SNA的合成与表征
制备具有不同抗原配置(E-SNA、N-HSNA、C-HSNA)的SNA并验证其物理化学性质。
使用(C12)9锚定的CpG DNA和E711-19肽偶联物构建SNA,通过DLS、zeta电位、琼脂糖凝胶电泳和cryo-EM表征。
E711-19 placement and orientation dictate CD8+ T cell response in structurally defined spherical nucleic acid vaccines.
体外原代人PBMC/DC功能实验、AAD小鼠体内肿瘤模型与免疫分析、RNA-seq转录组机制验证及患者来源肿瘤球体验证。
人原代PBMC及单核细胞来源树突状细胞 AAD转基因小鼠TC-1/A2肿瘤模型 患者来源HPV+头颈癌肿瘤球体
SNA表面DNA密度(高/中/低)对细胞摄取和DC激活的影响 抗原:CpG比例固定为1:1,且DNA总链数约175条 N-HSNA和C-HSNA的肽-DNA偶联位点(N端或C端半胱氨酸) 体内实验中TC-1/A2细胞接种量(2×10^5)和疫苗剂量(3 nmol CpG/肽) 患者肿瘤球体处理浓度(50 nM CpG/抗原)和孵育时间(24小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备具有不同抗原配置(E-SNA、N-HSNA、C-HSNA)的SNA并验证其物理化学性质。
使用(C12)9锚定的CpG DNA和E711-19肽偶联物构建SNA,通过DLS、zeta电位、琼脂糖凝胶电泳和cryo-EM表征。
评估不同SNA构建体在人PBMC中对DC的摄取和激活能力。
将荧光标记的SNA与hPBMC共孵育1或4小时,通过流式细胞术检测CD11c+ DC的摄取;将SNA处理24小时,检测CD123+ pDC中CD83表达。
评估不同SNA构建体诱导抗原特异性CD8+ T细胞分泌IFN-γ、增殖和细胞毒性的能力。
将成熟DC与E711-19特异性CD8+ T细胞共培养,通过ELISpot检测IFN-γ分泌,通过流式细胞术检测T细胞增殖和细胞毒性(Annexin V/7-AAD)。
评估不同SNA构建体在HLA-A2转基因小鼠中对TC-1/A2肿瘤生长的抑制作用和生存期延长。
将TC-1/A2细胞皮下接种AAD小鼠,每5天免疫SNA或admix,监测肿瘤生长和生存期;部分实验联合抗PD-1抗体。
评估不同SNA构建体诱导的全身和肿瘤内CD8+ T细胞反应。
在治疗期间收集脾脏、血液和肿瘤,通过流式细胞术检测CD8+ T细胞频率、效应记忆表型、IFN-γ和CD107a表达以及E711-19特异性T细胞。
探究不同SNA构建体对CD8+ T细胞转录编程的影响。
从脾脏中分选CD8+ T细胞,进行bulk RNA-seq,通过PCA、火山图和GO富集分析比较不同处理组的基因表达差异。
评估SNA在患者来源HPV-HNSCC肿瘤球体中的细胞毒性作用。
将患者肿瘤球体培养于微流控装置中,用SNA处理,通过活/死染色和共聚焦成像量化细胞死亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SNA合成 | DNA表面密度(高、中、低),抗原:CpG比例1:1,总DNA链数约175条,SPDP交联剂偶联肽的位点(N端或C端) 阅读提示:Materials and Methods中SNA合成部分及Supplementary Materials |
| DC摄取和激活 | SNA浓度(如1.4 nM脂质体),处理时间(1或4小时摄取,24小时激活),检测的DC亚群(CD11c+、CD123+) 阅读提示:图2及Materials and Methods中Human PBMC cell uptake和Human pDC activation部分 |
| 抗原特异性CD8+ T细胞功能 | SNA浓度(ELISpot为250 nM,增殖为100 nM),共培养时间(ELISpot 24小时,增殖48小时,杀伤24小时),靶细胞(UM-SCC-104和UM-SCC-01) 阅读提示:Materials and Methods中Human IFN-γ ELISpot assay、Human E711-19 CD8+ T cell proliferation和Human CD8+ T cell killing assay部分 |
| 体内肿瘤实验 | TC-1/A2细胞接种量(2×10^5),疫苗剂量(3 nmol CpG/肽),免疫频率(每5天),抗PD-1剂量(20 μg)及频率(每3天) 阅读提示:Materials and Methods中In vivo tumor inhibition studies部分及图3图注 |
| 患者来源肿瘤球体实验 | SNA浓度(50 nM CpG/抗原),孵育时间(24小时),球体尺寸(40-100 μm),胶原基质浓度(4 mg/ml) 阅读提示:Materials and Methods中Preparation of MDOTS/PDOTS和Live/dead staining部分及图5图注 |