临床相关性分析
评估CMTM6表达与肿瘤进展和预后的关系
利用TCGA数据库分析33种癌症与正常组织中CMTM6的表达差异,以及CMTM6表达与总生存期的相关性。
Suppression of Tumor or Host Intrinsic CMTM6 Drives Antitumor Cytotoxicity in a PD-L1-Independent Manner.
包含多种小鼠肿瘤模型、转基因小鼠、体外细胞实验、免疫表型分析、免疫细胞耗竭、过继转移、RNA-seq及scAAV基因治疗等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
CT26小鼠结肠癌细胞 B16F10小鼠黑色素瘤细胞 MC38小鼠结肠癌细胞 RKO人结直肠癌细胞
验证CMTM6敲除对体内肿瘤生长抑制依赖于CD8+T细胞和NK细胞 在PD-1/PD-L1轴缺失条件下验证CMTM6抑制肿瘤生长 验证CMTM6对Akt/GSK3β/β-catenin信号通路及CCL4表达的影响 验证宿主CMTM6敲除对CD8+T细胞浸润和耗竭的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CMTM6表达与肿瘤进展和预后的关系
利用TCGA数据库分析33种癌症与正常组织中CMTM6的表达差异,以及CMTM6表达与总生存期的相关性。
建立CMTM6或PD-L1敲除/敲降的肿瘤细胞系和免疫细胞系
使用CRISPR/Cas9或shRNA在多种小鼠及人肿瘤细胞系中敲除或敲降CMTM6,并验证效率。
评价CMTM6缺陷对肿瘤生长和转移的影响
将CMTM6敲除的肿瘤细胞接种于同系小鼠,监测肿瘤体积、重量、生存期及肺转移情况。
研究CMTM6缺陷对肿瘤微环境中免疫细胞的影响
通过流式细胞术分析肿瘤浸润免疫细胞(CD8+ T细胞、NK细胞等)的比例和功能标志物。
验证CD8+ T细胞和NK细胞在CMTM6缺陷抗肿瘤效应中的作用
使用抗体或药物耗竭小鼠的CD8+ T细胞、NK细胞等,观察对肿瘤生长的影响;进行TIL或脾细胞过继转移实验。
探讨CMTM6独立于PD-L1影响肿瘤免疫的分子机制
检测Akt/GSK3β/β-catenin信号通路和CCL4表达,以及T细胞活化后的PD-L1表达变化。
评估靶向CMTM6的scAAV的体内抗肿瘤疗效和联合治疗潜力
瘤内注射scAAV9-shCMTM6,监测肿瘤生长,并联合其他药物(如阿替利珠单抗、多柔比星等)观察效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Meilunbio | MA0212 |
| RPMI-1640培养基 | Meilunbio | MA0215 | |
| MEM培养基 | Meilunbio | MA0217 | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | 15140122 | |
| 胎牛血清 | Life Technologies | 10100147 | |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂3000 | Thermo | L3000150 |
| 慢病毒包装 | 慢病毒浓缩试剂盒 | Genomeditech | GM-040801 |
| 药物处理 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Meilunbio | MB5349 |
| 离子霉素 | Meilunbio | MB7511 | |
| 细胞因子 | 干扰素γ | GenScript | Z02916 |
| 白细胞介素2 | GenScript | Z02764 | |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂盒 | Yeasen | 40203ES60 |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Yeasen | 40302ES20 |
| 免疫细胞分离 | 淋巴细胞分离液 | Dakewe | 7211011 |
| 红细胞裂解液 | Yeasen | 40401ES60 | |
| NK细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-115-818 | |
| 泛T细胞分离试剂盒II | Miltenyi | 130-095-130 | |
| 免疫细胞耗竭 | 抗CD4抗体 | Bio X Cell | BE0119 |
| 抗CD8β抗体 | Bio X Cell | BE0223 | |
| 抗NK1.1抗体 | Bio X Cell | BE0036 | |
| 抗神经节苷脂GM1抗体 | BioLegend | 146002 | |
| 芬戈莫德 | Meilunbio | MB1552 | |
| 抗体治疗 | 抗CTLA-4抗体 | Bio X Cell | BE0032 |
| 抗PD-L1抗体 | Bio X Cell | BE0101 | |
| 流式分析 | 抗CMTM6抗体 | Abcam | ab264067 |
| 山羊抗兔IgG H&L(Alexa Fluor 647) | Abcam | ab150079 | |
| BV786大鼠抗小鼠CD274抗体 | BD Biosciences | 741014 | |
| 抗CD16/CD32抗体 | BD Biosciences | 553141 | |
| BD固定/破膜缓冲液 | BD Biosciences | 554714 | |
| BD转录因子固定/破膜缓冲液 | BD Biosciences | 562574 | |
| 固定缓冲液 | BD Biosciences | 554655 | |
| 破膜缓冲液III | BD Biosciences | 558050 | |
| ACEA NovoCyte流式细胞仪 | ACEA | -- | |
| ELISA | IFNγ ELISA试剂盒 | ExCell | EM007-96 |
| TNFα ELISA试剂盒 | ExCell | EM008-96 | |
| 重组蛋白 | 干扰素γ | GenScript | Z02916 |
| 免疫治疗药物 | 阿替利珠单抗 | -- | -- |
| 咪喹莫特 | -- | -- | |
| 化学治疗药物 | 多柔比星 | -- | -- |
| 氟伐他汀 | -- | -- | |
| 顺铂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系构建 | CMTM6或PD-L1的shRNA/sgRNA序列、慢病毒包装质粒、抗生素选择 阅读提示:Methods:Plasmids and viruses;Construction of stable cell lines |
| 皮下肿瘤模型 | 小鼠品系(BALB/c或C57BL/6)、细胞接种数量(5×10^5)、肿瘤体积计算方法 阅读提示:Methods:Tumor models using transgenic tumor cells or transgenic mice |
| 免疫细胞耗竭 | 耗竭抗体种类、剂量、注射时间点、耗竭效果验证 阅读提示:Methods:Immune cell depletion study |
| 体外免疫实验 | PMA和离子霉素浓度、刺激时间、共培养比例 阅读提示:Methods:Ex vivo cell assays |
| scAAV治疗 | scAAV9-shCMTM6的注射剂量、时间、途径、肿瘤模型 阅读提示:Methods:Construction of scAAV;Results:scAAV-mediated CMTM6 suppression is an effective tumor immunotherapy |