临床样本分析
评估BPH、PCa和CRPC组织中YAP1、SLC1A5和GLS1的表达水平及其相关性。
收集BPH、PCa和CRPC组织样本,通过Western blot检测YAP1、SLC1A5和GLS1的蛋白水平,并进行相关性分析。
YAP1 inhibits RSL3-induced castration-resistant prostate cancer cell ferroptosis by driving glutamine uptake and metabolism to GSH.
包含临床组织样本分析、细胞系功能实验和机制验证,但缺乏动物模型或其他独立证据层级。
PC-3细胞 DU145细胞 BPH、PCa和CRPC临床组织样本
细胞系:PC-3和DU145 RSL3处理浓度5 μM,处理24小时 YAP1过表达或敲低效率 SLC1A5和GLS1抑制剂浓度及处理时间(V-9302 20 μM 48小时,CB-839 1 μM 48小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估BPH、PCa和CRPC组织中YAP1、SLC1A5和GLS1的表达水平及其相关性。
收集BPH、PCa和CRPC组织样本,通过Western blot检测YAP1、SLC1A5和GLS1的蛋白水平,并进行相关性分析。
探讨YAP1是否调节CRPC细胞中的谷氨酰胺摄取和代谢。
在PC-3和DU145细胞中,通过过表达或抑制YAP1(siRNA或verteporfin),检测细胞外谷氨酰胺水平、细胞内谷氨酸含量、GSH水平和GPX4活性。
探究YAP1是否影响RSL3诱导的CRPC细胞铁死亡。
使用RSL3诱导铁死亡,通过检测GSH水平、GPX4活性、ROS、MDA、脂质过氧化和细胞死亡比例,评估YAP1过表达或抑制的影响。
评估抑制SLC1A5或GLS1对CRPC细胞铁死亡的影响。
使用V-9302和CB-839分别抑制SLC1A5和GLS1,检测GSH水平、GPX4活性、ROS、MDA、脂质过氧化和细胞死亡比例。
确定YAP1是否通过调控SLC1A5和GLS1表达影响铁死亡。
在YAP1过表达或抑制的细胞中,检测SLC1A5和GLS1的蛋白水平及GLS1活性,并结合SLC1A5或GLS1抑制剂,检测铁死亡相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | Procell | PM150910 |
| MEM培养基 | Procell | PM150410 | |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-500 | |
| 细胞处理 | RSL3 | MCE | HY-100218A |
| 维替泊芬 | MCE | HY-B0146 | |
| V-9302 | MCE | HY-112683 | |
| CB-839 | MCE | HY-12248 | |
| 转染 | Lipofectamine™ 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白质定量 | Bradford蛋白定量试剂 | Bio-Rad | 5000006 |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | 162-0177 |
| YAP1抗体 | affinity | AF6328 | |
| SLC1A5抗体 | abcam | ab237704 | |
| GLS1抗体 | abcam | ab156876 | |
| Histone H3抗体 | abcam | ab1791 | |
| GAPDH抗体 | abcam | ab9485 | |
| HRP标记二抗 | Dianova | -- | |
| ECL显影液 | Bio-Rad | 170-5060 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 8×GTIIC荧光素酶报告基因质粒 | Addgene | 34615 |
| Bright-Lumi™萤火虫荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG051S | |
| 酶活性检测 | GLS活性检测试剂盒 | Solarbio | BC1450 |
| GPX4活性检测 | 谷胱甘肽还原酶 | Sigma | G3664 |
| 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 | Sigma | N7505 | |
| 谷胱甘肽 | Sigma | G4251 | |
| 谷氨酰胺检测 | 谷氨酰胺检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A073-1-1 |
| 谷氨酸检测 | 谷氨酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A074-1-1 |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY探针 | Invitrogen | D3861 |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A003-4-1 |
| ROS检测 | DCFH探针 | Beyotime | S0033S-1 |
| ROS阳性对照 | Beyotime | S0033S-2 | |
| 细胞活力检测 | Calcein/PI细胞活力与细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C2015L |
| 荧光检测 | 荧光分析仪 | Shijiazhuang Compson Technology Co., Ltd. | KPS-QQ80 |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD Accuri C6 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | PC-3和DU145细胞的来源及培养条件(培养基、FBS浓度、温度、CO2浓度、传代比例) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| 药物处理 | RSL3、Verteporfin、V-9302、CB-839的浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods - Cell treatment |
| 转染 | YAP1过表达质粒和siRNA序列、转染试剂及用量、转染时间 阅读提示:Materials and methods - Transfection |
| Western blot | 抗体稀释比例、品牌、货号、蛋白上样量、封闭条件、二抗孵育条件 阅读提示:Materials and methods - Western blotting |
| 双荧光素酶报告基因 | 质粒信息、检测试剂盒、仪器型号 阅读提示:Materials and methods - Dual-luciferase reporter gene assay |
| 代谢物检测 | 谷氨酰胺、谷氨酸、GSH检测试剂盒的型号及操作步骤 阅读提示:Materials and methods - Glutamine levels, Glutamate levels, GSH level |
| 氧化应激检测 | ROS、MDA、脂质过氧化检测的探针和试剂盒型号、孵育时间 阅读提示:Materials and methods - Lipid peroxidation, MDA levels, ROS levels |
| 细胞死亡检测 | Calcein-AM/PI染色试剂盒型号、孵育时间 阅读提示:Materials and methods - Calcein–AM/PI staining |