鉴定雷公藤红素为Nur77配体
筛选和验证雷公藤红素与Nur77的直接结合
利用SPR、CD、HPLC和分子对接研究雷公藤红素与Nur77-LBD的结合,并通过报告基因实验验证其对Nur77转录活性的抑制。
Celastrol-Induced Nur77 Interaction with TRAF2 Alleviates Inflammation by Promoting Mitochondrial Ubiquitination and Autophagy.
研究包含体外细胞实验、体内小鼠模型(急性肝损伤和肥胖模型)和多个机制验证,如SPR结合、coIP、泛素化分析、自噬检测等,证据层级丰富。
HepG2细胞 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) Nur77基因敲除小鼠(Nur77^-/-) 高脂饮食诱导肥胖小鼠模型
雷公藤红素与Nur77-LBD结合(SPR,Kd=0.29μM) 细胞处理:HepG2、MEFs等,雷公藤红素浓度(1-4μM)和TNFα(20 ng/mL) 体内模型:LPS/D-GalN诱导急性肝损伤和HFD诱导肥胖,雷公藤红素剂量(0.2或0.5 mg/kg) 关键突变体:Nur77/L506W、Nur77/K536R、TRAF2/AA等 自噬抑制剂:氯喹、渥曼青霉素
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选和验证雷公藤红素与Nur77的直接结合
利用SPR、CD、HPLC和分子对接研究雷公藤红素与Nur77-LBD的结合,并通过报告基因实验验证其对Nur77转录活性的抑制。
确定Nur77是否介导雷公藤红素的抗炎和自噬效应
在细胞和动物模型中,通过siRNA敲低或基因敲除Nur77,检测雷公藤红素对TNFα诱导的IκBα降解、NF-κB激活和LC3-II诱导的影响。
阐明雷公藤红素诱导Nur77与TRAF2相互作用的分子机制
通过coIP、GST pull-down和突变分析,鉴定TRAF2中的LxxLL基序(245LAMLL249)介导与Nur77-LBD的结合。
确定Nur77-TRAF2相互作用是否调节TRAF2和RIP1的泛素化以及Nur77自身的泛素化
通过泛素化实验检测TRAF2和RIP1的泛素化水平,以及Nur77的K63连接泛素化,并通过突变体分析确定关键赖氨酸残基。
阐明泛素化Nur77如何通过p62介导线粒体自噬
通过免疫荧光和 biochemical fractionation 分析Nur77、p62、LC3和线粒体的共定位,以及p62的UBA结构域在介导相互作用中的地位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体检测 | 抗Myc抗体 | Santa Cruz | sc-40 |
| 抗Hsp60抗体 | Abcam | ab46798 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signal Technology | 3933S | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signal Technology | 4970S | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signal Technology | 4814S | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signal Technology | 4108S | |
| 抗磷酸化IKKα/IKKβ抗体 | Cell Signal Technology | 2078s | |
| 抗Nur77抗体(M-210) | Santa Cruz Biotechnology | sc-5569 | |
| 抗LC3B抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-28266 | |
| 抗p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-109 | |
| 抗GST抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-138 | |
| 抗TRAF2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7187 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 药物处理 | 渥曼青霉素 | Beyotime | S1952 |
| 重组人TNFα蛋白 | Peprotech | 300-01a-50 | |
| 脂多糖 | Sigma | L2630 | |
| D-半乳糖胺 | Sigma | G0500 | |
| 氯喹 | Sigma | C6628-25G | |
| 地塞米松 | Sigma | D8040 | |
| MG132 | Sigma | C2211-5MG | |
| 9-顺式维甲酸 | Sigma | R4643-1MG | |
| CD3254 | Santa Cruz Biotechnology | sc-358786 | |
| 试剂盒 | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-EL-M0037c |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-EL-M0044c | |
| 蛋白分析 | Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(如HepG2、MEFs)的培养条件、雷公藤红素浓度(1-4 μM)、TNFα浓度(20 ng/mL)、处理时间(1-6小时) 阅读提示:Methods中的Cell Culture Conditions和Western Blotting部分 |
| 雷公藤红素结合分析 | SPR实验中的Nur77-LBD浓度、雷公藤红素浓度梯度、固定化条件 阅读提示:Methods中的Biacore Assay部分 |
| 动物模型 | 小鼠品系(野生型C57BL/6J和Nur77^-/-)、性别和年龄(雄性4-6周)、诱导方法(LPS 80 μg/kg和D-GalN 200 mg/kg)、雷公藤红素给药方案(剂量0.2或0.5 mg/kg,HFD模型中0.1 mg/kg) 阅读提示:Methods中的Animal Studies部分 |
| 免疫共沉淀(coIP) | 抗体选择(抗Myc、抗Flag)、转染质粒、细胞裂解缓冲液成分、洗涤条件 阅读提示:Methods中的Coimmunoprecipitation部分 |
| 泛素化检测 | HA-Ub转染、免疫沉淀抗体、SDS-PAGE和WB分析 阅读提示:Methods中的Western Blotting和Coimmunoprecipitation部分 |