评估花旗松素的细胞毒性
确定花旗松素对RAW264.7细胞活力的影响,并筛选用于后续实验的无毒浓度范围。
使用MTS法检测不同浓度花旗松素(20、40、80 μmol/L)处理24小时后的细胞活力,DMSO作为对照;同时检测LPS和花旗松素联合处理后的细胞活力。
Taxifolin attenuates inflammation via suppressing MAPK signal pathway in vitro and in silico analysis.
包含体外细胞实验(细胞活力、ROS、ELISA、qRT-PCR、Western blot)以及分子对接模拟,并涉及功能验证(MAPK抑制剂)和机制验证(磷酸化水平检测),但缺乏体内模型或患者样本等独立证据层级。
RAW264.7巨噬细胞系(小鼠) LPS诱导的RAW264.7细胞炎症模型 MAPK蛋白晶体结构(ERK、JNK、p38α)
细胞模型:RAW264.7细胞,培养于含10% FBS的DMEM,37°C、5% CO2 LPS处理浓度200 ng/mL,处理24小时 花旗松素浓度:20、40、80 μmol/L MAPK抑制剂:U0126(2 μmol/L,9小时)、SB203580(25 μmol/L,4小时)、SP600125(10 μmol/L,4小时) 检测指标:细胞活力(MTS)、ROS、NO、IL-1β、IL-6、iNOS、VEGF、COX-2、TNF-α及MAPK磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定花旗松素对RAW264.7细胞活力的影响,并筛选用于后续实验的无毒浓度范围。
使用MTS法检测不同浓度花旗松素(20、40、80 μmol/L)处理24小时后的细胞活力,DMSO作为对照;同时检测LPS和花旗松素联合处理后的细胞活力。
验证花旗松素对LPS诱导的炎症因子表达和细胞内ROS产生的影响。
使用ELISA检测细胞上清中IL-1β、IL-6、VEGF、TNF-α、COX-2的浓度;使用荧光探针检测细胞内ROS;使用Griess法检测NO释放。
评估花旗松素对炎症相关基因mRNA和蛋白表达的影响。
通过qRT-PCR检测TLR4、MyD88、IL-1β、IL-6、iNOS、VEGF、COX-2、TNF-α的mRNA水平;通过Western blot检测MAPK信号通路(ERK、JNK、p38)的总蛋白和磷酸化蛋白水平。
通过计算机模拟预测花旗松素与MAPK蛋白(ERK、JNK、p38α)的结合模式。
从PDB获取晶体结构,使用Schrödinger Maestro软件进行蛋白准备和配体准备,进行标准对接(SP),分析结合能、氢键等参数。
通过特异性抑制剂阻断MAPK通路,观察炎症因子表达变化,以验证花旗松素是否通过该通路发挥抗炎作用。
使用U0126、SP600125、SB203580预处理细胞,然后LPS刺激,检测iNOS、VEGF、COX-2、TNF-α的mRNA水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 青霉素-链霉素混合液 | Gibco Life Technologies | -- | |
| 脂多糖 | Solarbio Science Technology Co., Ltd. | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Solarbio Science Technology Co., Ltd. | -- | |
| RAW264.7细胞 | Procell Life Science Technology Co., Ltd. | CL-0190 | |
| 药物处理 | 花旗松素 | -- | -- |
| 地塞米松 | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd | -- | |
| U0126(ERK抑制剂) | MCE | -- | |
| SP600125(JNK抑制剂) | MCE | -- | |
| SB203580(p38抑制剂) | MCE | -- | |
| 细胞活力分析 | MTS检测试剂盒 | Bio Vision | -- |
| 酶标仪(SpectraMax M5) | -- | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | -- |
| NO检测 | Griess试剂 | Beyotime | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Westang Bio-Tech Co., Ltd | -- |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录试剂盒 | Roche | -- | |
| SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗 | affinity | S0002 | |
| ECL发光液 | Beyotime | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | affinity | AB_2839420 | |
| ERK抗体 | GeneTex | GTX17942 | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | GeneTex | GTX24819 | |
| JNK抗体 | GeneTex | GTX52360 | |
| 磷酸化JNK抗体 | abcam | ab124956 | |
| p38抗体 | GeneTex | GTX110720 | |
| 磷酸化p38抗体 | GeneTex | GTX133460 | |
| FluorChem R成像系统 | ProteinSimple | -- | |
| 分子对接 | Schrödinger Maestro软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系:RAW264.7(Cat No. CL-0190);培养基:DMEM+10% FBS+100 U/mL青霉素+100 μg/mL链霉素;培养条件:37°C、5% CO2;处理前细胞接种密度:6孔板4×10^5、24孔板1×10^5、96孔板5×10^4细胞/孔;花旗松素浓度:20、40、80 μmol/L;LPS浓度:200 ng/mL;处理时间:24小时;DXMS浓度:5 μmol/L;抑制剂浓度及时间:U0126(2 μmol/L,9小时)、SP600125(10 μmol/L,4小时)、SB203580(25 μmol/L,4小时)。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.2 Cell culture and treatment |
| 细胞活力检测 | 使用MTS试剂盒,每孔加20 μL MTS试剂,37°C孵育3小时,490 nm读取吸光度;每个浓度设置6个复孔;计算相对细胞活力公式(1)。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.3 Cell viability analysis |
| ROS检测 | 使用DCFH-DA荧光探针,孵育20分钟(37°C),激发/发射波长488/525 nm;以未处理细胞作为默认值1;Rosup为阳性对照。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.4 Detection of intracellular ROS |
| NO释放检测 | 使用Griess反应,每孔50 μL上清,加入等量Griess Ⅰ和Ⅱ试剂,室温避光孵育10分钟,540 nm读取吸光度;用NaNO2标准液校正。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.5 NO release assay |
| ELISA检测 | 使用ELISA试剂盒检测IL-1β、IL-6、TNF-α、COX-2、VEGF,450 nm读取吸光度。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.6 Quantitative sandwich enzyme immunoassay (ELISA) |
| qRT-PCR | 使用TRIzol提取RNA,逆转录2 μg RNA,SYBR Green扩增;引物序列见表1;反应条件:95°C 2分钟,40个循环(95°C 15秒,60°C 1分钟);以β-actin为内参,采用2−ΔΔCt法计算相对表达量。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.7 Reverse transcription and quantitative real-time PCR 及表1 |
| Western blot | 蛋白提取后经8%-15% SDS-PAGE分离,转至PVDF膜;一抗4°C孵育过夜,二抗室温孵育2小时;ECL显色,使用FluorChem R成像系统检测;抗体稀释度详见正文2.8。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.8 Western blot analysis |
| 分子对接 | 蛋白晶体结构:ERK(2OJG)、JNK(2P33)、p38α(2BAL)来自PDB;配体(花旗松素、19A、J07、PQA)来自PubChem;使用Schrödinger Maestro软件进行蛋白准备和配体准备;对接采用Glide SP模式,基于对接分数和结合能筛选构象。 阅读提示:参见Materials and methods部分2.9 Molecular docking simulation study |