MI小鼠模型建立与基因表达检测
评估MI小鼠心肌组织中NEAT1、miR-582-5p和F2RL2的表达情况。
通过LAD结扎建立MI小鼠模型,取心肌组织用qRT-PCR检测NEAT1、miR-582-5p和F2RL2的表达。
lncRNA NEAT1 Downregulation Ameliorates the Myocardial Infarction of Mice by Regulating the miR-582-5p/F2RL2 Axis.
包含体内MI小鼠模型和体外OGD诱导HCMs模型,并通过功能获得/缺失实验、双荧光素酶报告基因、qRT-PCR、Western blot及组织学染色等多层级验证。
MI小鼠模型(C57BL/6小鼠,LAD结扎) OGD诱导的人心肌细胞(HCMs)
MI模型建立:C57BL/6小鼠,LAD结扎,sham组仅开胸不结扎,术后24h超声评估EF,EF<20%或>50%排除 F2RL2敲低:LV注射shF2RL2慢病毒,2周后检测EF、FS、梗死面积和凋亡 OGD诱导:HCMs在无糖DMEM+10%FBS中,93% N2/2% O2/5% CO2培养24h 转染:shF2RL2、shlncNEAT1、shNC、miR-582-5p mimic/inhibitor及对照,Lipofect转染48h 靶向验证:双荧光素酶报告基因,NEAT1-WT/MUT与miR-582-5p,F2RL2-WT/MUT与miR-582-5p
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MI小鼠心肌组织中NEAT1、miR-582-5p和F2RL2的表达情况。
通过LAD结扎建立MI小鼠模型,取心肌组织用qRT-PCR检测NEAT1、miR-582-5p和F2RL2的表达。
验证F2RL2下调是否改善MI小鼠的心功能、梗死面积和细胞凋亡。
MI小鼠尾静脉注射shF2RL2慢病毒,2周后通过超声心动图检测EF和FS,TTC/Evans blue染色检测梗死面积,HE染色观察病理变化,TUNEL染色检测细胞凋亡。
验证OGD诱导的HCMs中F2RL2表达变化,并建立F2RL2敲低细胞模型。
HCMs进行OGD处理,qRT-PCR和Western blot检测F2RL2表达;转染shF2RL2后检测敲低效果。
验证F2RL2下调对OGD诱导的HCMs细胞活力、增殖和凋亡的影响。
转染shF2RL2并进行OGD处理后,CCK-8检测细胞活力,EdU染色检测增殖,流式细胞术检测凋亡。
验证miR-582-5p与F2RL2以及NEAT1与miR-582-5p的结合关系。
通过StarBase预测结合位点,双荧光素酶报告基因实验验证NEAT1-WT/MUT和F2RL2-WT/MUT与miR-582-5p的相互作用。
验证NEAT1沉默和miR-582-5p抑制剂对OGD-induced HCMs功能的影响及相互调节。
转染shlncNEAT1或miR-582-5p inhibitor,检测NEAT1、miR-582-5p和F2RL2的表达,及细胞活力、凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6小鼠 | ALF Biotechnology | -- |
| 异氟烷 | RWD | R510-22 | |
| 心肌梗死模型建立 | shRNA慢病毒 | -- | -- |
| 超声心动图 | Panoview β1500 | Cold Spring Biotech | -- |
| TTC和Evans blue染色 | 伊文思蓝染色缓冲液 | Leagene Biotechnology | DK0051 |
| TTC缓冲液 | Leagene Biotechnology | DK0004 | |
| HE染色 | 二甲苯 | Meryer | B50009 |
| 石蜡 | OKA | A55701 | |
| 盐酸酒精 | Beyotime | C0163M | |
| 中性树胶 | Leagene Biotechnology | IH0265 | |
| THUNDER | Leica | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Beyotime | C1088 |
| 蛋白酶K | Leagene Biotechnology | NH0058 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Leagene Biotechnology | IH0145 | |
| DAPI | Leagene Biotechnology | DZ0125 | |
| DM2500荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 细胞培养 | 人心肌细胞 | Procell | CP-H076 |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 无糖DMEM | Gibco | 11966025 | |
| 细胞转染 | Lipofect转染试剂 | Leagene Biotechnology | CZ0002 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Leagene Biotechnology | PS0012 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Leagene Biotechnology | PT0001 | |
| 酶标仪 | Thermo | Varioskan LUX | |
| 上样缓冲液 | Leagene Biotechnology | PE0045 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Leagene Biotechnology | PE0018 | |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP24 | |
| F2RL2抗体 | Abcam | ab40769 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 山羊抗兔IgG | Abcam | ab205718 | |
| TBST缓冲液 | Leagene Biotechnology | PW0020 | |
| BeyoECL Moon缓冲液 | Beyotime | P0018FS | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| EdU染色 | EdU染色试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGA335-1000 |
| 甘氨酸溶液 | Leagene Biotechnology | R00325 | |
| Triton X-100 | Leagene Biotechnology | R00280 | |
| DM2500荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL3-Basic载体 | YouBio | VT1554 |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | E1960 | |
| SpectraMax酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| qRT-PCR | 总RNA提取试剂 | YEASEN | 10606ES60 |
| miRNA提取试剂盒 | YEASEN | 19331ES08 | |
| 紫外分光光度计 | Thermo | NanoDrop | |
| PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | RR047A | |
| SYBR green master缓冲液 | YEASEN | 11203ES03 | |
| 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | KeyGEN BioTECH | KGA317 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGA108 |
| Attune NxT流式细胞仪 | Thermo | -- | |
| 统计分析 | GraphPad 8.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MI小鼠模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、来源;MI手术方式(LAD结扎);sham组操作;术后24h EF排除标准;慢病毒注射途径、剂量、时间点 阅读提示:Methods 2.1和2.2 |
| 超声心动图 | 麻醉方式;探头频率;EF和FS测量方法 阅读提示:Methods 2.3 |
| TTC和Evans blue染色 | Evans blue和TTC浓度、染色时间、温度;切片厚度 阅读提示:Methods 2.4 |
| HE染色 | 固定液、固定时间;切片厚度;染色时间 阅读提示:Methods 2.5 |
| TUNEL染色 | 蛋白酶K孵育时间、温度;TUNEL反应时间;DAPI染色时间 阅读提示:Methods 2.6 |
| 细胞培养和OGD模型 | 细胞系、来源、培养基、血清浓度、OGD条件(无糖、低氧时间、气体比例) 阅读提示:Methods 2.7 |
| 细胞转染 | 转染试剂、用量;转染时间;质粒或RNA浓度 阅读提示:Methods 2.8 |
| Western blot | 蛋白提取方法、上样量、抗体稀释比例和孵育时间 阅读提示:Methods 2.9 |
| EdU染色 | EdU孵育时间;固定时间;通透时间;Click-iT反应时间 阅读提示:Methods 2.10 |
| 双荧光素酶报告基因 | 载体构建(WT/MUT);共转染的质粒和miRNA;检测试剂盒 阅读提示:Methods 2.11 |
| qRT-PCR | 引物序列;反应条件(预变性、变性、退火、延伸温度和循环数);内参基因 阅读提示:Methods 2.12和Table 1 |
| CCK-8实验 | 细胞铺板密度;检测时间点;CCK-8加入量;孵育时间 阅读提示:Methods 2.13 |
| 细胞凋亡检测 | 细胞数量;Annexin V和PI用量;孵育时间;流式细胞仪设置 阅读提示:Methods 2.14 |