外泌体分离与鉴定
获得并验证BMSC来源的外泌体。
使用ExoQuick-TC从BMSC培养上清中沉淀外泌体,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot检测标志物,PKH26染色示踪。
Bone marrow mesenchymal stem cell-derived exosomal microRNA regulates microglial polarization.
包含体外细胞实验(OGD模型、外泌体处理、流式、双荧光素酶等)及机制验证,但缺乏动物模型或体内验证,证据层级相对单一。
BV-2小胶质细胞系 BMSC来源外泌体 OGD暴露的BV-2细胞
外泌体分离方法:ExoQuick-TC沉淀法 OGD建模条件:无糖DMEM、1% O2、4小时 外泌体处理浓度:15 µg/mL miR-146a-5p模拟物和抑制剂转染 Traf6基因敲低和过表达质粒
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证BMSC来源的外泌体。
使用ExoQuick-TC从BMSC培养上清中沉淀外泌体,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot检测标志物,PKH26染色示踪。
评估外泌体处理对OGD诱导的细胞凋亡和极化标志物表达的影响。
对BV-2细胞进行OGD建模,并用外泌体处理,随后通过流式细胞术检测凋亡和CD40、CD86、CD206表达。
识别外泌体处理后差异表达的miRNA。
提取RNA,进行小RNA测序,使用edgeR分析差异表达,并利用TargetScan等预测靶基因及富集分析。
验证miR-146a-5p在小胶质细胞极化中的作用。
在OGD暴露的BV-2细胞中转染miR-146a-5p模拟物或抑制剂,检测CD40、CD86和CD206表达。
验证miR-146a-5p是否直接靶向Traf6,并研究miR-146a-5p/Traf6轴对极化的影响。
通过双荧光素酶报告实验验证miR-146a-5p与Traf6 3'UTR的结合;通过Western blot和RT-qPCR检测Traf6表达;共转染miR-146a-5p模拟物和Traf6过表达质粒或miR-146a-5p抑制剂和sh-Traf6,检测极化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | -- | |
| 外泌体分离 | ExoQuick-TC外泌体沉淀试剂 | System Biosciences | -- |
| 外泌体鉴定 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| CD9抗体 | Abcam | ab236630 | |
| Calnexin抗体 | Cell Signaling Technology | 2679 | |
| 二抗 | CST | 7076 | |
| PKH26染料 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC | Sangon Biotech | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| CD40-FITC抗体 | Biolegend | 124607 | |
| CD86-PE抗体 | Biolegend | 105007 | |
| CD206-FITC抗体 | BioLegend | 141703 | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| miRNA测序 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | 反转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- |
| 双重荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 外泌体鉴定 | 透射电子显微镜 | JEOL Ltd | -- |
| Zetasizer Nano ZS粒度仪 | Malvern Panalytical | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | BV-2细胞系和BMSC的来源及培养条件(DMEM、10% FBS、1%青霉素-链霉素、37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials & Methods - Cell culture |
| 外泌体分离和表征 | ExoQuick-TC沉淀法步骤(离心速度和时间)及表征方法(TEM、NTA、Western blot) 阅读提示:Materials & Methods - Exosome isolation and Characterization |
| OGD模型及外泌体处理 | OGD条件(无糖DMEM、1% O2、4小时)和外泌体处理浓度(15 µg/mL) 阅读提示:Materials & Methods - Oxygen-glucose deprivation (OGD) modeling and exosome treatment |
| 流式细胞术检测 | 凋亡和表型检测抗体(CD40、CD86、CD206)及染色条件 阅读提示:Materials & Methods - Flow cytometry for apoptosis and cell phenotype |
| miRNA转染 | miRNA mimics/inhibitors及质粒的序列和转染条件(Lipofectamine 3000) 阅读提示:Materials & Methods - Cell transfection |
| 双荧光素酶报告基因测定 | psiCHECK-2-Traf6载体和突变体、共转染后检测时间 阅读提示:Materials & Methods - Dual luciferase reporter gene assay |