通过靶向脂质代谢关键酶CPT1A、SCD和FASN恢复紫杉醇耐药卵巢癌的敏感性

上皮性卵巢癌（EOC）是一种致命的妇科癌症，其中紫杉醇耐药是限制治疗结果的主要因素，而鉴定紫杉醇耐药相关基因是艰巨的。我们获得了七个紫杉醇耐药卵巢癌细胞系及相应敏感细胞系的转录组数据。将至少在三个耐药细胞系中显著上调、且在其余耐药细胞系中未下调的基因定义为候选基因。然后根据候选基因在耐药细胞系中显著上调的频率进行排序，将排名最高的基因定义为紫杉醇耐药相关基因（PRGs）。根据PRGs的中位表达对患者进行分组。建立了脂质代谢相关基因集和肿瘤相关基因集，并与PRGs共上调的基因取交集，获得229个与脂质代谢和肿瘤发生相关的共上调基因。PPI网络获得了19个与CPT1A直接相关的高置信协同靶点（相互作用评分>0.7）。最后，FASN和SCD分别是CPT1A的上游底物提供者和竞争者。Western blot和qRT-PCR结果证实了A2780/PTX细胞系中CPT1A、SCD和FASN的过表达。抑制CPT1A、SCD和FASN可降低细胞活力和迁移，药理学阻断CPT1A和SCD可提高A2780/PTX的凋亡率和紫杉醇敏感性。总之，我们的新生物信息学方法可以克服药物耐药性评估的困难，通过靶向脂质代谢相关酶为紫杉醇耐药EOC提供有前景的治疗策略。