建立肠道IR模型和细胞H/R模型
模拟肠道缺血再灌注损伤,为评估鸢尾素的作用提供实验平台。
在小鼠中通过夹闭肠系膜上动脉60分钟并再灌注建立肠道IR模型;在Caco-2细胞中通过低氧(94% N2, 5% CO2, 1% O2)90分钟再复氧建立H/R模型。
Irisin reverses intestinal epithelial barrier dysfunction during intestinal injury via binding to the integrin αVβ5 receptor.
包含体内小鼠肠IR模型和体外Caco-2细胞H/R模型两个独立证据层级,并通过中和抗体、抑制剂和siRNA进行功能与机制验证。
C57BL/6J小鼠肠缺血再灌注模型 Caco-2细胞缺氧/复氧模型
鸢尾素给药剂量:250 μg/kg(小鼠,静脉注射)或10 nmol/L(Caco-2细胞) 整合素αVβ5抑制剂西仑吉肽三氟乙酸盐用量:20 mg/kg(小鼠)或20 μmol/L(Caco-2细胞) UCP2抑制剂京尼平用量:20 mg/kg(小鼠)或20 μmol/L(Caco-2细胞) AMPK siRNA敲低验证AMPK在鸢尾素保护中的作用 肠道IR模型:SMA夹闭60分钟,再灌注4小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟肠道缺血再灌注损伤,为评估鸢尾素的作用提供实验平台。
在小鼠中通过夹闭肠系膜上动脉60分钟并再灌注建立肠道IR模型;在Caco-2细胞中通过低氧(94% N2, 5% CO2, 1% O2)90分钟再复氧建立H/R模型。
验证鸢尾素是否能减轻肠道IR引起的屏障功能障碍。
通过组织学评分、肠道水含量、血清FITC- dextran渗漏、肠系膜淋巴结和肺细菌易位、血清LDH和乳酸水平、紧密连接蛋白表达等指标评估屏障功能。
探究鸢尾素对IR/H/R诱导的应激反应的影响。
检测肠道和细胞中ROS水平(DHE染色)、MDA、XO、4-HNT、SOD、GSH-Px水平,以及Ca2+荧光染色和ER应激蛋白IRE1、CHOP表达。
验证鸢尾素是否通过保护线粒体功能减少肠细胞凋亡。
通过MitoTracker Red染色、ATP测定、mtDNA拷贝数、TUNEL染色和流式细胞术检测凋亡。
确认鸢尾素是否通过结合整合素αVβ5发挥保护作用。
通过免疫荧光共定位和免疫共沉淀检测鸢尾素与整合素αVβ5的结合,并使用整合素抑制剂西仑吉肽验证其必要性。
确定鸢尾素保护作用的下游机制。
通过Western blot检测AMPK和UCP2表达,使用AMPK siRNA和UCP2抑制剂京尼平验证通路参与。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 药物处理 | 鸢尾素 | Phoenix Pharmaceuticals, Inc | 067-29A |
| 京尼平 | Selleck | S2412 | |
| 细胞培养 | MEM培养基 | Gibco | A1049001 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 青霉素/链霉素混合液 | Gibco | 15070063 | |
| ELISA | 鸢尾素ELISA试剂盒 | Phoenix Pharmaceuticals, Inc | EK-067-29 |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | BMS607-3 | |
| CIRP ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-EL005440MO | |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A003-1 |
| XO检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A002-1-1 | |
| 4-HNT检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | H268 | |
| SOD检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A001-3 | |
| GSH-PX检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A005 | |
| Western blot | 抗鸢尾素抗体 | Abcam | ab174833 |
| 抗claudin-1抗体 | Proteintech | 13050-1-AP | |
| 抗occludin抗体 | Abcam | ab216327 | |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗UCP2抗体 | Abcam | ab203244 | |
| 抗UCP1抗体 | Cell Signaling Technology | 14670S | |
| 抗IRE1抗体 | Abcam | ab37073 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 5554 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | HRP-60008 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G PLUS-琼脂糖 | Santa | sc-2003 |
| 小鼠抗整合素αV/β5抗体 | Santa | sc-81632 | |
| 兔抗整合素αV抗体 | Abcam | ab179475 | |
| 兔抗整合素β5抗体 | Abcam | ab15459 | |
| Rac1活性检测 | Rac1激活检测组合试剂盒 | Cell Biolabs | STA-405 |
| 免疫荧光 | 兔抗鸢尾素抗体 | Novus | NBP2-59680 |
| 兔抗JAM-A抗体 | Abcam | ab180821 | |
| 兔抗ZO-1抗体 | Abcam | ab96587 | |
| TER测量 | 细胞-基质电阻抗传感系统 | Applied Biophysics | -- |
| Transwell渗透实验 | Transwell小室 | Corning | 3413 |
| TUNEL染色 | TUNEL试剂盒 | Roche | 11684795910 |
| 线粒体染色 | MitoTracker Red CMXRos染料 | Thermo Fisher Scientific | M7512 |
| ROS检测 | 二氢乙锭 | Sigma-Aldrich | D7008 |
| 钙离子检测 | Fluo-4 AM | Beyotime | S1060 |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Dojindo Laboratories | AD10 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0026 |
| LDH检测 | LDH检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A020-2 |
| 荧光检测 | Varioskan LUX多功能酶标仪 | Thermo Scientific | -- |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜 TCS SP8 STED 3X | Leica | -- |
| 化学发光检测 | 化学发光成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 图像分析 | ImageJ2x软件 | -- | -- |
| 统计分析 | SPSS 18.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、体重、性别;SMA夹闭时间;再灌注时间;麻醉剂 阅读提示:见Methods 2.1和2.2,图注 |
| 药物处理 | 鸢尾素给药剂量、途径、时间;抗鸢尾素抗体剂量、时间;西仑吉肽剂量;京尼平剂量 阅读提示:见Methods 2.2,图注 |
| 细胞模型 | 细胞系;培养基、血清、抗生素;低氧条件(O2浓度、N2/CO2比例);低氧时间;复氧时间;鸢尾素浓度;西仑吉肽浓度;京尼平浓度 阅读提示:见Methods 2.3,图注 |
| 基因敲低 | siRNA序列;转染方法(具体转染试剂未明确说明);siRNA浓度(未明确) 阅读提示:见Methods 2.4 |
| 肠道通透性评估 | FITC- dextran浓度、灌胃体积、检测时间;FITC-白蛋白浓度;Transwell孔径;TER测量系统 阅读提示:见Methods 2.7和2.16,图2 |
| 机制验证 | AMPK phosphorylation位点;UCP2表达检测;CO-IP实验条件和抗体;Rac1活性检测 阅读提示:见Methods 2.11-2.13,图5-6 |