转录组图谱分析
分析irisin相关基因(Fndc5、Tlr4、Itgav、Itgb5)在下丘脑细胞类型中的分布,以支持潜在相互作用。
整合三个公开scRNA-seq数据集(共51,623个下丘脑细胞),使用CCA整合和dbMAP可视化,检查基因表达。
Central Irisin Administration Attenuates Hypothalamic TLR4/MyD88-Mediated Neuroinflammatory Signaling in Diet-Induced Obese Mice.
包括scRNA-seq分析、DIO小鼠模型、ICV给药、免疫荧光、RT-qPCR、Western blot和胰岛素信号检测等多个独立实验层级,并包含功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠(饮食诱导肥胖模型) 下丘脑组织(免疫荧光、RT-qPCR、Western blot) 公开scRNA-seq数据集(下丘脑细胞类型)
饮食诱导:HFD(45% kcal脂肪)喂养12周 ICV给药:irisin 7.5 μg/kg或生理盐水,每天一次,连续7天 胰岛素刺激:ICV注射胰岛素10 mU/只,20分钟后取材 组织采集:下丘脑,独立队列分别用于免疫荧光、RT-qPCR和Western blot 统计:单因素ANOVA或Kruskal-Wallis,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析irisin相关基因(Fndc5、Tlr4、Itgav、Itgb5)在下丘脑细胞类型中的分布,以支持潜在相互作用。
整合三个公开scRNA-seq数据集(共51,623个下丘脑细胞),使用CCA整合和dbMAP可视化,检查基因表达。
建立DIO模型并评估irisin的短期中枢效应。
4周龄雄性C57BL/6J小鼠喂养CD或HFD共12周,第13周进行立体定位手术植入侧脑室套管,术后分组接受ICV注射irisin或生理盐水,每天一次,连续7天。
评估irisin对体重、摄食和脂肪组织质量的影响。
每周监测体重和摄食量,计算Lee指数,称量各脂肪垫和肌肉质量。
评估irisin对肥胖诱导的下丘脑胶质细胞活化的影响。
使用免疫荧光染色检测Iba1(小胶质细胞)和GFAP(星形胶质细胞)的阳性面积百分比。
检测irisin对TLR4/MyD88通路和细胞因子表达的影响。
使用RT-qPCR检测Tlr4, Md2, Myd88, Il1b, Il6, Il10, Il4, Bax, Bcl2, Bdnf等mRNA表达;使用Western blot检测TLR4、MD2、MyD88、NFκB p65蛋白水平。
评估irisin对下丘脑胰岛素敏感性的影响。
处死前ICV注射胰岛素(10 mU/只),20分钟后收集下丘脑,通过Western blot检测pAKT和总AKT水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 重组鸢尾素 | PeproTech | 100-65 |
| 免疫荧光 | 抗Iba1抗体 | FujiFilm Wako | 019-19741 |
| 抗GFAP抗体 | Bioss | Bs-0199R-Cy3 | |
| 驴抗兔FITC二抗 | Abcam | ab6798 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | H-1200 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| SYBR Green主混合物 | PCR Biosystems | PB20.14-05 | |
| SpectraMax i3酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | Bradford试剂 | BioAgency Biotecnologia | -- |
| 硝酸纤维素膜 | BioRad | -- | |
| 抗TLR4抗体 | Santa Cruz | sc-293070 | |
| 抗MD2抗体 | Abcam | ab-24182 | |
| 抗MyD88抗体 | Santa Cruz | ab-2064 | |
| 抗磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Santa Cruz | sc-7985 | |
| 抗AKT抗体 | Santa Cruz | sc-8312 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| Amersham Imager 600成像仪 | GE Healthcare | -- | |
| 动物实验 | 血管紧张素II | Sigma-Aldrich | A9525 |
| 胰岛素(优泌林) | Eli Lilly | -- | |
| 异氟烷 | Cristália | -- | |
| 蔗糖 | -- | -- | |
| 乙二醇 | -- | -- | |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 驴血清 | -- | -- | |
| Tissue-Tek O.C.T.包埋剂 | Sakura | -- | |
| 冷冻切片机 | Leica | CM1860 | |
| 立体定位仪 | Stoelting | -- | |
| 树脂水门汀 | 3M | Dual | |
| 自凝牙托粉 | JET | -- | |
| Hamilton注射器 | Hamilton | -- | |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素 | Gibco | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | C57BL/6J雄性小鼠,4周龄;正常饮食或高脂饮食(45% kcal脂肪)全程喂养;HFD喂养12周诱导肥胖 阅读提示:Methods: Animals and Ethics Statement, Experimental Design Overview |
| ICV手术与给药 | 立体定位坐标(AP -0.34 mm, ML -1.0 mm, DV -2.2 mm);irisin剂量7.5 μg/kg,每天一次,共7天,溶剂为0.9%盐水+0.1% BSA;注射体积2 μL;时间窗9:00-10:00 a.m. 阅读提示:Methods: Stereotaxic Surgery and Angiotensin II Test, Intracerebroventricular Treatment |
| 样本采集 | 第8天,末次注射后约24h,禁食12h后处死;下丘脑、白色脂肪组织(iWAT、eWAT、rWAT)、褐色脂肪组织(iBAT)和特定肌肉称重;独立队列用于不同检测(免疫荧光、RT-qPCR、Western blot) 阅读提示:Methods: Experimental Design Overview, Heart Perfusion and Immunofluorescence Assay |
| 下丘脑胰岛素信号检测 | ICV注射胰岛素10 mU/只,20分钟后取材;检测pAKT(Ser473)和总AKT蛋白水平 阅读提示:Methods: Hypothalamic Insulin Signaling Assay, Proteins Extraction and Western Blot |
| 统计设计 | 多组比较使用单因素ANOVA + Tukey或Kruskal-Wallis + Dunn;p<0.05显著;数据以均值±SEM表示 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |