一种新型坏死性凋亡相关长链非编码RNA模型用于预测透明细胞肾细胞癌的临床特征、免疫特征和治疗反应

背景：坏死性凋亡是一种与免疫相关的细胞死亡途径，参与肿瘤微环境（TME）的调控。在此，我们旨在探索坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的作用，并构建坏死性凋亡相关lncRNA（NRL）模型，以评估其与临床特征和免疫状态的潜在关联。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）获取ccRCC患者的基因表达谱和临床数据。采用Pearson相关、单因素Cox和最小绝对收缩和选择算子分析来开发NRL模型。采用Kaplan-Meier（K-M）和受试者工作特征（ROC）曲线分析来确定NRL模型的预后价值。利用临床信息评估NRL模型的诊断价值。使用ESTIMATE、GSEA、ssGSEA和CIBERSORT算法研究TME、免疫功能、免疫细胞浸润和免疫检查点与NRL模型风险评分的关联。基于NRL模型，使用免疫表型评分（IPS）和半数抑制浓度（IC50）来比较免疫治疗和化疗的疗效。最后，进行体外实验以确认NRLs的生物学作用。结果：在ccRCC中鉴定出共18个坏死性凋亡相关基因和285个NRLs。构建了一个四-NRL模型，并在ccRCC患者的诊断和预后中显示出良好性能。ESTIMATE评分、肿瘤突变负荷和肿瘤干性指数与NRL模型风险评分显著相关。趋化因子受体和免疫受体活性等免疫功能在不同风险组之间存在差异。免疫抑制细胞如Tregs的浸润在高风险患者中高于低风险患者。高风险患者对免疫治疗和某些化疗药物（如舒尼替尼和替西罗莫司）更敏感。最后，验证了模型中包含的NRLs的表达，在肿瘤细胞中敲低这些NRLs影响了细胞增殖、迁移和侵袭。结论：坏死性凋亡在ccRCC的进展中发挥重要作用。我们构建的NRL模型可用于预测ccRCC患者的临床特征和免疫特征。