体外抗增殖活性筛选
评估S670对GBM细胞增殖、迁移、侵袭和集落形成的影响
使用CCK-8、EdU、Transwell、软琼脂集落形成实验检测S670处理后的细胞增殖、DNA合成、迁移、侵袭和集落形成能力,并通过Western blot检测E-cadherin和N-cadherin表达,流式细胞术检测细胞周期。
S670, an amide derivative of 3-O-acetyl-11-keto-β-boswellic acid, induces ferroptosis in human glioblastoma cells by generating ROS and inhibiting STX17-mediated fusion of autophagosome and lysosome.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、凋亡、铁死亡、自噬流、蛋白表达)、机制研究(siRNA敲低、Co-IP)和体内异种移植模型,并进行了功能验证(抑制剂、敲低)和机制验证。
人胶质母细胞瘤细胞系U87 人胶质母细胞瘤细胞系U251 U87小鼠异种移植模型(BALB/c裸鼠)
S670浓度:0-16 μM,IC50约6 μM S670处理时间:24, 48, 72小时 体内模型:U87细胞皮下植入BALB/c裸鼠,S670给药剂量25和50 mg/kg,每日灌胃,持续12天 使用NAC(5 mM)作为ROS清除剂,Fer-1(1 μM)作为铁死亡抑制剂 siRNA敲低Beclin-1、TFEB、STX17验证机制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估S670对GBM细胞增殖、迁移、侵袭和集落形成的影响
使用CCK-8、EdU、Transwell、软琼脂集落形成实验检测S670处理后的细胞增殖、DNA合成、迁移、侵袭和集落形成能力,并通过Western blot检测E-cadherin和N-cadherin表达,流式细胞术检测细胞周期。
验证S670是否诱导ROS产生和铁死亡
使用DCFH-DA检测ROS,mtSOX Deep Red检测线粒体ROS,C11 BODIPY 581/591检测脂质ROS;使用Fer-1和NAC验证细胞死亡机制;检测Fe2+水平、GPX4和COX2表达;TEM观察线粒体形态。
评估S670对自噬流的影响并探索其机制
Western blot检测LC3B和p62表达,免疫荧光观察GFP-LC3斑点,TEM观察自噬体,使用Rapa和CQ处理,敲低Beclin-1,检测Nrf2通路相关蛋白表达。
验证S670是否诱导溶酶体生物发生及其机制
检测LAMP1和LAMP2表达,LysoRed Tracker染色检测溶酶体质量,中性红染色检测溶酶体pH,免疫荧光和Western blot检测TFEB核转位,敲低TFEB验证其作用。
探究S670对自噬体-溶酶体融合的影响及STX17的作用
使用mRFP-GFP-LC3腺病毒感染细胞观察自噬流,免疫荧光和Co-IP检测LC3与LAMP2的共定位和相互作用,Western blot和RT-qPCR检测STX17、SNAP29、VAMP8表达。
在U87异种移植模型中评估S670的体内抗肿瘤效果和安全性
将U87细胞皮下植入裸鼠,随机分组后给予S670(25和50 mg/kg)或TMZ(10 mg/kg)每日灌胃,记录肿瘤体积和体重,计算肿瘤重量,通过IHC检测Ki67、LC3、LAMP2表达,H&E染色评估器官毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 达尔伯克改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-50 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0039 |
| 细胞增殖检测 | EdU试剂盒 | RiboBio | C10310 |
| 迁移和侵袭检测 | Transwell小室 | Corning Costar | 3342 |
| 侵袭检测 | 基质胶 | Corning Costar | 354234 |
| 侵袭染色 | 结晶紫 | Solarbio | G1062 |
| 细胞周期检测 | 碘化丙啶溶液 | Solarbio | C0080 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V和PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A211-02 |
| 流式细胞术 | BD FACSVerse流式细胞仪 | BD | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Gene-Protein Link | C1053-100 |
| SDS-PAGE上样缓冲液 | CWBIO | CW0027 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 脱脂奶粉 | Applygen | P1622 | |
| SuperECL化学发光液 | Applygen | P1050 | |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Gene-Protein Link | G01E01S |
| RT-qPCR | SuperRT cDNA合成试剂盒 | CWBIO | CW0741M |
| MagicSYBR混合物 | CWBIO | CW3008M | |
| 无RNase水 | Solarbio | R1600 | |
| CFX热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| 铁离子检测 | 细胞亚铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Sigma-Aldrich | 35845 |
| 脂质ROS检测 | BODIPY 581/591 C11荧光探针 | MedChemExpress | HY-D1301 |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Solarbio | C0065 |
| 激光共聚焦显微镜 | Leica TCS SP8X激光共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 溶酶体染色 | LysoRed溶酶体红色荧光探针 | Beyotime | C1046 |
| 溶酶体pH检测 | 中性红染色液 | Beyotime | C0123 |
| 自噬流分析 | 串联mRFP-GFP-LC3腺病毒 | HANBIO | -- |
| RNA干扰 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| Co-IP | IP裂解液 | Applygen | C1054 |
| Protein A+G磁珠 | Beyotime | P2108 | |
| TEM | 透射电子显微镜 | HITACHI | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Charles River | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与增殖 | 细胞系U87和U251;DMEM培养基含10% FBS;CCK-8细胞接种密度3×10^3每孔;S670浓度梯度0-16 μM;处理时间24, 48, 72小时 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and proliferation assay |
| ROS和铁死亡检测 | S670浓度6 μM;处理时间24小时;DCFH-DA探针;C11 BODIPY 581/591探针;脂质ROS检测;Fe2+检测;线粒体形态观察 阅读提示:Materials and methods - Detection of cell ferrous iron, ROS and lipid ROS; Results - S670 stimulated ROS generation and induced ferroptosis |
| 自噬流分析 | mRFP-GFP-LC3腺病毒感染MOI=1;S670浓度6 μM;处理时间24小时;观察自噬体和自溶酶体数量 阅读提示:Materials and methods - Autophagic flux analysis |
| Western blot蛋白表达检测 | S670浓度梯度0, 4, 8, 12 μM;处理时间24小时或时间梯度0,1,3,6,12,24小时;抗体信息见补充表S2 阅读提示:Materials and methods - Western blotting; Figure legends Fig 3a, b, Fig 4a, b, Fig 5d |
| 体内异种移植模型 | U87细胞1×10^6皮下植入BALB/c裸鼠;分组(n=6):DMSO,S670 25 mg/kg,S670 50 mg/kg,TMZ 10 mg/kg;每日灌胃;治疗12天或肿瘤体积达1000 mm³ 阅读提示:Materials and methods - Xenograft model of nude mice; Figure legend Fig 6a |