细胞培养与药物处理
评估CUR和BBR单独及联合对HCC细胞活力的影响,并确定最佳协同浓度比。
将HEPG2和Huh7细胞培养于含10% FBS的培养基,分别用不同浓度CUR和BBR(0-200 μM)处理,以及按不同比例(1:1, 1:2, 1:4, 2:1, 4:1)联合处理48小时,通过CCK8测定细胞活力,计算IC50。
Inhibition of hepatocellular carcinoma growth via modulation of the miR-221/SOX11 axis by curcumin and berberine.
包含细胞活力、RT-qPCR、Western blot、双荧光素酶、Transwell和流式凋亡检测,但缺乏动物体内实验验证。
HEPG2人肝癌细胞系 Huh7人肝癌细胞系
CUR与BBR的最佳协同浓度比例2:1(HEPG2: 7.59 μM CUR + 3.79 μM BBR;Huh7: 13.82 μM CUR + 6.91 μM BBR) miR-221 mimic和inhibitor的转染效率(HEPG2中miR-221表达增加6.92倍,Huh7中增加3.62倍) SOX11过表达质粒的效率(mRNA增加2.10倍和3.34倍,蛋白增加1.41倍和1.55倍) 双荧光素酶实验验证miR-221与SOX11 3'UTR的直接结合(野生型荧光素酶活性降低83%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CUR和BBR单独及联合对HCC细胞活力的影响,并确定最佳协同浓度比。
将HEPG2和Huh7细胞培养于含10% FBS的培养基,分别用不同浓度CUR和BBR(0-200 μM)处理,以及按不同比例(1:1, 1:2, 1:4, 2:1, 4:1)联合处理48小时,通过CCK8测定细胞活力,计算IC50。
检测药物处理对miR-221表达的影响,并验证miR-221在CUR-BBR抑制细胞存活中的作用。
通过RT-qPCR检测miR-221表达;使用Lipofectamine 2000转染miR-221 mimic或inhibitor及其阴性对照,然后进行CCK8细胞存活实验。
验证miR-221对SOX11的靶向调控,并评估SOX11过表达对CUR-BBR效应的影响。
通过生物信息学预测miR-221下游靶标,RT-qPCR和Western blot检测SOX11表达;转染SOX11过表达质粒后,检测miR-221和SOX11表达变化。
验证miR-221是否直接靶向SOX11的3'UTR。
将包含SOX11 3'UTR野生型(WT)或突变型(mut)的荧光素酶报告质粒与miR-221 mimic共转染,48小时后检测荧光素酶活性。
评估CUR-BBR通过miR-221/SOX11轴对凋亡、迁移和侵袭的影响。
Western blot检测cleaved caspase-3和cleaved caspase-9蛋白水平;Transwell实验检测迁移和侵袭;流式细胞术检测凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 最低必需培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 姜黄素 | Sigma-Aldrich | C1386 |
| 小檗碱 | Sigma-Aldrich | 08511 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| miR-221模拟物、抑制剂及阴性对照 | GenePharma Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 细胞存活实验 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| SOX11抗体 | Abcam | ab170916 | |
| cleaved caspase-3抗体 | Abcam | ab32042 | |
| cleaved caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 9505 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 山羊抗兔IgG | Abcam | ab6721 | |
| ECL Western blot底物 | Pierce | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶实验 | Promega | -- |
| Transwell实验 | 基质胶 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、细胞密度、处理时间、药物浓度和比例 阅读提示:Methods中'Cell culture and transfection'部分 |
| 细胞转染 | 转染试剂、转染时间、miR-221 mimic/inhibitor序列 阅读提示:Methods中'Cell culture and transfection'部分及Table 1 |
| RT-qPCR | RNA提取试剂、逆转录试剂盒、SYBR Green预混液、引物序列、反应条件、内参基因 阅读提示:Methods中'RT-qPCR assay'部分及Table 2 |
| Western blot | 一抗稀释比例、二抗稀释比例、封闭条件、曝光条件 阅读提示:Methods中'Western blotting'部分 |
| 双荧光素酶报告实验 | 报告基因质粒、共转染条件、检测时间 阅读提示:Methods中'Dual-luciferase reporter assay'部分 |
| 凋亡检测 | 凋亡试剂盒、流式细胞仪、数据分析软件 阅读提示:Methods中'Detection of cell apoptosis'部分 |