网络药理学分析
预测LSJPF的活性成分、潜在靶点和关键通路。
利用TCMSP和HERB数据库鉴定LSJPF的活性成分和靶点;从GeneCards、DisGeNET和PubMed获取IGT相关基因;取交集获得潜在治疗靶点;构建PPI网络并筛选核心靶点;进行GO和KEGG富集分析;构建药物-成分-靶点网络。
Exploring the mechanism of the Lianshi Jianpi formula in treating impaired glucose tolerance: a network pharmacology, molecular docking, and experimental validation study.
包含网络药理学、分子对接和动物模型验证等多个独立证据层次,并通过Western blot、病理染色等功能和机制验证。
高脂饮食联合低剂量链脲佐菌素诱导的SD大鼠IGT模型 正常饮食SD大鼠对照组
IGT模型建立:高脂饮食4周后,腹腔注射1%链脲佐菌素25 mg/kg,继续高脂饮食1周后经OGTT确认,FPG<7 mmol/L且2hPG 7.8-11.1 mmol/L。 LSJPF干预剂量:饲料中2/3高脂饮食和1/3 LSJPF,干预8周。 动物分组:每只8只,分为对照组(标准饮食)、IGT组(高脂饮食)、LSJPF组(2/3高脂+1/3 LSJPF)。 检测终点:OGTT和ITT在干预后第8周进行,包括FPG、HbA1c、血脂(TG、CHOL、LDL-C、HDL-C)等。 统计分析:组间比较采用单因素方差分析,重复测量数据采用双因素重复测量方差分析,P<0.05为有统计学意义。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测LSJPF的活性成分、潜在靶点和关键通路。
利用TCMSP和HERB数据库鉴定LSJPF的活性成分和靶点;从GeneCards、DisGeNET和PubMed获取IGT相关基因;取交集获得潜在治疗靶点;构建PPI网络并筛选核心靶点;进行GO和KEGG富集分析;构建药物-成分-靶点网络。
验证核心靶点与活性成分之间的结合亲和力。
从PubChem获取配体3D结构,从PDB获取蛋白受体3D结构;使用PyMOL和AutoDock Vina进行分子对接,计算最低结合能。
建立IGT大鼠模型并评估LSJPF的体内效应。
36只雄性SD随机分出8只为对照组;其余大鼠高脂饮食4周后腹腔注射1% STZ 25 mg/kg,继续高脂饮食1周后经OGTT确认IGT模型;将造模成功的大鼠随机分为IGT组和LSJPF组,每组8只,LSJPF组喂食2/3高脂+1/3 LSJPF,持续8周。
评估LSJPF对体重、摄食、饮水、血糖和血脂的影响。
每两周记录摄食量、饮水量和体重;8周后进行OGTT和ITT;检测FPG、HbA1c、TG、CHOL、LDL-C、HDL-C。
评估LSJPF对IGT大鼠肝脂肪变性和炎症的影响。
肝组织切片HE染色和ORO染色,使用NAS评分和ImageJ定量脂滴面积。
验证LSJPF对AMPK/PI3K/AKT信号通路磷酸化水平的影响。
提取肝组织蛋白,使用Western blot检测AMPK、p-AMPK、PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT、GAPDH的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | Meilun Biotechnology Co., Ltd. | MB1227 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0010 |
| AMPK抗体 | Proteintech | 66536-1-Ig | |
| PI3K抗体 | Proteintech | 20584-1-AP | |
| 磷酸化AKT抗体 | Proteintech | 80455-1-RR | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| AKT抗体 | Bioss | bs6951R | |
| 磷酸化AMPK抗体 | Affinity Biosciences | AF3423 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Affinity Biosciences | AF3241 | |
| 血糖测量 | 血糖仪(Contour-TS) | -- | -- |
| HbA1c测量 | 糖化血红蛋白分析仪 | BioHermes | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 网络药理学筛选条件 | 筛选阈值:OB≥30%、DL≥0.18、HL≥4、Caco-2≥0.2;物种限定为Homo sapiens;PPI网络置信度大于0.7。 阅读提示:见2.1.1和2.1.3节 |
| IGT动物模型建立 | 大鼠品系、性别、年龄、体重;高脂饮食配方及时间;STZ剂量、注射方式;模型成功标准(FPG和2hPG范围)。 阅读提示:见2.2.2节 |
| LSJPF干预方式 | LSJPF在饲料中的比例(2/3高脂:1/3 LSJPF);干预持续时间(8周);对照组饮食配方。 阅读提示:见2.2.2节 |
| 代谢检测条件 | OGTT和ITT的禁食时间、葡萄糖和胰岛素剂量、给药方式、血糖监测时间点。 阅读提示:见2.2.4节 |
| Western blot条件 | 使用的抗体及其货号、蛋白提取方法(RIPA裂解液)、蛋白定量方法(BCA)、孵育条件(一抗4℃过夜)。 阅读提示:见2.2.8节 |