细胞鉴定
验证培养细胞为视神经乳头星形胶质细胞,确保后续实验的细胞类型正确。
使用免疫组化染色检测GFAP、vimentin、CX43、AQP4、OSP和F4/80的表达,阳性细胞占比超过95%,确认细胞为星形胶质细胞。
Mechanobiological responses of astrocytes in optic nerve head due to biaxial stretch.
包含体外细胞拉伸模型、免疫组化鉴定、细胞功能检测、iTRAQ蛋白质组学、Western blot验证及GEO数据库交叉验证等多层级证据。
大鼠视神经乳头星形胶质细胞(原代培养) 双轴拉伸体外模型
拉伸幅度:10%和17%,频率1 Hz,持续24小时 细胞分组:10%拉伸组、17%拉伸组和对照组,每组3个生物学重复 血清剥夺:拉伸前24小时 细胞鉴定:GFAP、vimentin、CX43阳性,AQP4、OSP、F4/80阴性 差异蛋白筛选标准:Fold change > 1.2且P < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证培养细胞为视神经乳头星形胶质细胞,确保后续实验的细胞类型正确。
使用免疫组化染色检测GFAP、vimentin、CX43、AQP4、OSP和F4/80的表达,阳性细胞占比超过95%,确认细胞为星形胶质细胞。
模拟青光眼眼压升高引起的双轴机械应变,观察星形胶质细胞的力学响应。
将第四代细胞接种于Flexcell六孔板,分为对照组、10%拉伸组和17%拉伸组。所有细胞血清剥夺24小时后,使用Flexcell FX-5000 T系统进行双轴循环拉伸(1 Hz,0-10%或0-17%)24小时。
观察拉伸后星形胶质细胞肌动蛋白细胞骨架的排列变化。
用4%多聚甲醛固定、Triton X-100透化,Alexa Fluor 568 Phalloidin染色,DAPI染核,荧光显微镜观察。
检测拉伸对星形胶质细胞凋亡率的影响。
使用Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒,通过流式细胞术分析凋亡率。
检测拉伸对星形胶质细胞增殖率的影响。
使用EdU增殖检测试剂盒,荧光显微镜成像,ImageJ计数EdU阳性细胞和DAPI阳性细胞。
全面鉴定机械拉伸后星形胶质细胞中差异表达的蛋白质和信号通路。
细胞裂解提取蛋白,iTRAQ标记后进行LC-MS/MS分析,使用IQuant软件进行蛋白鉴定和相对定量,筛选差异蛋白。
验证iTRAQ筛选出的关键蛋白表达变化。
对LRP6、THBS1、CD81和GFAP进行Western blot分析,结果与iTRAQ一致。
利用公共数据库基因芯片数据验证蛋白质组学结果,增强结论可靠性。
从GEO数据库获取小鼠眼压升高下星形胶质细胞基因芯片数据(GSE40009),筛选差异基因并与质谱结果比较,发现ANTXR2和CARD10共同差异表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Hyclone | -- | |
| 细胞鉴定 | GFAP抗体 | Abcam | -- |
| 波形蛋白抗体 | CST | -- | |
| 连接蛋白43抗体 | Abcam | -- | |
| 水通道蛋白4抗体 | Abcam | -- | |
| OSP抗体 | Bioss | -- | |
| F4/80抗体 | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | -- | |
| 细胞骨架染色 | Alexa Fluor 568标记鬼笔环肽 | CST | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Beyotime | P04D01 |
| 细胞增殖检测 | EdU增殖检测试剂盒 | Ribobio | C10310 |
| 蛋白质组学 | Q-Exactive HF X质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 岛津LC-20AB液相系统 | Shimadzu | -- | |
| Thermo UltiMate 3000超高效液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白分析试剂盒 | BOSTER | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| LRP6抗体 | Abcam | -- | |
| THBS1抗体 | Abcam | -- | |
| CD81抗体 | BOSTER | -- | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | BOSTER | -- | |
| 成像分析 | 化学发光成像分析仪 | BIO-RAD | -- |
| 荧光显微镜 | Axio Observer D1荧光显微镜 | Zeiss | -- |
| 流式细胞术 | ACEA NovoCyte 3130流式细胞仪 | ACEA Biosciences Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞来源:大鼠视神经乳头星形胶质细胞(Procell Life Science & Technology Co);培养条件:DMEM/F12培养基(GIBCO)含10% FBS、1%青霉素/链霉素(Hyclone);37°C,5% CO2;细胞传代至第四代用于实验。 阅读提示:参见Materials and methods中的Cell lines部分 |
| 机械拉伸 | 拉伸装置:Flexcell FX-5000 T系统;拉伸板:6孔Flexcell板(#bf-3001c);拉伸参数:10%和17%应变,1 Hz,24小时;血清剥夺:拉伸前24小时;对照组同样培养但不拉伸。 阅读提示:参见Materials and methods中的Mechanical stretch部分 |
| 细胞表型检测 | 细胞骨架染色:固定(4%多聚甲醛)、透化(0.5% Triton X-100)、染色(Alexa Fluor 568 Phalloidin,1:200,30分钟);凋亡检测:Annexin V-FITC/PI染色,流式细胞术;增殖检测:EdU孵育24小时,DAPI染色,计数阳性细胞。 阅读提示:参见Materials and methods中的Cytoskeleton staining、Cell apoptosis、Cell proliferation部分 |
| 蛋白质组学 | 蛋白提取、iTRAQ标记、LC-MS/MS分析;筛选标准:Fold change > 1.2且P < 0.05;样品分组:10% vs 对照,17% vs 对照,17% vs 10%。 阅读提示:参见Materials and methods中的LC-MS/MS、Data processing and analysis部分 |
| Western blot验证 | 抗体:GFAP (1:1000, BOSTER), LRP6 (1:1000, Abcam), THBS1 (1:1000, Abcam), CD81 (1:1400, BOSTER);二抗:HRP标记山羊抗兔IgG (1:5000, BOSTER);转膜:0.45μm NC膜,150 mA,60分钟。 阅读提示:参见Materials and methods中的Analysis quantitative western blot部分 |