表达分析
检测circ_0001715、miR-1322和CANT1在LUAD组织和细胞系中的表达水平及其临床相关性。
通过RT-qPCR检测临床组织样本和细胞系中circ_0001715、miR-1322和CANT1的表达,并分析其与临床病理参数的相关性。
Circ_0001715 accelerated lung adenocarcinoma process by the miR-1322/CANT1 axis.
包含体外细胞功能实验、分子机制验证(双荧光素酶、RNA pull-down)以及体内小鼠移植瘤模型,多个证据层级验证。
LUAD组织样本(43对肿瘤及配对正常组织) 人正常肺上皮细胞BEAS-2B LUAD细胞系A549和H1299 BALB/c裸鼠移植瘤模型
circ_0001715在LUAD组织及细胞系中表达升高(RT-qPCR) 敲低circ_0001715抑制增殖、促进凋亡(克隆形成、EDU、划痕、流式) circ_0001715与miR-1322直接结合(双荧光素酶、RNA pull-down) miR-1322靶向CANT1并调控其表达(双荧光素酶、western blot) 体内敲低circ_0001715抑制肿瘤生长(裸鼠移植瘤、IHC)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测circ_0001715、miR-1322和CANT1在LUAD组织和细胞系中的表达水平及其临床相关性。
通过RT-qPCR检测临床组织样本和细胞系中circ_0001715、miR-1322和CANT1的表达,并分析其与临床病理参数的相关性。
验证circ_0001715对LUAD细胞增殖、凋亡、迁移和血管生成能力的影响。
通过siRNA敲低circ_0001715,采用克隆形成、EDU、划痕愈合、球体形成、流式细胞术和管形成实验评估细胞功能变化。
验证circ_0001715与miR-1322的相互作用以及miR-1322对CANT1的靶向调控。
通过双荧光素酶报告实验和RNA pull-down验证circ_0001715与miR-1322结合;通过双荧光素酶报告实验验证miR-1322靶向CANT1;通过western blot检测蛋白表达。
验证circ_0001715通过miR-1322/CANT1轴调控LUAD细胞功能。
在敲低circ_0001715的基础上,分别加入miR-1322 inhibitor或过表达CANT1,检测细胞增殖、凋亡等功能指标。
验证敲低circ_0001715在体内对肿瘤生长的影响。
将稳定敲低circ_0001715的A549细胞皮下接种至BALB/c nude小鼠,监测肿瘤体积和重量,并通过IHC和RT-qPCR检测相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | -- | |
| 表皮生长因子 | ACROBiosystems | -- | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | ACROBiosystems | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Premix EX Taq试剂盒 | Takara | -- |
| 克隆形成实验 | 甲醇固定液 | Beyotime | -- |
| 结晶紫 | Beyotime | -- | |
| EDU实验 | EDU试剂 | Biomart | C10310 |
| DAPI染色液 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | BestBio | BB-4101 | |
| 流式细胞仪 | Becton | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Boster | -- |
| Western blot | PCNA抗体 | Abcam | ab29 |
| Bax抗体 | Abcam | ab182733 | |
| CANT1抗体 | LMAI Bio | ICA357Mu01 | |
| β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 二抗(山羊抗小鼠) | Abcam | ab216772 | |
| 二抗(山羊抗兔) | Abcam | ab97051 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Bioon | 1FF7872 | |
| 管形成实验 | 基质胶 | BD Bioscience | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | pmirGLO质粒 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告系统 | Promega | -- | |
| RNA pull-down | 链霉亲和素磁珠 | -- | -- |
| 生物素标记的miR-1322探针 | ThermoFisher | -- | |
| IHC | Ki-67抗体 | Abcam | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Vital River Laboratory Animal Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织样本收集 | 样本来源、数量(43对)、储存条件(液氮、-80℃) 阅读提示:Materials and methods: Tissues collection |
| 细胞培养 | 细胞系(BEAS-2B、A549、H1299)、培养基(RPMI-1640/DMEM)、FBS浓度(10%)、培养条件(37℃、5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cells culture |
| 基因表达检测 | RT-qPCR引物序列、内参(β-actin/U6)、2^-ΔΔCt方法;Western blot一抗稀释度、二抗稀释度 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR、Western blot assay;Table 2 |
| 细胞功能实验 | siRNA转染浓度、细胞接种密度、处理时间(EDU 2h、划痕24h)、克隆形成时间 阅读提示:Materials and methods: Clone formation assay、EDU assay、Wound healing assay |
| 分子相互作用验证 | 质粒构建、miR-1322 mimics浓度、共转染时间(48h)、RNA pull-down缓冲液 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay、RNA pull-down assay |
| 体内实验 | 动物品系(BALB/c nude)、周龄(4周)、分组(sh-NC/sh-circ_0001715)、每组数量(5)、接种细胞数(未明确说明)、肿瘤体积测量频率(每周) 阅读提示:Materials and methods: Xenografts assay;Results: Silencing of circ_0001715 inhibited LUAD tumor growth in vivo |