转录组学揭示NTRK1对人神经元细胞系内质网应激反应相关基因的影响

背景：NTRK1基因编码TrkA，对神经系统至关重要，并驱动包括疼痛在内的多种生物过程。鉴于一些靶向NTRK1的新药在临床上的镇痛效果不尽如人意，深入了解NTRK1在神经元中的作用机制至关重要。方法：我们利用生物信息学分析评估了NTRK1过表达的SH-SY5Y细胞中的转录反应。进行了GO和KEGG分析，构建了PPI网络，并筛选了功能模块和前十基因。随后，通过RT-qPCR验证了枢纽基因。结果：共鉴定出419个差异表达基因，包括193个上调基因和226个下调基因。GO分析显示，上调基因主要富集于对内质网应激的反应、内质网中的蛋白质折叠等，下调基因则高度富集于一系列细胞组分和细胞过程。KEGG分析显示差异表达基因富集于内质网中的蛋白质加工以及与细胞增殖和迁移相关的通路。最显著的模块显著富集于内质网应激反应相关的生物过程。验证的七个枢纽基因包括五个上调基因（COL1A1、P4HB、HSPA5、THBS1和XBP1）和两个下调基因（CCND1和COL3A1），几乎所有这些基因都与内质网应激反应相关。结论：我们的数据表明，NTRK1显著影响SH-SY5Y细胞中内质网应激反应的基因转录。这提示内质网应激反应可能有助于NTRK1依赖性神经元的各种功能，因此，内质网应激反应相关基因需要进一步研究以阐明NTRK1相关的神经功能障碍。