SCIN 表达及临床意义分析
评估 SCIN 在胶质瘤中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
基于 GEPIA 和 CGGA 数据库分析 SCIN mRNA 表达与胶质瘤分级、IDH 突变、1p/19q 共缺失及总生存期的关系;通过 qRT-PCR 和免疫组化验证临床组织中的 SCIN 表达。
Scinderin promotes glioma cell migration and invasion via remodeling actin cytoskeleton.
研究结合数据库分析、细胞功能实验(CCK8、克隆形成、伤口愈合、Transwell)和机制验证(Western blot、F-actin 染色及抑制剂回复实验),涵盖多个证据层级。
U87 MG 人胶质母细胞瘤细胞系 U251 人胶质瘤细胞系
SCIN 表达水平(qRT-PCR、Western blot) shRNA 敲低效率(sh-SCIN#3) 细胞增殖、迁移、侵袭实验(CCK8、克隆形成、伤口愈合、Transwell) F-actin 骨架形态(F-actin 染色) RhoA/FAK 信号通路蛋白表达(Western blot)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估 SCIN 在胶质瘤中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
基于 GEPIA 和 CGGA 数据库分析 SCIN mRNA 表达与胶质瘤分级、IDH 突变、1p/19q 共缺失及总生存期的关系;通过 qRT-PCR 和免疫组化验证临床组织中的 SCIN 表达。
建立 SCIN 稳定敲低的胶质瘤细胞模型,用于后续功能实验。
使用靶向 SCIN 的 shRNA(sh-SCIN#1、#2、#3)转染 U87 和 U251 细胞,通过 Western blot 和 qRT-PCR 检测敲低效率。
验证 SCIN 对胶质瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。
采用 CCK8 和克隆形成实验检测细胞增殖;伤口愈合实验检测迁移;Transwell 侵袭实验检测侵袭能力。
探究 SCIN 敲低对胶质瘤细胞 F-actin 聚合状态和细胞形态的影响。
使用 F-actin 染色试剂盒(Phalloidin-Green)对细胞进行免疫荧光染色,观察 F-actin 应力纤维的排列和形态。
检测 SCIN 敲低对 RhoA/FAK 信号通路关键蛋白表达和磷酸化水平的影响。
通过 Western blot 检测 RhoA、FAK、p-FAK、Cofilin、p-Cofilin 和 Talin 的表达水平。
验证 RhoA/FAK 信号通路是否介导 SCIN 对胶质瘤细胞迁移和侵袭的促进作用。
在 SCIN 过表达的 U87 和 U251 细胞中,分别加入 FAK 抑制剂 PF-573228 或 RhoA 抑制剂 CCG1423,随后进行伤口愈合和 Transwell 侵袭实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM 培养基 | -- | -- |
| DMEM 培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 转染试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA 裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA 蛋白定量试剂盒 | Solarbio | -- | |
| PVDF 膜 | Whatman | -- | |
| HRP 标记二抗 | Proteintech | 1:5000 | |
| SCIN 抗体 | Proteintech | -- | |
| RhoA 抗体 | Proteintech | -- | |
| GAPDH 抗体 | Proteintech | -- | |
| FAK 抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化 FAK 抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化 Cofilin (Ser3) 抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Cofilin 抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| Talin 抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol 试剂 | ThermoFisher | -- |
| SuperScript III 逆转录酶 | ThermoFisher | -- | |
| PCR 扩增试剂盒 | ThermoFisher | -- | |
| SCIN 引物 | Sangon Biotech | -- | |
| 细胞增殖 | CCK8 细胞增殖与细胞毒性检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 克隆形成 | 结晶紫溶液 | -- | -- |
| Transwell 侵袭 | 基质胶 | Corning Costar | -- |
| F-actin 染色 | F-actin 染色试剂盒(Phalloidin-Green) | AmyJet Scientific | -- |
| DAPI 溶液 | -- | -- | |
| Transwell 侵袭 | 倒置显微镜 | Olympus | -- |
| 实验处理 | PF-573228 | -- | -- |
| CCG1423 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:Procell(武汉),U87 MG 使用 MEM 培养基,U251 使用 DMEM 培养基,添加 10% FBS 和 1% 青霉素/链霉素,37°C、5% CO2 培养 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Cell culture 部分 |
| 细胞转染 | sh-SCIN 质粒来自上海吉玛制药技术有限公司,使用 Lipofectamine 2000 以 50 nM 浓度转染,嘌呤霉素筛选稳定克隆 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Cell transfection 部分 |
| 细胞增殖 | CCK8 试剂盒来源:Solarbio;克隆形成实验细胞接种密度 1×10^3 细胞/孔,培养 14 天 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Cell Counting Kit-8 assay 和 Colony formation assay 部分 |
| 细胞迁移 | 伤口愈合实验在血清饥饿条件下进行,观察时间点 24 或 48 小时 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Wound-healing assay 部分 |
| 细胞侵袭 | Transwell 小室预包被 Matrigel,上室加入 1×10^3 个细胞(100 μL 无血清培养基),下室含 10% FBS 培养基,侵袭 6 小时 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Transwell invasion assay 部分 |
| F-actin 染色 | 细胞固定使用 4% 多聚甲醛冰上 20 分钟,透化 0.1% Triton X-100 室温 10 分钟,染色液孵育 30 分钟,DAPI 染核 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 F-actin labeling 部分 |
| 信号通路验证 | Western blot 检测 RhoA、FAK、p-FAK、Cofilin、p-Cofilin 和 Talin;抗体来源:Proteintech 和 Cell Signaling Technology;抑制剂 PF-573228 和 CCG1423 浓度文中未明确说明 阅读提示:参照 Materials and Methods 中 Western blot 部分和 Results 中相应结果描述 |