菌株筛选与OGT胁迫耐受性评估
筛选出对模拟口腔-胃肠道胁迫具有高耐受性的乳酸菌菌株。
对25株乳酸菌进行连续模拟唾液、胃液、肠液处理,测定存活率。
The regulation of simulated artificial oro-gastrointestinal transit stress on the adhesion of Lactobacillus plantarum S7.
包含体外模拟OGT胁迫实验、黏附试验、关键黏附素去除、TEM观察、TMT蛋白质组学及GO/KEGG通路分析等多个独立证据层级,并含功能验证和机制验证。
植物乳杆菌S7 Caco-2细胞 猪胃黏蛋白
OGT胁迫条件:模拟唾液(含100 mg/L溶菌酶,pH 7.0,5 min)、胃液(含3.0 g/L胃蛋白酶,pH 3.0,3 h)、肠液(含0.1%胰酶和0.15%或0.30%胆盐,pH 8.0,2 h) 黏附测定:Caco-2细胞单层和猪胃黏蛋白包被的24孔板,LAB浓度108 CFU/mL,37°C孵育2 h 关键黏附素去除:5 mol/L LiCl处理去除表面蛋白,50 mmol/L NaIO4处理去除EPS,2% BSA处理去除脂磷壁酸 蛋白质组学分析:TMT标记、LC-MS/MS,DEPs筛选标准为FC>1.2或<0.83且P<0.05 统计方法:采用Tukey多重比较检验,P<0.05为显著差异
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选出对模拟口腔-胃肠道胁迫具有高耐受性的乳酸菌菌株。
对25株乳酸菌进行连续模拟唾液、胃液、肠液处理,测定存活率。
评估菌株对肠道黏蛋白和Caco-2细胞的黏附能力,并选择代表性菌株。
选用猪胃黏蛋白包被板和Caco-2细胞单层,测定各菌株的黏附率,并分析两者的相关性。
明确OGT胁迫对S7黏附的影响,并鉴定关键黏附素。
对S7进行OGT1和OGT2胁迫处理,测定黏附率变化;用LiCl、NaIO4和BSA处理去除表面蛋白、EPS和脂磷壁酸,比较处理前后的黏附率。
观察OGT胁迫对细胞表面物质厚度的影响。
使用透射电子显微镜(TEM)观察S7在无胁迫和OGT1、OGT2胁迫后的细胞形态,并统计表面厚度。
分析OGT胁迫下S7的差异表达蛋白及相关通路。
提取S7在无胁迫、OGT1和OGT2胁迫下的总蛋白,进行TMT标记和LC-MS/MS分析,鉴定和定量差异表达蛋白,并进行GO和KEGG富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 模拟OGT胁迫 | 溶菌酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胃蛋白酶 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 胰酶 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 牛胆盐 | Solabo Technology Co., Ltd. | -- | |
| 黏附试验 | 猪胃黏蛋白(II型) | Macklin Biochemical Technology Co., Ltd. | -- |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | MEM培养基 | Life Technologies, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Clark bioscience | -- | |
| 非必需氨基酸 | Life Technologies, Inc. | -- | |
| GlutaMAX | Life Technologies, Inc. | -- | |
| 关键黏附素去除 | 氯化锂 | Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sangon Biotech Co., Ltd. | -- | |
| TEM观察 | FEI Tecnai G2 spirit | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 锇酸 | -- | -- | |
| Spurr低黏度包埋树脂 | -- | -- | |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| 蛋白质提取 | SDT缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白质消化 | C18色谱柱 | Empore | -- |
| LC-MS/MS | Easy nLC系统1200 | Thermo Scientific | -- |
| Q Exactive plus质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| 捕集柱(Thermo Scientific Acclaim PepMap100) | Thermo Scientific | -- | |
| 分析柱(Thermo Scientific EASY column) | Thermo Scientific | -- | |
| TMT标记 | iTRAQ试剂 | Thermo Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 模拟OGT胁迫 | 模拟唾液、胃液、肠液的成分、pH、处理时间及温度;胆盐浓度(0.15%或0.30%)。 阅读提示:Methods: Tolerance to simulated artificial orogastrointestinal transit (OGT) stress |
| 黏附试验 | 黏蛋白浓度、包被条件;Caco-2细胞培养条件、接种浓度;菌液浓度、孵育时间;洗涤和释放处理。 阅读提示:Methods: Adhesion to intestinal mucin in vitro; Adhesion to Caco-2 cells in vitro |
| 关键黏附素去除 | LiCl、NaIO4、BSA的处理浓度、时间、温度、转速。 阅读提示:Methods: Key adhesins of the LAB cell surface |
| TEM观察 | 固定液浓度、固定时间、脱水系列、包埋试剂及时间、染色步骤。 阅读提示:Methods: Transmission electron microscopy (TEM) observation |
| 蛋白质组学分析 | 蛋白质提取缓冲液、定量方法、酶解方法、TMT标记条件、LC-MS/MS参数、搜库软件及数据库、差异蛋白筛选阈值。 阅读提示:Methods: Protein isolation and digestion; Tandem mass tag (TMT) labeling and LC–MS/MS analysis; Protein identification and quantification and bioinformatics |