检测RPL11在NSCLC细胞系中的表达
评估RPL11在NSCLC细胞系中的基础表达水平是否异常。
使用Western blotting检测NCI-H1650、NCI-H1299、A549和HCC827及正常支气管上皮细胞HBE中RPL11蛋白表达。
RPL11 promotes non-small cell lung cancer cell proliferation by regulating endoplasmic reticulum stress and cell autophagy.
包含体外细胞实验(细胞活力、集落形成、迁移、细胞周期)和机制验证(自噬、ERS),但缺乏动物模型、患者样本等更高层级的证据。
A549细胞系 NCI-H1299细胞系 正常肺支气管上皮细胞HBE
RPL11在NSCLC细胞系(A549、NCI-H1299)中的过表达效率和敲低效率(通过Western blot和RT-qPCR验证) RPL11过表达对细胞周期G1/S转换及CCND1、CDK4表达的影响 自噬抑制剂CQ(20μM)对RPL11诱导的细胞增殖、集落形成和细胞周期的影响 ERS抑制剂TUDCA(2mM)对RPL11诱导的ERS和自噬标志物表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估RPL11在NSCLC细胞系中的基础表达水平是否异常。
使用Western blotting检测NCI-H1650、NCI-H1299、A549和HCC827及正常支气管上皮细胞HBE中RPL11蛋白表达。
验证RPL11表达变化对NSCLC细胞增殖和迁移的影响。
通过GV141载体过表达RPL11,或使用siRNA敲低RPL11,然后检测细胞活力、集落形成、迁移能力。
探究RPL11对细胞周期分布的影响。
通过流式细胞术分析过表达或敲低RPL11后细胞周期各阶段的比例变化,并检测细胞周期相关蛋白CCND1和CDK4的表达。
探究RPL11是否影响自噬水平。
通过AO染色检测酸性囊泡;使用mRFP-GFP-LC3腺病毒感染检测自噬流;Western blotting检测自噬标志物LC3、BECN1、p62。
验证RPL11促进增殖是否依赖于自噬和ERS。
使用CQ抑制自噬,TUDCA抑制ERS,观察对RPL11诱导的细胞增殖、细胞周期和自噬标志物表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Biological Industries | -- |
| F-12K培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | polyplus-transfection SA | -- |
| 小干扰RNA | GenePharma | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | TargetMol | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Proteintech | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光液 | -- | -- | |
| RPL11抗体 | Proteintech | 16277-1-AP | |
| CCND1抗体 | Proteintech | 26939-1-AP | |
| HSPA5/BiP抗体 | Proteintech | 66574-1-Ig | |
| ATF4抗体 | Proteintech | 10835-1-AP | |
| DDIT3/CHOP抗体 | Proteintech | 15204-1-AP | |
| MAP1LC3B/LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP | |
| BECN1抗体 | BOSTER | BM5181 | |
| SQSTM1/p62抗体 | BOSTER | M00300-1 | |
| CDK4抗体 | Proteintech | 11026-1-AP | |
| FLAG抗体 | Proteintech | 66008-3-1g | |
| 磷酸化ERN1/IRE1抗体 | Affinity | AF7150 | |
| ERN1/IRE1抗体 | Affinity | DF7709 | |
| ACTB/β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| EasyScript一步法去基因组cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | -- | |
| CCK-8 assay | CCK-8试剂 | TargetMol | -- |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Sigma Aldrich | -- |
| 划痕愈合实验 | 10 μL无菌移液枪头 | -- | -- |
| Transwell迁移实验 | 24孔Transwell小室 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| SpectraMax 190酶标仪 | MD | -- | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | Biosharp | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | Syngene | -- |
| AVO染色 | 吖啶橙 | Med Chem Express | -- |
| 自噬流检测 | mRFP-GFP-LC3腺病毒 | Hanbio | -- |
| 激光共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 药物处理 | 氯喹 | MedChemExpress | HY-17589A |
| 牛磺熊去氧胆酸 | MedChemExpress | HY-19696 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分(RPMI-1640、F-12K)、FBS浓度、培养湿度、温度和CO2浓度 阅读提示:材料与方法 - Cell culture and transient transfection |
| 转染 | 转染试剂(jetPRIME)、DNA/siRNA用量、转染时间 阅读提示:材料与方法 - Cell culture and transient transfection |
| Western blotting | 蛋白提取缓冲液、抑制剂、BCA定量、SDS-PAGE电泳、转膜条件、抗体稀释度、孵育时间 阅读提示:材料与方法 - Western blotting analysis |
| RT-qPCR | RNA提取试剂、反转录体系、qPCR循环条件、引物序列、内参基因(β-actin) 阅读提示:材料与方法 - Reverse transcription quantitative PCR |
| CCK-8检测 | 细胞铺板密度、检测时间点(0h、24h、48h、72h)、CCK-8试剂添加量及孵育时间 阅读提示:材料与方法 - Cell counting kit-8 (CCK-8) assay |
| 集落形成实验 | 细胞铺板密度(A549: 800/孔,NCI-H1299: 1000/孔)、培养时间(8天)、固定液(4%多聚甲醛)、染色液(0.5%结晶紫) 阅读提示:材料与方法 - Clone formation assay |
| 划痕愈合实验 | 细胞生长密度(80-90%)、划痕工具(10μL枪头)、培养条件(1%FBS培养基)、观察时间点(0h,24h,48h,72h) 阅读提示:材料与方法 - Scratch wound healing assay |
| Transwell迁移实验 | 细胞悬液体积(200μL)和数量、下室培养基体积(600μL)、培养时间(48h)、固定和染色条件 阅读提示:材料与方法 - Transwell migration assay |
| 细胞周期分析 | 细胞固定条件(70%乙醇,4℃过夜)、PI染色浓度(50μg/mL)和染色时间(30min)、流式细胞仪设置 阅读提示:材料与方法 - Cell cycle analysis |
| 自噬检测 | AO浓度(2μg/mL)、孵育时间(20min)、mRFP-GFP-LC3腺病毒感染时间(48h)、显微镜设置 阅读提示:材料与方法 - Acidic vesicular organelle (AVO) staining及Autophagy flux measurement |
| 药物处理 | CQ和TUDCA的浓度(分别为20μM和2mM)、添加时间(转染后6小时)、溶剂(DMSO) 阅读提示:材料与方法 - Chloroquine (CQ) and tauroursodeoxycholic acid (TUDCA) treatment |