评估GW3965对NDV感染的抑制作用
验证GW3965是否具有抗NDV活性及其剂量依赖性。
DF-1细胞用不同浓度GW3965预处理,感染NDV,通过western blot检测病毒蛋白NP表达,TCID50测定病毒滴度,qRT-PCR检测病毒基因组RNA。
The LXR ligand GW3965 inhibits Newcastle disease virus infection by affecting cholesterol homeostasis.
研究包括细胞实验验证GW3965抗病毒效果、病毒进入复制分析、NF-κB及细胞因子检测、脂质基因表达分析、ABCA1过表达和胆固醇补充实验,但缺乏动物模型等体内验证。
DF-1细胞 NDV Herts/33株感染模型
DF-1细胞培养条件:DMEM培养基,10% FBS,37°C,5% CO2 GW3965处理浓度:1 μM(多数实验),细胞活力测定使用0-5 μM 病毒感染参数:MOI = 1,感染时间12小时(部分实验为6, 12, 24小时) ABCA1过表达:EGFP-ABCA1转染,胆固醇补充浓度400 μg/ml 病毒滴度检测:TCID50及qRT-PCR定量病毒基因组RNA
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证GW3965是否具有抗NDV活性及其剂量依赖性。
DF-1细胞用不同浓度GW3965预处理,感染NDV,通过western blot检测病毒蛋白NP表达,TCID50测定病毒滴度,qRT-PCR检测病毒基因组RNA。
确定GW3965作用于病毒生命周期的哪个阶段(吸附、进入、复制)。
分别进行吸附实验(4°C孵育)、进入实验(4°C吸附后37°C进入)和复制实验(感染后添加GW3965),通过qRT-PCR检测病毒gRNA拷贝数。
探究GW3965的抗炎作用及其对NF-κB通路的调节。
Western blot检测IκBα、p65及其磷酸化水平,qRT-PCR和ELISA检测IL-1β, IL-6, IL-8, TNF-α, IFN-β表达。
确定NDV感染是否扰乱胆固醇代谢相关基因表达。
在感染后不同时间点提取RNA,通过qRT-PCR检测LXR-α, SREBP-1, PPAR-γ1, FASN, ABCA1的mRNA水平。
证实ABCA1通过调节胆固醇水平抑制NDV感染。
过表达EGFP-ABCA1或EGFP,感染NDV,检测病毒蛋白表达、细胞胆固醇含量;用胆固醇补充处理,观察感染恢复;使用filipin III染色观察胆固醇分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | GW3965 | Selleck | -- |
| 水溶性胆固醇 | Sigma | -- | |
| Western blot | β-肌动蛋白抗体 | Sigma | -- |
| 山羊抗小鼠IgG | Beyotime | -- | |
| 山羊抗兔IgG | Beyotime | -- | |
| 胆固醇染色 | 菲律宾菌素III | Cayman Chemical | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白质测定试剂盒 | Thermo | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- | |
| 增强化学发光系统 | Vazyme | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | MMLV逆转录酶 | Promega | -- |
| AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| 细胞转染 | 聚乙烯亚胺 | Sigma | -- |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| 胆固醇定量 | 组织总胆固醇检测试剂盒 | Applygen | -- |
| 荧光显微镜观察 | 尼康荧光显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒 | DF-1细胞来源(ATCC),培养条件(DMEM+10%FBS, 37°C, 5% CO2),NDV Herts/33株来源,病毒扩增方法(鸡胚),感染剂量TCID50测定 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and virus |
| 药物处理 | GW3965浓度(多数实验1 μM,部分为0.1, 0.5, 1, 2, 5 μM),预处理时间(2小时),感染期间持续存在;胆固醇补充浓度(400 μg/ml) 阅读提示:Materials and methods: Reagents; Results: GW3965 affects NDV entry and replication |
| 病毒进入实验 | 吸附实验条件(4°C 1小时),进入实验条件(4°C吸附后37°C 1小时),实验组与对照组比较 阅读提示:Figure 2A, B legends |
| NF-κB检测 | 感染条件(MOI=1, 12小时),GW3965浓度(0.1, 0.5, 1 μM),Western blot检测IκBα、p65、p-IκBα、p-p65的表达 阅读提示:Figure 3 legend |
| 炎症因子检测 | qRT-PCR和ELISA检测IL-1β, IL-6, IL-8, TNF-α, IFN-β,感染时间12小时,GW3965浓度1 μM 阅读提示:Figure 4 legend |
| 脂质代谢基因检测 | qRT-PCR检测LXR-α, SREBP-1, PPAR-γ1, FASN, ABCA1 mRNA,感染时间点(6, 12, 24小时),GW3965处理(1 μM, 12小时) 阅读提示:Figure 5 legends |
| ABCA1过表达实验 | EGFP-ABCA1质粒来源,转染试剂(PEI),转染时间(24小时),感染时间(12小时),胆固醇补充(400 μg/ml) 阅读提示:Results: ABCA1 is involved in the inhibition of NDV infection; Figure 6A |
| 胆固醇检测与染色 | 胆固醇定量方法(试剂盒),filipin III染色浓度(0.05 mg/mL),染色时间(2小时),观察时间点(12 hpi) 阅读提示:Materials and methods: Cholesterol quantification, Filipin III staining; Figure 6F |