 ERK抑制:PD0325901(50 nM)预处理24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证spvC基因对宿主细胞自噬和炎症小体表达的影响
将巨噬细胞J774A.1和上皮HeLa细胞与鼠伤寒沙门氏菌野生型(STM-WT)、spvC缺失株(STM-ΔspvC)、定点突变株(STM-ΔspvC/pspvC K136A)或回补株(STM-ΔspvC/pspvC)共培养,建立感染模型。
评估spvC对自噬标志物LC3-II和Beclin 1水平的影响
Western blot分析J774A.1细胞中LC3-II和Beclin 1的表达水平。
观察spvC对自噬体形成和自噬流的影响
HeLa细胞转染mRFP-GFP-LC3质粒,感染后2 hpi通过共聚焦显微镜观察自噬体(黄色点)和自溶酶体(红色点)的数量。
确定SpvC的磷酸苏氨酸裂解酶活性对自噬抑制是否必需
比较STM-WT、STM-ΔspvC、STM-ΔspvC/pspvC K136A和STM-ΔspvC/pspvC感染J774A.1细胞后LC3-II和Beclin 1的表达。
探究SpvC通过ERK通路抑制自噬的机制
HeLa细胞以ERK抑制剂PD0325901预处理后感染,检测LC3-II和Beclin 1的表达。
评估spvC对NLRP3和NLRC4蛋白水平的影响及其与自噬的关系
J774A.1细胞感染后不同时间点收集,Western blot检测NLRP3和NLRC4表达;使用Bafilomycin A1预处理以抑制自噬,观察对NLRP3和NLRC4表达的影响。
评估spvC对巨噬细胞内细菌存活的影响
通过菌落形成单位(CFU)计数测定J774A.1细胞内的细菌载量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | LB肉汤 | Hangwei | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone Laboratories | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 细菌感染 | L-阿拉伯糖 | Sigma | -- |
| 阿米卡星 | Sigma | -- | |
| PD0325901 | Selleck | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | Sigma | -- | |
| 蛋白质提取和检测 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 脱脂奶粉 | Sangon Biotech Shanghai Co.,Ltd. | -- | |
| 抗LC3抗体 | CST | 4108S | |
| 抗Beclin 1抗体 | CST | 3738 | |
| 抗NLRP3抗体 | CST | 15101S | |
| 抗NLRC4抗体 | abcam | ab201792 | |
| 抗GAPDH抗体 | Boster | BA2913 | |
| 抗Tubulin抗体 | Beyotime | AF1216 | |
| 抗Histone H3抗体 | abcam | ab194681 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Beyotime | A0208 | |
| ECL发光试剂 | Meilunbio | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Hoechst 33258 | Beyotime | 33258 |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌感染 | MOI:J774A.1为10,HeLa为100;感染时间:2 hpi(自噬),8 hpi(NLRP3/NLRC4);菌株类型及培养条件(STM-WT、STM-ΔspvC、STM-ΔspvC/pspvC K136A、STM-ΔspvC/pspvC,后者添加0.2% L-阿拉伯糖) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Bacterial Infection' 部分及图1-4图注 |
| 自噬检测 | LC3-II和Beclin 1蛋白水平;感染后时间点(1, 2, 4, 8, 16, 24 hpi);Bafilomycin A1处理(100 nM, 2 h);PD0325901处理(50 nM, 24 h) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Bacterial Infection' 和 'Western Blot Analysis' 部分 |
| 自噬流观察 | HeLa细胞转染mRFP-GFP-LC3质粒;MOI;感染后2 hpi;共聚焦显微镜观察黄色和红色点状结构;统计细胞数 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Confocal Laser Scanning Microscopy' 部分 |
| 炎症小体表达检测 | NLRP3和NLRC4蛋白水平;感染后2, 4, 8 hpi;Bafilomycin A1处理 阅读提示:Results 中 'spvC Down-Regulates NLRP3 and NLRC4' 部分及图4图注 |
| 胞内细菌存活 | J774A.1细胞感染后2 hpi和6 hpi的CFU计数 阅读提示:Results 中 'spvC Suppresses Autophagy' 部分及图1C图注 |