纳米塑料表征
确定纳米塑料的物理化学性质,包括尺寸、表面电荷和官能团。
使用DLS测量水合粒径和zeta电位,TEM观察形貌,FTIR和XPS分析表面官能团。
Nanoplastic Stimulates the Amyloidogenesis of Parkinson's Alpha-Synuclein NACore.
包含体外聚集实验、细胞毒性实验、体内斑马鱼实验及分子动力学模拟等多个独立证据层级,且明确包含功能与机制验证。
HMC3人小胶质细胞系 斑马鱼胚胎 NACore肽体外聚集体系
NACore浓度:25、50、100微摩尔用于ThT实验;细胞实验使用50-800微摩尔;斑马鱼实验使用100、200微摩尔 纳米塑料浓度:ThT和细胞实验使用20和200微克/毫升;斑马鱼实验使用20和100微克/毫升 孵育时间:ThT实验监测至48小时;细胞处理24小时;斑马鱼观察至72小时 细胞系:HMC3人小胶质细胞,传代不超过15次 斑马鱼品系:AB野生型,胚胎在1 hpf时注射2 nL样品
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定纳米塑料的物理化学性质,包括尺寸、表面电荷和官能团。
使用DLS测量水合粒径和zeta电位,TEM观察形貌,FTIR和XPS分析表面官能团。
验证NACore在体外形成典型淀粉样纤维并分析其结构特征。
将NACore溶解后于37°C孵育48小时,通过TEM观察纤维形态,XRD分析交叉β结构。
评估纳米塑料对NACore纤维化动力学的影响。
使用ThT荧光法监测不同浓度NACore在有无纳米塑料情况下的聚集过程,并拟合动力学参数。
验证纳米塑料对NACore单体的吸附作用。
将NACore与纳米塑料混合涡旋后离心,取上清进行UPLC-MS/MS分析,测量剩余单体量。
揭示纳米塑料对NACore寡聚体种类和分布的影响。
使用UPLC-IT-TOF-MS分析不同时间点NACore单体及寡聚体(二聚体至六聚体)的分布,并在有无纳米塑料条件下比较。
从原子层面理解纳米塑料与NACore相互作用的分子机制。
使用全原子离散分子动力学模拟研究六个NACore肽与一个聚苯乙烯分子(40个重复单元,直径约3.5 nm)的共聚集过程,分析结合频率、寡聚体尺寸及自由能景观。
评估纳米塑料对NACore诱导的神经细胞毒性的影响。
使用HMC3细胞,通过CCK-8检测细胞活力,通过流式细胞术检测凋亡,通过H2DCFDA荧光检测ROS水平。
在体内验证纳米塑料对NACore毒性的增强效应。
将NACore和/或纳米塑料显微注射到斑马鱼胚胎的动物极,观察孵化率、存活率、畸形率和ROS产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 材料 | NACore肽 | QYAOBIO | -- |
| 聚苯乙烯纳米塑料 | Mreda | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Yeasen | -- |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Yeasen | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Becton, Dickinson and Company (BD) | -- |
| 细胞活力检测 | 增强型CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 凋亡检测 | AnnexinV Alexa Fluor/PI凋亡检测试剂盒I | BD | -- |
| TEM | 日立HT7800电子显微镜 | Hitachi | -- |
| DLS | Zetasizer | Brookhaven | -- |
| FTIR | Niolet iN10光谱仪 | Thermo Fisher | -- |
| XPS | Empyrean | PANalytical | -- |
| XRD | Xeuss 2.0 | Xenocs | -- |
| Pilatus 300K | Dectris | -- | |
| ThT实验 | SPARK酶标仪 | TECAN | -- |
| LC-TOF-MS | ExionLC™系统 | AB SCIEX | -- |
| X500R飞行时间质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| 液相色谱柱(2.1 x 50 mm, 1.7 μm) | Waters | -- | |
| UPLC-MS/MS | LC-40系统 | Shimadzu | -- |
| Q-trap 6500质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| ACQUITY UPLC BEH C18色谱柱(2.1x50 mm, 1.7 μm) | Waters | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 完全培养基 | Procell | -- | |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | -- | -- |
| 凋亡检测 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 流式分析 | NovoCyte Advanteon流式细胞仪 | Agilent | -- |
| 斑马鱼实验 | 体视显微镜 | Olympus | -- |
| 气动显微注射系统(MN-153) | Narishige | -- | |
| 斑马鱼ROS检测 | 混合研磨机 | PRO Scientific | -- |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 纳米塑料表征 | PS纳米塑料尺寸(~50 nm)、zeta电位(-22.6 mV水、-35.7 mV培养基)、表面基团(-OH和PS) 阅读提示:Methods 'Characterizations of the PS nanoplastic' 以及 Figure S1 |
| ThT动力学实验 | NACore浓度(25-100 μM)、纳米塑料浓度(20-200 μg/mL)、ThT浓度(100 μM)、孵育温度(37°C)、测量间隔(4 min) 阅读提示:Methods 'Thioflavin T (ThT) kinetic assay' 和 Figure 2 |
| 质谱分析 | NACore浓度(100 μM)、纳米塑料浓度(20, 200 μg/mL)、孵育时间(20 min, 1 h, 48 h)、离心条件(20,000 g, 20 min)、超声处理(1 min) 阅读提示:Methods 'LC-TOF-MS' 和 'UPLC-MS/MS' 以及 Figure 3 |
| 分子动力学模拟 | 模拟体系:6个NACore肽和1个PS分子(40重复单元)、温度(300 K)、模拟次数(50次独立模拟) 阅读提示:Methods 'Computational analysis' 和 Figure 4 |
| 细胞实验 | HMC3细胞代数(≤15)、细胞密度(约10,000细胞/孔)、NACore浓度(50-800 μM)、纳米塑料浓度(200 μg/mL)、处理时间(24 h活力/凋亡,4 h ROS) 阅读提示:Methods 'Cell viability assay', 'ROS assay', 'Apoptosis' 和 Figure 5 |
| 斑马鱼胚胎实验 | AB野生型斑马鱼、注射时间(1 hpf)、注射体积(2 nL)、NACore浓度(100, 200 μM)、纳米塑料浓度(20, 100 μg/mL)、观察时间点(24, 72 hpf, 12 h ROS)、每组胚胎数(8)和重复次数(3) 阅读提示:Methods 'Embryonic zebrafish development assays' 和 'Embryonic ROS assay' 以及 Figure 6 |