诱导细胞凋亡和ICD标志物分析
验证RA/IFNα处理是否在MCL和DLBCL细胞中诱导免疫原性细胞死亡。
用RA(1 μmol/L)和IFNα(1000 U/ml)处理Mino、SP53、DOHH2细胞5天,通过Annexin V/PI染色和Western blot检测凋亡,通过流式细胞术和ELISA评估ICD标志物(ecto-CRT、HSP70/90、HMGB1)和CD47表达。
Exploiting a new strategy to induce immunogenic cell death to improve dendritic cell-based vaccines for lymphoma immunotherapy.
包含体外细胞系实验、小鼠体内实验和RNA-seq转录组分析,并进行了功能验证(细胞毒、吞噬)和机制验证(NF-kB、细胞因子)。
Mino、SP53和Granta 519套细胞淋巴瘤细胞系 DOHH2弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞系 A20小鼠淋巴瘤细胞系 hu-PBL-NOD-scid小鼠模型
RA/IFNα处理浓度:1000 U/ml IFN-α和1 μmol/L 9-cis-RA 处理时间:5天(诱导凋亡和TCL制备) TCL制备方法:3次快速冻融循环 DC脉冲条件:100 μg TCL负载10^6个IFN-DC 体内疫苗接种方案:每4天、7天、14天注射2×10^6个负载TCL的IFN-DC
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证RA/IFNα处理是否在MCL和DLBCL细胞中诱导免疫原性细胞死亡。
用RA(1 μmol/L)和IFNα(1000 U/ml)处理Mino、SP53、DOHH2细胞5天,通过Annexin V/PI染色和Western blot检测凋亡,通过流式细胞术和ELISA评估ICD标志物(ecto-CRT、HSP70/90、HMGB1)和CD47表达。
从RA/IFNα处理后的淋巴瘤细胞制备肿瘤细胞裂解物(TCL),并验证其免疫原性。
对处理或未处理的细胞进行3次冻融循环制备TCL,通过Western blot检测ICD标志物、ATP释放和DC吞噬实验验证TCL的免疫原性。
评估负载RA/IFNα-TCL的IFN-DC能否有效诱导肿瘤特异性CTL和辅助T细胞反应。
用TCL脉冲IFN-DC,与自体T细胞共培养,每周再刺激,共4次,然后进行细胞毒性实验(calcein-AM释放)和免疫表型分析(Th1、Th17、Treg)。
研究RA/IFNα-TCL对DC成熟和激活的影响。
通过RNA-seq分析TCL脉冲DC的基因表达,通过吞噬实验(DQ-OVA)和细胞因子ELISA评估功能成熟,通过NF-kB核转位实验评估信号通路激活。
在免疫缺陷小鼠模型中评估RA/IFNα-TCL脉冲DC疫苗的治疗潜力。
建立hu-PBL-NOD-scid小鼠模型,接种人淋巴瘤细胞系(Mino),进行三次疫苗接种,监测肿瘤生长、体重和血清细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | 人干扰素α (IntronA) | SP Europe | -- |
| 9-顺式维甲酸 | Sigma | -- | |
| 重组小鼠干扰素α | Miltenyi Biotec GmbH | -- | |
| 多柔比星 | Sigma | -- | |
| Western blot | HSP70抗体 | Cell Signaling Technology | 4872 |
| HSP90抗体 | Cell Signaling Technology | 4874 | |
| p-eIF2-α抗体 | Cell Signaling Technology | 9721 | |
| eIF2-α抗体 | Cell Signaling Technology | 9722 | |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| PARP-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC8007 | |
| tubulin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC9104 | |
| 人钙网蛋白抗体 | Abcam | ab2907 | |
| DC脉冲 | 人钙网蛋白抗体[EPR3924]低内毒素无叠氮 | Abcam | ab211962 |
| Western blot | 小鼠钙网蛋白抗体 | Abcam | ab196159 |
| Noxa抗体 | Abcam | ab13654 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 兔IgG同型对照抗体 | Abcam | ab199093 | |
| HMGB1 1D9抗体 | Abnova | H00003146-M06 | |
| HRP标记二抗 | Bethyl laboratories | A120-111P | |
| 流式细胞术 | CD3 FITC抗体 | BD Biosciences | -- |
| CD4 PeCy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD8 BV421抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD25 APC抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD45RA AlexaFluor700抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD127 PerCP-Cy5.5抗体 | BD Biosciences | -- | |
| Ki-67 Pe-Cy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| TNF-α PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| IFN-γ PeCy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| IL-17 AlexaFluor647抗体 | BD Biosciences | -- | |
| HLA DR-PE抗体 | BD Biosciences | 555812 | |
| CD47-AlexaFluor647抗体 | BD Biosciences | 561249 | |
| CD11c-PE抗体 | Beckman Coulter | IM1760 | |
| CD11c-PC5抗体 | Beckman Coulter | IM3707 | |
| CD1a-PE抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| CD80-PE抗体 | Beckman Coulter | IM1976U | |
| CD83-PE抗体 | Beckman Coulter | IM2218 | |
| CD86-PE抗体 | Beckman Coulter | 182729 | |
| CD127-Pe-Cy5抗体 | eBioscience | -- | |
| FoxP3 PE抗体 | eBioscience | -- | |
