临床样本分析与相关性验证
探究KCTD1表达与PD-L1表达及HCC患者预后的关系
利用数据库分析KCTD1表达与生存及PD-L1相关性;对79例HCC组织进行IHC染色,评估KCTD1和PD-L1表达及共表达。
KCTD1 stabilizes c-Myc to upregulate PD-L1 and suppress anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma.
包含临床样本分析、体外细胞实验、蛋白质互作、机制验证及小鼠体内模型等多层级证据,且涵盖功能验证和机制验证。
HCC细胞系MHCC97H、Huh7、Hepa1-6 人PBMC共培养体系 C57BL/6小鼠原位肝癌模型
KCTD1与PD-L1在HCC组织中的表达相关性(79例样本,含10例正常、5例I级、54例II级、10例III级) KCTD1与c-Myc的直接相互作用(依赖BTB和BR-HLH-LZ结构域) KCTD1敲低对PD-L1蛋白稳定性的影响(CHX追踪实验) KCTD1敲低对CD8+ T细胞功能的影响(包括IFN-γ、TNF-α、PD-1、Ki-67) 小鼠原位模型中Kctd1敲低与抗PD-1治疗的协同效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究KCTD1表达与PD-L1表达及HCC患者预后的关系
利用数据库分析KCTD1表达与生存及PD-L1相关性;对79例HCC组织进行IHC染色,评估KCTD1和PD-L1表达及共表达。
验证KCTD1是否调控PD-L1表达及其稳定性
在MHCC97H细胞中敲低KCTD1,Western blot和流式检测PD-L1表达;CHX追踪实验检测PD-L1蛋白稳定性。
揭示KCTD1调控PD-L1的分子机制
通过免疫共沉淀、质谱鉴定KCTD1互作蛋白;截短体共沉淀确定互作结构域;CHX实验检测c-Myc稳定性。
评估KCTD1敲低对CD8+ T细胞抗肿瘤功能的影响
将PBMC与MHCC97H共培养,流式检测T细胞亚群、凋亡、细胞因子及增殖标志;ELISA检测TNF-α。
验证KCTD1敲低对肿瘤生长和免疫微环境的影响
将Kctd1敲低的Hepa1-6细胞原位注射至C57BL/6小鼠肝脏,观察肿瘤生长、增殖和凋亡标志,并评估CD8+ T细胞浸润。
评估KCTD1敲低能否增强抗PD-1疗效
对荷瘤小鼠给予抗PD-1抗体治疗,分析肿瘤结节数量和T细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | 抗KCTD1抗体 | Bioss | bs-16924R |
| 抗PD-L1抗体 | Proteintech | 66248-1 | |
| 抗c-Myc抗体 | Proteintech | 10828-1-ap | |
| 抗CD3抗体 | Santa Cruz | sc-20047 | |
| 抗CD4抗体 | Santa Cruz | MT310 | |
| 抗CD8a抗体 | Cell Signaling | 70306 | |
| IgG同型对照 | Abcam | ab37355 | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | JetPrime转染试剂 | Polyplus | -- |
| 慢病毒转导 | GV248载体 | GenePharma | -- |
| 聚凝胺 | GENE | REVGC03-1 | |
| 荧光显微镜 | ZEISS | -- | |
| PBMC分离 | Ficoll分离液 | Solarbio | P8610 |
| CD8+ T细胞分选 | CD8磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045201 |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI染色 | Beyotime | -- |
| CD3-PE抗体 | Thermo Fisher Scientific | PE-65133 | |
| CD4-FITC抗体 | Thermo Fisher Scientific | FITC-65143 | |
| CD8-FITC抗体 | Proteintech | FITC-65144 | |
| PD-1-PE抗体 | Thermo Fisher Scientific | 11-9969-41 | |
| 抗IFN-γ-FITC抗体 | eBioscience | 11-7311-82 | |
| Ki67-PE抗体 | BioLegend | 350053 | |
| Cyto-Fast™固定/破膜缓冲液 | BioLegend | 426803 | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- | |
| ELISA | 人TNF-α ELISA MAX Deluxe试剂盒 | BioLegend | 430204 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Bioss | C-0013 |
| 抗GAPDH抗体 | Abbkine | A01020 | |
| 抗β-actin抗体 | Abbkine | AP0063 | |
| 免疫荧光 | CY3-TSA试剂 | Servicebio | AS008 |
| DAPI染色液 | Servicebio | G1012 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS琼脂糖珠 | BeyoMag | P2108-1 |
| 兔IgG阴性对照 | Zenbio | 550124 | |
| 动物实验 | 抗CD8抗体 (YTS169.4) | BioXCell | YTS169.4 |
| 抗PD-1抗体 | Bioss | bsm-43072M |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 样本量、组织类型、HCC分级构成、抗体克隆号及稀释度 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry (IHC) analysis |
| 细胞培养与转染 | 细胞系、培养基、转染试剂、转染条件 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection |
| KCTD1敲低/过表达 | 慢病毒构建、感染MOI、筛选药物 阅读提示:Methods: Lentiviral-mediated KCTD1 Knockdown |
| 免疫共培养 | PBMC来源、共培养比例、时间、刺激因子 阅读提示:Methods: PBMC isolation and CD8+ T cell sorting, Flow cytometry |
| 小鼠模型 | 小鼠品系、性别、年龄、细胞注射数量、体积、给药剂量、时间点 阅读提示:Methods: Murine intrahepatic HCC model and in vivo antibody blockade |