银/手性吡咯烷吡啶中继催化烯炔酰胺的环异构化/(2 + 3)环加成以不对称合成作为PDE1B抑制剂的二螺环戊烯类化合物

Silver/chiral pyrrolidinopyridine relay catalytic cycloisomerization/(2 + 3) cycloadditions of enynamides to asymmetrically synthesize bispirocyclopentenes as PDE1B inhibitors.

作者信息Jing Jiang, Jin Zhou, Yang Li, Cheng Peng, Gu He, Wei Huang, Gu Zhan, Bo Han
PMID37337043
发布时间2023-06-19
DOI10.1038/s42004-023-00921-6

实验完整度

包含体外酶活测定、细胞实验、动物模型以及分子动力学模拟等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制探究。

主要模型

HLF细胞 BLM诱导的IPF大鼠模型 PDE1B蛋白 分子动力学模拟体系

重点核对

反应条件:1a (0.1 mmol)、AgOAc (10 mol%)在CHCl3中40°C搅拌1小时,然后加入2a (0.1 mmol)和C9 (20 mol%),0°C反应48小时,再40°C反应3小时 PDE1B抑制活性测定:化合物浓度为0.1 μmol·L-1 体外细胞实验:HLF细胞,TGF-β1刺激,3x孵育 体内动物实验:BLM诱导IPF大鼠模型,3x给药剂量20 mg·kg-1,阳性对照PFD 150 mg·kg-1

摘要

通过过渡金属催化剂与路易斯碱的结合,不对称合成取得了重大进展。然而,涉及4-氨基吡啶和过渡金属的双催化体系却很少受到关注。在这里,我们展示了一种金属/路易斯碱中继催化体系,其特点是醋酸银和修饰的手性吡咯烷吡啶(PPY)。该体系成功应用于烯炔酰胺的环异构化/(2 + 3)环加成反应。二螺环戊烯吡唑啉酮产物可以以立体选择性和经济的方式高效合成(高达>19:1 dr,99.5:0.5 er)。产物的转化可以获得立体发散的非对映异构体和密集官能化的多环衍生物。机理研究阐明了中继催化模型和不寻常化学选择性的起源。在随后的生物测定中,含有特权药物样骨架的产物在体外表现出亚型选择性磷酸二酯酶1(PDE1)抑制活性。最优先导化合物通过抑制PDE1在体内表现出改善肺纤维化的良好治疗效果。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何实现烯炔酰胺的环异构化/(2+3)环加成反应,以高效、立体选择性地合成具有PDE1抑制活性的双螺环戊烯吡唑啉酮类化合物?
核心机制
银催化的环异构化生成氮杂二烯中间体,手性PPY催化MBH碳酸酯形成烯丙基叶立德中间体,随后发生(2+3)环加成,实现中继催化。
主要证据
控制实验和DFT计算表明,(2+3)环加成比(4+3)环加成能量低19.4 kcal/mol;体外酶活测定显示化合物3x对PDE1B具有选择性抑制;细胞和动物实验表明3x通过抑制PDE1减轻肺纤维化。
研究意义
为合成螺环吡唑啉酮类药物相关分子提供了新策略,并发现了具有改善肺纤维化潜力的先导化合物3x。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

反应条件优化

筛选金属催化剂和手性PPY催化剂,确定最佳反应条件。

以烯炔酰胺1a和MBH碳酸酯2a为底物,对不同金属催化剂(PPh3AuCl/AgSbF6、AgOTf、Ag2CO3、AgOAc)和手性PPY催化剂(C1-C9)进行筛选,考察产率和对映选择性。

2

底物范围考察

考察不同取代的MBH碳酸酯和烯炔酰胺底物的适用性。

在最优条件下,对多种含不同N-取代基、芳基取代基的MBH碳酸酯,以及不同磺酰基、炔基、烯基取代的烯炔酰胺底物进行反应,考察产率、非对映选择性和对映选择性。

3

克级规模合成与产物转化

验证反应的实用性,并探索产物的多样转化。

对3a进行克级规模合成(1.0 mmol),并通过环氧化、酸碱处理异构化、Pd催化的C-H官能化、Rh催化的偶联等反应,得到多种衍生物。

4

控制实验与机理研究

验证中继催化模型和化学选择性的来源。

通过单独使用AgOAc或同时使用AgOAc/C9催化生成中间体A,以及单独使用C9催化A与2a的环加成,对比产率和选择性;进行DFT计算,比较(2+3)和(4+3)环加成的过渡态能量。

5

PDE1抑制活性评价

评估产物对PDE1的抑制活性和亚型选择性。

在0.1 μmol·L-1浓度下测定所有产物对PDE1B的抑制率;对抑制率超过60%的化合物测定对PDE1A、1B、1C的IC50;对化合物3x进行PDE家族选择性测定,并通过分子对接和分子动力学模拟研究其与PDE1B的结合模式。

6

体内外药效评价

评估化合物3x对肺纤维化的治疗作用及初步机制。

在TGF-β1刺激的HLF细胞中,通过Western blot和免疫荧光检测纤维化标志物(Fibronectin、Collagen-I、α-SMA)的表达;在BLM诱导的IPF大鼠模型中,检测肺功能指标、肺组织病理学变化(H&E和Masson染色)。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
三苯基膦氯化金----
六氟锑酸银----
三氟甲磺酸银----
碳酸银----
醋酸银----
DABCO----
间氯过氧苯甲酸----
F12K培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
青霉素/链霉素Gibco--
RIPA裂解液Beyotime Institute of Biotechnology--
Pierce™ Rapid Gold BCA蛋白测定试剂盒Thermo Fisher Scientific, Inc.--
PVDF膜----
HRP标记的二抗ProteinTech Group, Inc.--
Immobilon ECL Ultra Western HRP底物Merck KGaA--
Chemi-Doc系统Bio-Rad Laboratories, Inc.--
Triton X-100Sigma-Aldrich--
山羊血清----
DAPIInvitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc.--
共聚焦荧光显微镜Zeiss GmbHAxiovert
博来霉素----
吡非尼酮----
Masson三色染色----
奥林巴斯FV-3000显微镜OlympusFV-3000
Gromacs-2020.6软件包----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
反应条件优化
催化剂种类、催化剂负载量、溶剂、温度、时间
阅读提示:Methods部分和Table 1
底物范围考察
底物1和2的取代基类型
阅读提示:Results部分和Fig. 3
PDE1抑制活性
化合物浓度、酶亚型、缓冲液成分、孵育时间
阅读提示:Methods部分Bioassay
细胞实验
细胞系、培养条件、TGF-β1浓度、3x浓度、处理时间
阅读提示:Methods部分Cell culture and western blotting
动物实验
动物品系、BLM剂量、给药途径、3x剂量、给药时间
阅读提示:Methods部分BLM-induced pulmonary damage rat model