外泌体的分离与表征
获得并验证MSC来源外泌体的纯度和特征,确保后续实验使用合格的外泌体。
收集UC-MSC细胞上清,通过差速超速离心法分离外泌体,并通过Western blot检测表面标志物(Alix, CD9, CD63, CD81),TEM观察形态,NTA分析粒径分布。
MSC-derived exosomes protect auditory hair cells from neomycin-induced damage via autophagy regulation.
包含体外模型(HEI-OC1细胞、耳蜗外植体)、体内动物模型(小鼠),并通过自噬抑制剂和基因敲除进行功能验证,且明确机制验证。
新生小鼠耳蜗外植体 HEI-OC1细胞系 C57BL/6小鼠新霉素致聋模型 CAG-RFP-EGFP-LC3转基因小鼠
新霉素剂量与给药方式(体内:200 mg/kg皮下注射五天;体外:耳蜗外植体0.5 mM处理24小时,HEI-OC1细胞2 mM处理24小时) 外泌体剂量(体内:20 μg/10 μl PBS圆窗龛注射;体外:30 μg/ml处理24小时) 自噬抑制剂3-MA的使用(体内:30 mg/kg腹腔注射三次;体外:5 mM处理16小时) 内吞抑制剂dynasore(80 μM预处理4小时)和cytochalasin D(2 μM预处理30分钟) 样本量(体内实验每组6只小鼠)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证MSC来源外泌体的纯度和特征,确保后续实验使用合格的外泌体。
收集UC-MSC细胞上清,通过差速超速离心法分离外泌体,并通过Western blot检测表面标志物(Alix, CD9, CD63, CD81),TEM观察形态,NTA分析粒径分布。
评估外泌体对小鼠新霉素诱导听力损伤的保护作用。
建立新霉素致聋小鼠模型,通过圆窗龛注射外泌体,检测ABR阈值变化和毛细胞存活情况(免疫荧光染色)。
在细胞和器官水平上验证外泌体对毛细胞的直接保护作用。
使用耳蜗外植体和HEI-OC1细胞,经新霉素损伤后给予外泌体处理,检测细胞存活、ROS水平和凋亡率。
探究外泌体是否影响毛细胞自噬。
通过Western blot检测自噬相关蛋白(LC3, SQSTM1/p62, BECN1),TEM观察自噬泡,使用mRFP-GFP-LC3报告系统和CQ处理评估自噬流。
验证自噬是否介导外泌体的保护作用。
使用自噬抑制剂3-MA或敲低Atg5,检测外泌体的保护效应是否减弱。
探究外泌体是否通过内吞作用调节自噬。
检测外泌体与内体的共定位,检测内吞相关基因和蛋白表达,使用内吞抑制剂(dynasore和cytochalasin D)评估对自噬的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Sijiqing | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 组织解剖 | Hank's平衡盐溶液 | Solabio | H1045 |
| 组织培养 | 基础培养基Eagle | Sigma | B9638 |
| 碳酸钠 | Sigma | S7795 | |
| I型胶原凝胶 | Corning | 354,236 | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| N2添加剂 | Gibco | 17502048 | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 药物处理 | 硫酸新霉素 | Sigma-Aldrich | N6386 |
| 氯喹 | MCE | HY-17589A | |
| 3-甲基腺嘌呤 | MCE | HY-19312 | |
| Dynasore | MCE | HY-13863 | |
| 细胞松弛素D | MCE | HY-N6682 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 一抗Alix | Cell Signaling | 92880 | |
| 一抗CD9 | Abcam | ab236630 | |
| 一抗CD63 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5275 | |
| 一抗CD81 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9158 | |
| 一抗GAPDH | CWBIO | CW0100 | |
| 一抗裂解的Caspase-3 | Cell Signaling | 9661s | |
| 一抗LC3A/B | Cell Signaling | 12741 | |
| 一抗SQSTM1/p62 | HUABIO | HA721171 | |
| 一抗BECN1 | Cell Signaling | 3495S | |
| 一抗CAV2 | Abcam | ab133484 | |
| 一抗EEA1 | Abcam | ab109110 | |
| 外泌体分离 | Zeta View PMX 110 | Particle Metrix | -- |
| 外泌体表征 | 透射电子显微镜TECNAI Spirit | FEI | -- |
| 外泌体内化 | PKH26红色荧光细胞连接试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 一抗Myosin7a | Proteus Biosciences | 25-6790 | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG | Jackson | 111-095-003 | |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG | Jackson | 111-165-003 | |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| 罗丹明-鬼笔环肽 | Cytoskeleton | PHDR1 | |
| 氧化应激检测 | Mito-SOX Red | Invitrogen | M36008 |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂盒 | Beyotime | C1090 |
| 基因敲低 | 靶向ATG5的siRNA | RiBOBIO | -- |
| Advanced DNA RNA转染试剂 | Zeta Life | -- | |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Prime Script RT试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green染料 | TaKaRa | -- | |
| 热循环仪C1000 | Bio-Rad | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| 流式细胞仪 | Beckman-Coulter | -- | |
| 电镜 | 锇酸 | -- | -- |
| 环氧树脂812 | -- | -- | |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| ABR检测 | Tucker-Davis Technology RZ6系统 | Tucker-Davis Technologies | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | 7.0 |
| 动物实验 | CAG-RFP-EGFP-LC3转基因小鼠 | Jackson Laboratory | 027139 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内模型建立 | 新霉素剂量和给药方式:200 mg/kg皮下注射连续5天;外泌体剂量和给药途径:20 μg/10 μl PBS经圆窗龛注射;小鼠品系和年龄:C57BL/6,7日龄;样本量:n=6 阅读提示:Methods: Animals 部分 |
| 体外模型建立 | 耳蜗外植体培养条件:DMEM/F12 + N2/B27,37°C,5% CO2;新霉素浓度和时间:0.5 mM,24小时;外泌体浓度和时间:30 μg/ml,24小时;HEI-OC1细胞:高糖DMEM + 10% FBS,33°C,10% CO2;新霉素浓度和时间:2 mM,24小时;外泌体浓度和时间:30 μg/ml,24小时 阅读提示:Methods: Cell culture, tissue culture and reagents 部分 |
| 自噬抑制实验 | 3-MA剂量和给药方式:体内30 mg/kg腹腔注射(24小时前、2小时前、处理后立即三次);体外5 mM处理16小时;验证抑制效率:Western blot检测LC3-II和SQSTM1/p62水平; 阅读提示:Methods: Animals 部分和 Figure legends (Fig. 4A) 与结果部分 |
| 内吞抑制实验 | dynasore浓度和预处理时间:80 μM,4小时;cytochalasin D浓度和预处理时间:2 μM,30分钟;验证抑制效率:Western blot检测CAV2和EEA1; 阅读提示:Figure legends (Fig. 6) 和结果部分 |
| 自噬流检测 | mRFP-GFP-LC3报告系统:感染MOI 25,72小时;CQ浓度:20 μM;观察时间点:4, 12, 24小时; 阅读提示:Methods: Immunofluorescence 部分和 Figure legends (Fig. 3G) |