临床样本表达分析
评估FAM83D在宫颈癌组织和正常组织中的表达差异及其与预后的相关性。
利用UALCAN、TNMplot和TCGA数据库分析FAM83D mRNA表达;用组织芯片HUteS120Su01进行免疫组化检测蛋白表达并进行生存分析。
FAM83D facilitates EMT and metastasis of cervical cancer via interaction with GSK3β and inactivation of GSK3β/stabilization of Snail signaling.
包含体外细胞功能实验(迁移、侵袭)、体内动物模型(皮下移植瘤、尾静脉转移模型)、临床组织芯片、蛋白相互作用和机制验证(Co-IP、体外结合、泛素化、抑制剂回补等)。
宫颈癌细胞系SiHa和HeLa BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 BALB/c裸鼠尾静脉转移模型 宫颈癌组织芯片
宫颈癌细胞系SiHa和HeLa FAM83D过表达和敲低的稳定细胞系构建(LV-FAM83D、LV-shFAM83D) 体外迁移和侵袭实验(划痕实验、Transwell) 体内转移模型(尾静脉注射3×10^6个细胞,5周) GSK3β抑制剂LiCl处理浓度(HeLa 10 mM,SiHa 15 mM,24小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估FAM83D在宫颈癌组织和正常组织中的表达差异及其与预后的相关性。
利用UALCAN、TNMplot和TCGA数据库分析FAM83D mRNA表达;用组织芯片HUteS120Su01进行免疫组化检测蛋白表达并进行生存分析。
验证FAM83D对宫颈癌细胞增殖、化疗敏感性、迁移和侵袭的影响。
构建FAM83D过表达和敲低的SiHa和HeLa稳定细胞系,进行CCK-8、克隆形成、划痕和Transwell实验。
验证FAM83D对宫颈癌细胞体内转移能力的影响。
采用尾静脉注射和皮下接种FAM83D敲低或对照的HeLa细胞到裸鼠,评估肺和肝转移及皮下瘤生长。
阐明FAM83D调控GSK3β/Snail信号的分子机制。
通过Western blot检测EMT和信号分子;Co-IP和体外结合实验验证FAM83D-GSK3β相互作用;泛素化实验检测Snail稳定性;使用激酶抑制剂和LiCl处理验证通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | Procell | -- |
| 胎牛血清 | Cyto Factory | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | -- | |
| 病毒包装 | LV-FAM83D慢病毒 | Genechem | -- |
| LV-shFAM83D慢病毒 | Genechem | -- | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Beyotime | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | -- |
| 药物处理 | 顺铂 | MedChem Express | 15663-27-1 |
| 奥沙利铂 | MedChem Express | 61825-94-3 | |
| 5-氟尿嘧啶 | MedChem Express | 51-21-8 | |
| 紫杉醇 | Selleck Chemicals | 33069-62-4 | |
| 克隆形成 | 结晶紫 | Beyotime | 548-62-9 |
| Western blot | RIPA强裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| 脱脂奶粉 | Beyotime | -- | |
| HRP偶联二抗 | ZSGB-BIO | -- | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| Bio-Rad分子成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| FAM83D抗体 | Abcam | ab236882 | |
| β-catenin抗体 | Santa Cruz | sc-7963 | |
| GSK3β抗体 | HUABIO | ET1607-71 | |
| 磷酸化GSK3β (Ser9)抗体 | HUABIO | ET1607-60 | |
| GAPDH抗体 | HUABIO | ET1601-4 | |
| AKT1抗体 | HUABIO | ET1609-47 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 S | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 13116T | |
| 波形蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5741T | |
| Snail抗体 | Cell Signaling Technology | 3879T | |
| PKA抗体 | Cell Signaling Technology | 4782 | |
| 磷酸化PKA (Thr197)抗体 | Cell Signaling Technology | 4781 | |
| 磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| Transwell | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| Transwell小室 | Corning Incorporated | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Sichuan Charles River Laboratories | -- |
| Co-IP | 蛋白A+G琼脂糖 | -- | -- |
| IgG抗体 | -- | -- | |
| 泛素化实验 | HA-泛素质粒 | -- | -- |
| 氯化锂 | -- | 7447-41-8 | |
| MG132 | -- | 133407-82-6 | |
| 泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 体外结合实验 | TnT®快速偶联体外转录/翻译系统 | Promega | L11700 |
| 免疫组化 | 组织芯片HUteS120Su01 | Shanghai Outdo Biotechnology | -- |
| 柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- | |
| 山羊血清 | ZSGB-BIO | -- | |
| FAM83D抗体(IHC) | BIOSS | bs-14678R | |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software Inc. | -- |
| 抑制剂处理 | MK2206 | -- | 1032350-13-2 |
| H-89 | -- | 127243-85-0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和病毒感染 | 细胞系(SiHa、HeLa)来源和培养条件、慢病毒感染MOI、嘌呤霉素筛选浓度和时长 阅读提示:详见Materials and methods中的Cell culture和Lentiviral vector部分 |
| 体外迁移和侵袭 | 划痕实验的细胞密度、血清浓度、拍照时间点;Transwell的细胞数、基质胶包被时长、孵育时间 阅读提示:详见Materials and methods中的Wound healing assay和Transwell migration and invasion assay部分 |
| 体内转移模型 | 小鼠品系、周龄、性别、注射细胞数、注射体积、观察时间、转移灶计数方法 阅读提示:详见Materials and methods中的Tumor xenograft and metastasis in experimental animals部分及Figure legends |
| 蛋白互作和泛素化 | Co-IP抗体用量、孵育时间、洗脱条件;泛素化实验中MG132、LiCl浓度和处理时间 阅读提示:详见Materials and methods中的Co-immunoprecipitation和Ubiquitination assay部分 |
| 信号通路抑制剂实验 | MK2206、H-89、LiCl的浓度和处理时间 阅读提示:详见Figure 6和图7的legend及Results相应段落 |