| IL-17 FITC抗体 | eBioscience | -- | |
| IL-22 PerCP-eFluor710抗体 | eBioscience | -- | |
| HSP70抗体 | Enzo Life Science | ADI-SPA-810PE | |
| HSP90抗体 | Enzo Life Science | ADI-SPA-830-488 | |
| 抗兔PE抗体 | Jackson ImmunoReseach | 111-116-144 | |
| 抗鼠FITC二抗 | Beckman Coulter | IM1619 | |
| 生物素标记抗小鼠CD47抗体 | Biolegend | miap301 | |
| APC/Cy7链霉亲和素 | Biolegend | -- | |
| 细胞染色 | SYTOX AADvanced死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | S10349 |
| LIVE/DEAD可固定Aqua死细胞染料 | Molecular Probes, ThermoFisher Scientific | L34957 | |
| DRAQ5 | Alexis Biochemicals | DR50200 | |
| 试剂盒 | ATP检测试剂盒 | Biovision | K354-100 |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI染色试剂盒 | Roche | 11 |
| DC培养 | CellGenix GMP DC培养基 | CellGenix GmbH | -- |
| 重组人GM-CSF | PromoKine | -- | |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 |
| ELISA | HMGB1 ELISA试剂盒 | IBL International | ST51011 |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EHIL10 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EH2IL1B | |
| IL-1α ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EH2IL1A | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EH2IL6 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | eBioscience | BMS223INSTCE | |
| PGE2 ELISA试剂盒 | Enzo Life Sciences | ADI-930-001 | |
| IFNγ ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | EHIFNG | |
| TNFα ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0109 | |
| 流式细胞术 | NF-kB抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc8008 |
| 吞噬实验 | Fast DiA细胞标记液 | Molecular Probes | D7758 |
| DQ-OVA | Molecular Probes | D12053 | |
| 细胞毒性实验 | 钙黄绿素-AM | Invitrogen | -- |
| Hank's平衡盐溶液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| HLA-A2特异性单抗cr11.351 | -- | -- | |
| RNA-seq | TruSeq链式总RNA样品制备试剂盒 | Illumina Inc. | -- |
| HiSeq2500平台 | Illumina Inc. | -- | |
| DC分选 | 抗CD14包被微珠 | Miltenyi Biotec | 130-050-201 |
| T细胞分选 | MACS微珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| 流式细胞术 | Cytofix/Cytoperm溶液 | BD Biosciences | -- |
| eBioscience FoxP3染色缓冲液套装 | eBioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:Mino, SP53, Granta 519 (MCL), DOHH2 (DLBCL), T2-A2, EBV-LCL, A20;培养基:RPMI 1640或DMEM,10% FCS,100 μg/mL链霉素,100 IU/mL青霉素;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines |
| 药物处理 | RA/IFNα浓度:1000 U/ml IFN-α(人)或重组小鼠IFNα,1 μmol/L 9-cis-RA;处理时间:5天(凋亡诱导),48小时(ICD标志物检测),72小时(HMGB1释放);对照:未处理或γ-辐射 阅读提示:Materials and Methods: Antibodies and reagents, Results: RA/IFNα combination induces ICD |
| TCL制备 | 细胞数:5×10^6细胞/100μl PBS;冻融循环:3次快速冻融;离心:13,000 rpm,15分钟,4°C;蛋白浓度:1 mg/ml 阅读提示:Materials and Methods: TCL preparation and Western blot |
| DC生成和脉冲 | IFN-DC来源:健康供者PBMC;单核细胞分离:CD14微珠;培养:3天,GM-CSF(50 ng/ml)和IFN-α(10,000 U/ml);TCL负载:100 μg TCL/10^6 DC 阅读提示:Materials and Methods: DC and CTL generation |
| 体外CTL诱导 | 共培养:DC与自体T细胞共培养;再刺激:每周4次;杀伤检测:calcein-AM释放;E:T比例:肿瘤细胞系10:1,肽特异性20:1;肽库:5个cyclin D1肽(HLA-A*0201),3个survivin肽(HLA-B*0801) 阅读提示:Materials and Methods: Cytotoxicity assay, Results: DCs loaded with RA/IFNα-treated TCLs |
| 体内实验 | 小鼠品系:NOD/SCID;年龄:3-4周;每笼4-5只;接种:皮下注射5×10^6 Mino细胞(治疗模型)或腹腔注射PBL(30-40×10^6);疫苗剂量:2×10^6 DC负载200 μg TCL,腹腔注射;时间表:第0、7、14天 阅读提示:Materials and Methods: Immunization of hu-PBL-NOD-scid mice, Therapeutic vaccination |
| 统计 | 统计学方法:Student's t-test(双尾);数据表示:均值±SD;独立实验重复次数:至少3次(体外) 阅读提示:Figure legends |