细胞增殖与迁移检测
评估Lar对结肠癌细胞活力和迁移能力的影响。
使用CCK-8法测定不同浓度Lar处理24小时后的细胞活力,计算IC50;采用Transwell实验评估细胞迁移能力。
Larotrectinib induces autophagic cell death through AMPK/mTOR signalling in colon cancer.
体外细胞实验(功能、自噬、机制)与体内小鼠模型相互验证,包含siRNA敲低和自噬抑制剂干预。
COLO205结肠癌细胞系 HCT116结肠癌细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
Lar浓度:300 nM用于体外实验 CQ浓度:20 μM,预处理2小时 siAMPK转染:20 nM,作用48小时 动物模型:HCT116细胞皮下注射,Lar剂量20 mg/kg,每日两次灌胃,持续3周 统计学:n=3(体外),n=5(体内),p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Lar对结肠癌细胞活力和迁移能力的影响。
使用CCK-8法测定不同浓度Lar处理24小时后的细胞活力,计算IC50;采用Transwell实验评估细胞迁移能力。
检测Lar对结肠癌细胞EMT过程的影响。
RT-PCR和Western blot检测E-cad、vimentin和MMP2/9的表达变化。
评估Lar是否诱导自噬流及自噬性细胞死亡。
使用mCherry-GFP-LC3荧光标记和Western blot检测LC3和p62;并用CQ抑制自噬流以验证。
验证Lar是否通过AMPK/mTOR通路激活自噬。
Western blot检测AMPK和mTOR磷酸化;siRNA沉默AMPK后观察对自噬和EMT的影响。
验证Lar在体内对结肠癌移植瘤生长的抑制作用。
将HCT116细胞皮下接种裸鼠,给予Lar治疗,测量肿瘤体积和重量,并检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 结肠黏膜上皮细胞完全培养基 | Procell | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | 北京索莱宝科技有限公司 | -- |
| 药物处理 | 拉罗替尼 | Stelleck | LOXO-101 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 结晶紫 | 北京索莱宝科技有限公司 | -- | |
| Western blot | 总蛋白提取试剂盒 | 北京索莱宝科技有限公司 | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | P8340 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- | |
| PVDF膜 | Pierce | -- | |
| 脱脂奶粉 | 北京索莱宝科技有限公司 | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | 北京中杉金桥生物技术有限公司 | ZB-2301 | |
| 增强化学发光检测 | EMD Millipore | -- | |
| RT-PCR | SuperScript IV一步法RT-PCR系统 | ThermoFisher | 12594100 |
| LC3 puncta | GFP-mCherry-LC3腺病毒 | 汉恒生物技术有限公司 | -- |
| GFP-LC3腺病毒 | 汉恒生物技术有限公司 | -- | |
| 自噬诱导对照 | BIX-01294 | MCE | HY-10587 |
| 透射电镜 | 鞣酸 | Sigma | 403040 |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| Spurr低粘度包埋剂 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| Reichert Ultracut S超薄切片机 | Science Service | -- | |
| EM 10 CR电子显微镜 | Carl Zeiss Gemini | -- | |
| 转染 | HiPerFect转染试剂 | Qiagen | -- |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG/FITC | 北京索莱宝科技有限公司 | SF134 |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Western blot | p-AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2537 |
| AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| p-mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 5536 | |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| p62抗体 | Cell Signaling Technology | 39749 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 | |
| 波形蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5741 | |
| MMP2抗体 | Cell Signaling Technology | 40994 | |
| MMP9抗体 | Cell Signaling Technology | 13667 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞密度(3×10^3/孔)、Lar处理浓度范围和时间(24小时)、CCK-8孵育时间(1小时) 阅读提示:参见Methods 4.2 Cell viability assay |
| Transwell实验 | 细胞数量(200μl无血清培养基)、Lar浓度(300 nM)和处理时间(24小时)、迁移时间(48小时)、染色方法 阅读提示:参见Methods 4.3 Transwell assay |
| Western blot | 蛋白上样量(20 μg/lane)、抗体稀释比例、GAPDH归一化 阅读提示:参见Methods 4.4 Western blot |
| 自噬流检测 | Lar处理浓度(300 nM)和时间(24小时)、CQ浓度(20 μM)和预处理时间(2小时)、腺病毒转染时间(24小时) 阅读提示:参见Methods 4.6 LC3 puncta assay和结果部分2.3 |
| siRNA敲降 | siRNA浓度(20 nM)、转染时间(48小时)、转染试剂用量(12 μl HiPerFect) 阅读提示:参见Methods 4.9 Transient transfection |
| 动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、细胞注射量(1×10^6)、Lar剂量(20 mg/kg)和给药方式(灌胃,每日两次)、治疗持续时间(3周)、肿瘤体积计算公式 阅读提示:参见Methods 4.11 In vivo assay |