临床样本中KLF15表达分析
比较EM患者与正常女性子宫内膜中KLF15的表达差异。
分析GSE6364数据集中KLF15 mRNA表达;收集EM患者和不孕患者的在位子宫内膜样本,通过免疫组化和RT-qPCR检测KLF15表达。
Loss of KLF15 impairs endometrial receptivity by inhibiting EMT in endometriosis.
研究包含患者子宫内膜样本分析、大鼠体内模型、Ishikawa细胞体外功能实验、ChIP-qPCR和RNA-seq等多层级验证。
子宫内膜异位症患者子宫内膜样本 子宫内膜异位症大鼠模型 Ishikawa人子宫内膜腺癌细胞系 JAR人滋养层细胞球体
KLF15在EM患者分泌中期子宫内膜上皮细胞中的表达 大鼠子宫角注射KLF15 siRNA后胚胎着床数 MPA和RU486处理对Ishikawa细胞KLF15表达的影响 KLF15与TWIST2启动子区的结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较EM患者与正常女性子宫内膜中KLF15的表达差异。
分析GSE6364数据集中KLF15 mRNA表达;收集EM患者和不孕患者的在位子宫内膜样本,通过免疫组化和RT-qPCR检测KLF15表达。
验证KLF15下调是否导致胚胎着床失败。
构建EM大鼠模型,在妊娠第4天向左侧子宫角注射KLF15 siRNA,右侧注射对照siRNA,妊娠第7天观察胚胎着床数,并通过Western blot和IHC验证敲低效率。
通过体外模型验证KLF15敲低或过表达对胚胎附着能力的影响。
Ishikawa细胞稳定敲低或过表达KLF15,与JAR球体共培养,计算附着率。
探究孕激素信号对KLF15表达的调控及PGR是否直接结合KLF15启动子。
用不同浓度MPA和/或RU486处理Ishikawa细胞,检测KLF15表达;通过双荧光素酶报告基因和ChIP-qPCR验证PGR结合KLF15启动子。
验证KLF15对子宫内膜上皮细胞EMT及侵袭迁移能力的影响。
在Ishikawa细胞中敲低或过表达KLF15,检测EMT标志物表达,并通过划痕愈合和Transwell实验评估迁移和侵袭能力。
鉴定KLF15调控EMT的下游靶基因。
对KLF15敲低和对照Ishikawa细胞进行RNA-seq,筛选差异表达基因,通过RT-qPCR验证,并通过ChIP-qPCR验证KLF15与TWIST2启动子结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Procell | -- |
| 活性炭剥离胎牛血清 | Clark Bioscience | -- | |
| 药物处理 | 醋酸甲羟孕酮 | -- | -- |
| 米非司酮 | -- | -- | |
| 转染 | 脂质体转染试剂3000 | Invitrogen | -- |
| 脂质体转染试剂2000 | -- | -- | |
| 载体构建 | pCDH慢病毒载体 | -- | -- |
| pcDNA3.1+载体 | -- | -- | |
| 细胞功能实验 | 基质胶 | -- | -- |
| 细胞免疫荧光 | DAPI染料 | Sigma | -- |
| 免疫组化 | 超敏SP免疫组化试剂盒 | Fuzhou Maixin Biotechnology Development Co., Ltd. | -- |
| 免疫组化/免疫印迹 | 抗KLF15抗体 | Abcam | -- |
| 免疫组化 | 抗PGR抗体 | Fuzhou Maixin Biotechnology Development Co., Ltd. | -- |
| 免疫荧光 | 抗波形蛋白抗体 | Proteintech | -- |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | -- | |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG | Sigma | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG | Sigma | -- | |
| RNA提取 | EASY spin组织/细胞RNA快速提取试剂盒 | Aidlab Biotechnologies Co., Ltd. | -- |
| 逆转录PCR | Prime ScriptTM逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- |
| RT-qPCR | SYBR® Premix Ex-Taq™ | TaKaRa | -- |
| Step One™实时PCR系统 | Life Technologies | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| 快速封闭液 | Beyotime | -- | |
| 抗PGR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 抗KLF15抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 抗TWIST2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 抗波形蛋白抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| 增强型ECL化学发光检测试剂盒 | Vazyme | -- | |
| Tanon 5200 ECL化学发光成像系统 | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测 | pGL3质粒 | -- | -- |
| pRL-SV40质粒 | Promega | -- | |
| 被动裂解缓冲液 | Promega | -- | |
| GloMax 20/20发光检测仪 | Promega | -- | |
| ChIP-qPCR | Simple ChIP Plus超声染色质免疫沉淀试剂盒 | CST | 56383 |
| 抗PGR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 抗KLF15抗体 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | KLF15在分泌中期子宫内膜上皮中的表达;样本量:EM组和对照组各12例(增殖期和分泌中期各6例) 阅读提示:Materials and methods 中 Human endometrium samples 和 Results 中 'KLF15 expression is decreased in EM patients with infertility' |
| 动物模型 | EM大鼠模型的建立方法;KLF15 siRNA注射的时间(GD4)、剂量(50 μL, 10 μM)和部位(左子宫角) 阅读提示:Materials and methods 中 Animals and endometriosis induction 和 Results 图2图例 |
| 激素处理 | MPA浓度(0, 1×10^-5 M, 1×10^-7 M, 1×10^-9 M);RU486浓度(10 μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods 中 Culture of Ishikawa cells and hormone treatment |
| 体外功能实验 | Transwell实验中细胞浓度(1×10^5/mL)和培养时间(24小时);划痕实验观察时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods 中 Migration and invasion assay 和 Scratch wound healing assay |
| ChIP-qPCR | KLF15在TWIST2启动子上的结合位点(PP2);PGR在KLF15启动子上的结合位点(KLF15-PRE-BE,bp -1135至-1128) 阅读提示:Materials and methods 中 Chromatin immunoprecipitation assay 和 Results 图3C、图8B |