检测BHB对PCa细胞增殖、迁移和侵袭的影响
验证BHB对PCa细胞体外恶性表型的抑制作用
使用CCK8、集落形成、流式细胞术、Transwell实验和Western blot检测BHB处理后的细胞活力、增殖、细胞周期、凋亡、迁移、侵袭和EMT标志物表达。
β-hydroxybutyrate inhibits malignant phenotypes of prostate cancer cells through β-hydroxybutyrylation of indoleacetamide-N-methyltransferase.
包含体外细胞系实验(CCK8、集落形成、流式、Transwell、Western blot)、机制验证(m6A meRIP、双荧光素酶、Co-IP)和体内小鼠异种移植模型,且同时包含功能验证和机制验证。
PC3人前列腺癌细胞系 LNCaP人前列腺癌细胞系 DU145人前列腺癌细胞系 LNCaP细胞皮下异种移植裸鼠模型
BHB处理浓度:细胞实验为0、15、25 mM,小鼠为100 mg/kg p300抑制剂A485浓度:细胞实验为2.5 µM,小鼠为30 mg/kg INMT敲低和过表达细胞株的构建(使用shRNA和过表达质粒) 异种移植模型:5×10^6 LNCaP细胞皮下注射,每组7只小鼠,治疗持续25-30天 检测指标:肿瘤体积、体重、Ki-67免疫组化、骨转移发生率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证BHB对PCa细胞体外恶性表型的抑制作用
使用CCK8、集落形成、流式细胞术、Transwell实验和Western blot检测BHB处理后的细胞活力、增殖、细胞周期、凋亡、迁移、侵袭和EMT标志物表达。
验证BHB是否抑制PCa细胞的干细胞样特性
通过肿瘤球形成实验、ALDH实验、qPCR和Western blot检测干性标志物表达。
确认INMT作为致癌基因通过SOX2促进PCa细胞干性
在LNCaP和PC3细胞中过表达或敲低INMT,检测肿瘤球形成、ALDH活性、干性标志物表达及SOX2启动子活性。
证明INMT的表达受METTL3介导的m6A修饰调控
检测METTL3表达,敲低或过表达METTL3后检测INMT表达,m6A meRIP qRT-PCR和双荧光素酶实验验证INMT 3'UTR的m6A修饰。
验证BHB通过INMT的kbhb修饰抑制其表达和功能,并确定调控kbhb的酶
用Co-IP和Western blot检测外源和内源INMT的kbhb,并用p300抑制剂A485、HDAC1和HDAC2过表达处理来筛选相关酶。
证明BHB介导的INMT kbhb是抑制PCa恶性表型的关键机制
使用p300抑制剂A485逆转BHB的作用,检测INMT表达、集落形成、迁移和侵袭能力。
在动物模型中验证BHB抑制肿瘤生长和转移,并确认依赖于INMT kbhb
建立LNCaP皮下异种移植和骨转移模型,BHB和/或A485处理后检测肿瘤体积、重量、Ki-67、骨转移发生率及干性和EMT标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 角质细胞无血清培养基 | Invitrogen | 17005042 | |
| 潮霉素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | β-羟基丁酸 | Sigma-Aldrich | 52017 |
| A485 | Sigma-Aldrich | SML2192 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778030 | |
| 质粒构建 | pGL3荧光素酶报告质粒 | Promega | E1751 |
| pFlag-CMV2表达载体 | Sigma-Aldrich | E7033 | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂盒 | Abcam | ab228554 |
| 细胞凋亡检测 | FITC/Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | 556547 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 细胞迁移侵袭 | Transwell小室 | Corning | CLS3464 |
| 基质胶 | Millipore | E1270 | |
| 结晶紫 | Sigma-Aldrich | C0775 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 增强型蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0010S | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| BeyoECL plus化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018M | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Beyotime | R0016 |
| Maxima H Minus第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | K1682 | |
| SYBR Green荧光染料 | Takara | RR820A | |
| ABI-7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 肿瘤球形成 | DMEM/F-12培养基 | Invitrogen | 12634028 |
| B27添加剂 | Invitrogen | 17504044 | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | E9644 | |
| 成纤维细胞生长因子 | Gibco | 13256-029 | |
