芯片设计与功能表征
验证DS-Chip的药物梯度生成和单细胞捕获能力。
设计并制作了包含药物梯度发生器和并行细胞捕获器的微流控芯片;通过FITC荧光验证梯度生成;通过不同流速和细胞密度注入MCF-7细胞评估捕获效率。
Phenotype-related drug sensitivity analysis of single CTCs for medicine evaluation.
包含器件表征(FITC梯度、捕获率)、细胞系验证(EMT与药效关系、CCK-8)、芯片上单细胞药物敏感性分析及患者CTC样本验证等多个独立证据层级。
MCF-7细胞系 MDA-MB-231细胞系 PANC-1细胞系 患者来源的循环肿瘤细胞(CTCs)
微流控芯片的尺寸和结构设计(Fig. S1) 细胞捕获流速(最佳40 μL/min)和细胞密度(1×10^4 cells/mL) TGF-β浓度梯度(0, 5, 20 ng/mL)诱导EMT 姜黄素浓度梯度(0-50 μM)和DOX浓度梯度(0-2 μM) 患者CTC的KRAS基因突变分析(Sanger测序)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DS-Chip的药物梯度生成和单细胞捕获能力。
设计并制作了包含药物梯度发生器和并行细胞捕获器的微流控芯片;通过FITC荧光验证梯度生成;通过不同流速和细胞密度注入MCF-7细胞评估捕获效率。
评估EMT程度对肿瘤细胞药物敏感性的影响。
使用MCF-7和PANC-1细胞,通过TGF-β诱导EMT,检测EMT标志物(EpCAM、N-cadherin)和凋亡(annexin V),并用CCK-8检测增殖。
在单细胞水平研究EMT梯度对药物敏感性的影响。
将MCF-7细胞捕获在DS-Chip中,通过梯度生成器形成不同浓度TGF-β预处理,再以相同浓度姜黄素刺激,进行三色荧光成像分析。
基于EMT表型,确定单细胞的最佳药物反应剂量。
在芯片上捕获MCF-7细胞,先用TGF-β诱导EMT,再建立姜黄素或DOX的浓度梯度,通过荧光成像分析凋亡程度确定最佳剂量。
验证方法在临床样本中的实用性,确定个体患者的药物反应剂量。
从5名癌症患者(胃癌、结肠癌、肝癌)分离CTCs,通过KRAS突变确认肿瘤来源,注入DS-Chip进行不同浓度姜黄素刺激,荧光分析EMT和凋亡,确定最佳剂量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 芯片表征 | 药物敏感性微流控芯片 | -- | -- |
| 荧光成像 | TAMRA标记的EpCAM抗体 | -- | -- |
| Alexa 647标记的N-cadherin抗体 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | -- | -- |
| 药物处理 | 姜黄素 | -- | 458-37-7 |
| 阿霉素 | -- | 23214-92-8 | |
| 细胞处理 | 转化生长因子-β | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 芯片制造与操作 | 芯片通道尺寸(Fig. S1)、流速(40 μL/min)、细胞密度(1×10^4 cells/mL) 阅读提示:Results第一、二部分及Fig. S1、Fig. 2 |
| 细胞培养和处理 | 细胞系(MCF-7、PANC-1)、TGF-β浓度(0、5、20 ng/mL)、处理时间(3天)、姜黄素浓度(0-50 μM) 阅读提示:Results第三、四部分及Fig. 3、图注 |
| 单细胞药物敏感性分析 | 芯片上TGF-β梯度生成条件、姜黄素浓度(20 μM)、DOX浓度(2 μM) 阅读提示:Results第四、五部分及Fig. 4、Fig. 5、Fig. S5 |
| 患者样本分析 | CTC分离方法(参考文献26)、患者类型和数量(n=5)、KRAS突变确认、芯片上姜黄素浓度梯度设置 阅读提示:Results第六部分及Table S1、Fig. 6、Fig. S6、Fig. S7 |