KIF18A在肝纤维化中的表达分析
探究KIF18A在肝纤维化组织和HSC中的表达变化。
利用GEO数据集(GSE197112)分析差异表达基因;收集人肝纤维化组织和正常肝组织,通过qRT-PCR、Western blot和免疫组化检测KIF18A表达;建立CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型,检测KIF18A表达;分离小鼠原代HSC并检测KIF18A表达。
KIF18A inactivates hepatic stellate cells and alleviates liver fibrosis through the TTC3/Akt/mTOR pathway.
包含体外细胞实验(LX-2、原代HSC)、体内动物模型(CCl4诱导)、免疫共沉淀、泛素化分析、ChIP和双荧光素酶报告基因等,并进行了功能验证和机制验证。
人肝星状细胞系LX-2 小鼠原代肝星状细胞 CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 人肝纤维化组织样本
KIF18A在肝纤维化组织及活化HSC中的表达下调 KIF18A敲低对HSC增殖和凋亡的影响 KIF18A过表达对CCl4诱导小鼠肝纤维化的影响 KIF18A与TTC3的直接结合及对p-AKT泛素化的影响 YY1对KIF18A转录的调控作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究KIF18A在肝纤维化组织和HSC中的表达变化。
利用GEO数据集(GSE197112)分析差异表达基因;收集人肝纤维化组织和正常肝组织,通过qRT-PCR、Western blot和免疫组化检测KIF18A表达;建立CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型,检测KIF18A表达;分离小鼠原代HSC并检测KIF18A表达。
验证KIF18A表达水平对HSC细胞增殖和凋亡的调控作用。
在LX-2细胞中通过慢病毒转染敲低或过表达KIF18A,通过CCK-8、EdU和流式细胞术检测细胞增殖和凋亡。
在体内验证KIF18A对肝纤维化进程的调控作用。
通过尾静脉注射AAV敲低或过表达KIF18A,检测纤维化标志物(Col1A1、Timp1、Tgfβ1、Stat1)的表达,并通过Masson三色染色和α-SMA免疫组化评估肝纤维化程度。
探究KIF18A调控HSC活化的分子机制,特别是在AKT/mTOR通路中的作用。
通过Western blot检测KIF18A敲低或过表达对AKT/mTOR通路蛋白表达的影响;通过免疫共沉淀和质谱筛选与KIF18A相互作用的蛋白,验证TTC3与KIF18A的结合;通过Western blot检测TTC3对p-AKT水平的影响。
阐明KIF18A如何通过TTC3调控p-AKT泛素化和降解。
通过泛素化实验检测TTC3对p-AKT泛素化的影响;通过免疫共沉淀检测KIF18A对TTC3与p-AKT结合的影响。
探究KIF18A在肝纤维化中表达下调的上游转录调控机制。
通过数据库预测KIF18A的转录因子,通过ChIP和双荧光素酶报告基因实验验证YY1与KIF18A启动子区域的结合,并检测YY1对KIF18A表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Pricella | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Jet PEI转染试剂 | Polyplus Transfection | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Beyotime | R0016 |
| 反转录 | 反转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| RT-qPCR | SYBR Mix | Vazyme | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Thermo Fisher | 88518 |
| ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| Tanon成像系统 | Tanon Science and Technology | -- | |
| 免疫组织化学 | COL1A1即用型免疫组化试剂盒 | Proteintech | KHC0205 |
| STAT1即用型免疫组化试剂盒 | Proteintech | KHC1036 | |
| DAB显色试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| Timp1抗体 | Proteintech | 16644-1-AP | |
| Tgfβ1抗体 | Proteintech | 21898-1-AP | |
| 组织染色 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 细胞增殖检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| EdU染色试剂盒 | Beyotime | C0071S | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062S |
| 流式分析 | Beckman CytoFlex流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 免疫沉淀 | A/G琼脂糖珠 | Life Technologies | -- |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 动物模型 | 橄榄油 | -- | -- |
| 腺相关病毒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| KIF18A表达分析 | KIF18A在肝纤维化组织和HSC中的表达水平(mRNA和蛋白) 阅读提示:Methods: RT-qPCR、Western blotting、Immunohistochemistry;Results: KIF18A expression is downregulated in liver fibrosis |
| 细胞增殖和凋亡实验 | KIF18A敲低或过表达后,LX-2细胞和原代HSC的增殖能力(CCK-8、EdU)和凋亡率(流式细胞术) 阅读提示:Methods: Cell proliferation assays、Cell apoptosis;Results: KIF18A knockdown promotes the proliferation and decreases apoptosis of HSCs, KIF18A overexpression inhibits cell proliferation and promotes apoptosis of HSCs |
| 动物模型建立与AAV注射 | CCl4诱导肝纤维化模型的剂量、频率、持续时间和小鼠品系;AAV注射的剂量、方式和时间 阅读提示:Methods: Mouse models of liver fibrosis |
| 机制验证实验 | KIF18A与TTC3的直接结合(Co-IP);KIF18A对p-AKT泛素化的影响;KIF18A对TTC3与p-AKT相互作用的影响 阅读提示:Methods: Immunoprecipitation (IP) and ubiquitination assays;Results: KIF18A regulates the AKT/mTOR pathway and directly binds to TTC3, KIF18A promotes p-AKT ubiquitination by enhancing binding between TTC3 and p-AKT |
| 转录调控实验 | YY1与KIF18A启动子区域的结合位点(ChIP、双荧光素酶报告基因);YY1对KIF18A表达的调控 阅读提示:Methods: Chromatin immunoprecipitation assay;Results: YY1 is a transcription factor regulating KIF18A transcription |