| ALDH实验 | ALDEFLUOR试剂盒 | Stem Cell Technologies | 01700 |
| m6A meRIP | m6A MeRIP试剂盒 | Millipore | 17-10499 |
| anti-m6A抗体 | Invitrogen | MA5-33030 | |
| 蛋白A/G磁珠 | Thermo Scientific | 88803 | |
| N6-甲基腺苷-5'-单磷酸钠盐 | -- | -- | |
| RNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74004 | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因试剂盒 | Promega | E1910 |
| 蛋白质纯化 | Anti-Flag M2磁珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| Flag多肽 | Sigma-Aldrich | F4799 | |
| Western blot | Anti-SLUG抗体 | Abcam | ab27568 |
| Anti-TWIST1抗体 | Cell Signaling Technology | 90445 | |
| Anti-E-cadherin抗体 | Abcam | ab231303 | |
| Anti-vimentin抗体 | Sigma-Aldrich | V6630 | |
| Anti-snail抗体 | Sigma-Aldrich | SAB5700806 | |
| Anti-ZEB1抗体 | Abcam | ab276129 | |
| Anti-ZEB2抗体 | Abcam | ab191364 | |
| Anti-GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| Anti-SOX2抗体 | Cell Signaling Technology | 14962 | |
| Anti-BMI1抗体 | Abcam | ab269678 | |
| Anti-CD133抗体 | Abcam | ab284389 | |
| Anti-KLF4抗体 | Abcam | ab129473 | |
| Anti-β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| Anti-INMT抗体 | Abcam | ab181854 | |
| Anti-METTL3抗体 | Abcam | ab195352 | |
| Anti-METTL14抗体 | Abcam | ab220030 | |
| Anti-ALKBH5抗体 | Abcam | ab195376 | |
| Anti-FTO抗体 | Abcam | ab280081 | |
| Anti-Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| Anti-pan BHB-赖氨酸抗体 | PTM BioLabs | PTM-1201RM | |
| 细胞转染(shRNA) | 对照shRNA | Sigma-Aldrich | SHC016 |
| INMT shRNA | Sigma-Aldrich | EHU138831 | |
| 动物实验 | 基质胶(用于异种移植) | Corning | 354234 |
| 流式细胞术 | BD FACSAria II流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:PC3、LNCaP、DU145、RWPE-1和HEK293E的具体培养基和添加剂 阅读提示:Methods - Cell culture |
| BHB处理 | BHB浓度(体外0、15、25 mM,体内100 mg/kg)和处理时长(24-48小时) 阅读提示:Methods - Chemicals and antibodies |
| 细胞功能实验 | CCK8、集落形成、细胞周期、凋亡和Transwell实验的细胞接种密度、BHB浓度和处理时间 阅读提示:Methods - Cell viability assay, Colony formation assay, Cell cycle analysis, Cell apoptosis analysis, Transwell |
| 干性评估 | 肿瘤球形成实验的细胞密度(800 cells/well)、培养时间(7-15天),ALDH实验的细胞数和底物孵育时间 阅读提示:Methods - Tumor sphere formation assay, Aldehyde dehydrogenase (ALDH) assay |
| m6A机制验证 | METTL3 siRNA序列、双荧光素酶报告基因的构建(INMT 3'UTR野生型和突变型)和检测方法 阅读提示:Methods - Transfection, plasmids, and siRNA; Methods - m6A meRIP qRT–PCR; Methods - Dual luciferase reporter assays |
| INMT kbhb检测 | BHB和A485浓度、处理时间、免疫沉淀和Western blot所用抗体(anti-BHB-K, anti-INMT) 阅读提示:Methods - Evaluation of kbhb of INMT |
| 体内异种移植实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(5周)、体重(18-22g)、细胞接种数(5×10^6)、分组(每组7只)、给药剂量(BHB 100mg/kg, A485 30mg/kg)、给药方式(腹腔注射)及持续时间(25-30天) 阅读提示:Methods - Mouse xenograft assays |
| 统计分析 | 统计方法(配对双尾Student t检验)、数据表示(mean±SD)、显著性水平(p<0.05) 阅读提示:Methods - Statistical analysis |