无标记LC-MS/MS蛋白质组学分析揭示CLIC1作为膀胱癌分期和预后的预测性生物标志物

引言：膀胱癌（BC）是泌尿系统的一种重要癌肿，由于准确识别早期BC患者存在困难且晚期BC缺乏有效治疗方案，其发病率和死亡率很高。因此，需要定义新的预后和预测标志物。方法：在本研究中，我们通过无标记定量蛋白质组学进行了全面的蛋白质组学实验，以比较正常人和膀胱癌患者血清中的蛋白质组变化——总共成功定量了2064种可定量蛋白质。进行了定量分析以确定蛋白质种类相对强度和可重复性的变化程度。在非肌层浸润性膀胱癌和正常个体中发现43种上调蛋白和36种下调蛋白。在肌层浸润性和非肌层浸润性膀胱癌中分别有64种蛋白升高和51种蛋白下调。使用基因本体论（GO）和蛋白质直系同源簇（COG）注释差异表达蛋白的功能作用。为了分析差异表达蛋白富集的功能和通路，进行了GO富集分析、蛋白质结构域分析和KEGG通路分析。使用雷达图、热图、气泡图和韦恩图检查和可视化蛋白质组差异。结果：结合韦恩图和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI），氯离子细胞内通道1（CLIC1）被确定为主要蛋白。使用基因集癌症分析（GSCA）网站分析CLIC1对免疫浸润的影响。发现CD8初始T细胞与CLIC1水平呈负相关。为了验证，进行了免疫组织化学（IHC）、qPCR和蛋白质印迹（WB）。此外，我们发现CLIC1与膀胱癌的不良预后相关。讨论：我们的研究首次通过血清质谱法筛选CLIC1作为膀胱癌的促肿瘤蛋白。CLIC1与肿瘤分期和免疫浸润相关。CLIC1可能是膀胱癌患者新的预后生物标志物和治疗靶点。