乙酰化组学分析
鉴定Sirt1+/−和自然衰老小鼠睾丸中与年轻WT不同的乙酰化蛋白谱
对Sirt1+/−、衰老WT和年轻WT小鼠睾丸裂解液进行LC-MS分析,鉴定差异乙酰化蛋白。
SIRT1 haploinsufficiency recapitulates age-associated subfertility through sperm α-tubulin hyperacetylation.
研究包含乙酰化组学(LC-MS)和功能验证(精子质量、IVF、胚胎发育评估),并涉及体内模型(Sirt1+/−和自然衰老小鼠)及多种检测方法,符合高完整度标准。
Sirt1+/−小鼠模型 自然衰老小鼠(12月龄WT) 年轻WT小鼠(3.5月龄)
小鼠基因型:Sirt1+/−与WT(Sirt1+/+)同窝对照,以及12月龄WT自然衰老模型 精子获能条件:HTF添加0.4% BSA,37°C孵育1小时 顶体反应诱导:孕酮(20 µM)处理10分钟 IVF中精子浓度:1 × 10^6 sperm/mL,共孵育5.5小时 统计阈值:p < 0.05,相关性分析使用Pearson相关
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定Sirt1+/−和自然衰老小鼠睾丸中与年轻WT不同的乙酰化蛋白谱
对Sirt1+/−、衰老WT和年轻WT小鼠睾丸裂解液进行LC-MS分析,鉴定差异乙酰化蛋白。
验证成熟精子中是否保留睾丸乙酰化改变,并定位α-微管蛋白过度乙酰化的区域
通过Western blot、流式细胞术和免疫细胞化学检测精子中总乙酰赖氨酸(acLys)和乙酰化α-微管蛋白(acTub)水平及定位。
评估乙酰化改变对精子功能的影响,包括活力、线粒体活性、ROS、顶体完整性等
利用流式细胞术检测精子活力、线粒体活性、ROS水平、膜脂过氧化、顶体完整性,并在获能后再次评估。
检测SIRT1不足和衰老对精子获能及顶体反应的影响
通过检测pY信号及其空间分布评估获能,并通过孕酮诱导的顶体反应评估精子功能。
评估SIRT1不足和衰老对受精能力及早期胚胎发育的影响
进行IVF,观察受精率、卵裂率、囊胚形成率和囊胚质量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组学 | timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- |
| Western blot | ECL Select Western印迹检测试剂 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ImageLab软件 | Bio-Rad | -- | |
| Dot blot | Amersham Protran Premium 0.45 µm硝酸纤维素膜 | GE Healthcare | 10600008 |
| 印迹级封闭剂 | Bio-Rad | 1706404 | |
| 抗乙酰赖氨酸抗体 | Abcam | ab80178 | |
| HRP偶联二抗 | Abcam | ab6721 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | 1705060 | |
| 流式细胞术 | FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| PNA-FITC | -- | -- | |
| MitoTracker Deep Red | -- | -- | |
| 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | -- | -- | |
| BODIPY 581/591 | -- | -- | |
| Live/Dead可固定试剂盒 | -- | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | 抗乙酰赖氨酸抗体 | Enzo Life Sciences | ADI-KAP-TF120-E |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab24610 | |
| 抗磷酸化酪氨酸抗体 | Sigma Aldrich | 05-321 | |
| 抗Cdx2抗体 | Bioss | bs1620R | |
| 抗Oct4抗体 | Abcam | ab217250 | |
| Alexa Fluor 488和647偶联二抗 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| Vectashield封片剂 | -- | -- | |
| 奥林巴斯IX83转盘共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 体外受精 | EmbryoMax-KSOM培养基 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57Bl/6N;基因型:Sirt1+/−;年龄:3.5月龄;对照:WT同窝;衰老模型:12月龄WT。 阅读提示:Materials and Methods: Animals |
| 乙酰化组学 | 睾丸裂解液制备:RIPA缓冲液;酶解:胰蛋白酶过夜;LC-MS设备:timsTOF Pro;每组至少3只动物,4次技术重复。 阅读提示:Materials and Methods: Proteome profiling of testes by LCMS; Supplementary Methods S1 |
| 精子分离 | 附睾在HTF中释放精子15分钟;HTF组成(见原文)。 阅读提示:Materials and Methods: Sample collection of testicular tissue and sperm isolation |
| 精子功能检测 | 获能条件:HTF+0.4% BSA,37°C 1小时;顶体反应:孕酮20 µM,10分钟;染色:PNA-FITC、MitoTracker、H2DCFDA、BODIPY;流式门控:FSC vs SSC,活力门控。 阅读提示:Materials and Methods: Evaluation of sperm parameters |
| 体外受精 | 精子浓度:1×10^6 sperm/mL;共孵育5.5小时;胚胎培养:KSOM+0.1% BSA;观察时间点:受精(6-8 hpi)、卵裂(24 hpi)、囊胚(第4天)。 阅读提示:Materials and Methods: In vitro fertilization assay |