细胞培养与LINC00473敲低
建立LINC00473沉默的卵巢癌细胞模型,验证敲低效率。
通过Lipofectamine 2000将三条靶向LINC00473的siRNA转染至SK-OV-3和A2780细胞,转染浓度50 nM,6小时后换液,48小时后收集细胞。通过RT-qPCR检测LINC00473表达水平。
LINC00473 modulates protein expression to promote ovarian cancer progression and overcome cisplatin resistance.
体外细胞实验(SK-OV-3、A2780)结合功能验证(增殖、迁移、侵袭、凋亡)和蛋白表达检测(Western blot),但缺乏体内验证和机制通路抑制剂实验。
SK-OV-3人卵巢癌细胞系 A2780人卵巢癌细胞系
siRNA转染效率及LINC00473敲低效率(qPCR验证) CCK-8检测细胞增殖(2.0×10^4细胞/孔,五个技术重复,三个生物学重复) Transwell迁移和侵袭实验(8.0 µm孔径,24小时,五个随机视野计数) 流式细胞术检测凋亡(Annexin V-FITC/PI双染) Western blot检测PARP、caspase-3、Sox2、YAP1蛋白表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立LINC00473沉默的卵巢癌细胞模型,验证敲低效率。
通过Lipofectamine 2000将三条靶向LINC00473的siRNA转染至SK-OV-3和A2780细胞,转染浓度50 nM,6小时后换液,48小时后收集细胞。通过RT-qPCR检测LINC00473表达水平。
评估LINC00473敲低对卵巢癌细胞增殖能力的影响。
转染后细胞以2.0×10^4细胞/孔接种于96孔板,在24、48、72、96小时使用增强型CCK-8试剂检测450 nm处吸光度,计算细胞活力并绘制增殖曲线。
评估LINC00473敲低对卵巢癌细胞迁移和侵袭能力的影响。
使用Transwell小室(8.0 µm孔径)检测迁移;使用Matrigel预包被(1:8稀释)检测侵袭。细胞悬液(1.0×10^6/ml)加入上室,下室含10% FBS培养基,培养24小时后固定、染色、计数。
评估LINC00473敲低对卵巢癌细胞凋亡的影响。
转染后48小时收集细胞,使用Annexin V-FITC/PI双染,流式细胞仪检测凋亡率(早期+晚期凋亡细胞比例)。
探索LINC00473敲低对凋亡相关蛋白(PARP、caspase-3)和干性/耐药相关蛋白(Sox2、YAP1)表达的影响。
转染后收集细胞,裂解提取总蛋白,定量后进行SDS-PAGE电泳、转膜、抗体孵育和化学发光检测,以GAPDH为内参进行半定量分析。
评估LINC00473敲低对卵巢癌细胞顺铂敏感性的影响。
转染后细胞分为四组:siNC、siLINC00473、siNC+30 µM CDDP、siLINC00473+30 µM CDDP,CDDP处理48小时后,用CCK-8法检测细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCoy's 5A培养基 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | PM150710 |
| 胎牛血清 | Shanghai ExCell Biology, Inc. | FCS500 | |
| 稳定化新霉素溶液 | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd. | P477894 | |
| 胰蛋白酶 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | PB180226 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 11668019 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 15596026 |
| 逆转录 | PrimeScript RT预混液试剂盒 | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| qPCR | SYBR Premix Ex Taq | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Wuhan Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-CK-A362 |
| 酶标仪 | BioTek; Agilent Technologies, Inc. | Synergy HTX | |
| 细胞迁移实验 | 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 10099-141C |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | Corning, Inc. | 356234 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V结合缓冲液 | Shanghai HongYe Biotech Co., Ltd. | GK10037 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 78440 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 23225 | |
| 牛血清白蛋白 | GBCBIO Technologies, Inc. | G3522 | |
| 抗caspase-3抗体 | Proteintech Group, Inc. | 25128-1-AP | |
| 抗裂解PARP抗体 | BIOSS | bsm-52408R | |
| 抗YAP1抗体 | BIOSS | bs-3605R | |
| 抗Sox2抗体 | BIOSS | bs-0523R | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech Group, Inc. | 60004-1-Ig | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG H&L二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0208 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG H&L二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0216 | |
| ECL底物 | MilliporeSigma | WBKLS0500 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| CDDP敏感性分析 | 顺铂 | MedChemExpress | 15663-27-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SK-OV-3和A2780细胞的培养基(McCoy's 5A培养基含10% FBS和1:100的新霉素溶液)、培养条件(37°C, 5% CO2, 98%相对湿度)、胰酶消化(0.25%) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| siRNA转染 | siRNA浓度(50 nM)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染时间(6小时)、后续培养时间(48小时)、分组(siNC、siLINC00473、未处理对照) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| LINC00473敲低效率检测 | 转染后48小时收集细胞、RNA提取方法(TRIzol)、qPCR条件(退火温度60°C)、内参(GAPDH)、数据分析方法(2^-ΔΔCq) 阅读提示:Materials and methods, LINC00473 knockdown efficiency analysis by RT-qPCR |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(2.0×10^4细胞/孔)、CCK-8试剂孵育时间(2小时)、检测时间点(24,48,72,96小时)、技术重复(5个)、空白对照 阅读提示:Materials and methods, Cell Counting Kit 8 (CCK-8) assay |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞密度(1.0×10^6 cells/ml)、Transwell孔径(8.0 µm)、培养时间(24小时)、Matrigel浓度(1:8稀释)、染色方法(0.5%结晶紫)、计数方法(×200, 五个随机视野) 阅读提示:Materials and methods, Cell migration and invasion assays |
| 凋亡检测 | 细胞密度(1×10^6 cells/ml)、Annexin V和PI用量(各5 µl)、孵育时间(15分钟)、流式细胞仪设置(FITC和PI通道)、补偿设置 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometric analysis of apoptosis |
| Western blot | 蛋白上样量(20-40 µg)、一抗稀释比(caspase-3 1:1000, PARP 1:1000, YAP1 1:2000, Sox2 1:500, GAPDH 1:5000)、二抗稀释比(1:5000)、曝光时间(10秒-10分钟)、内参(GAPDH) 阅读提示:Materials and methods, Western blot analysis |
| CDDP敏感性分析 | CDDP浓度(30 µM)、处理时间(48小时)、分组(siNC、siLINC00473、siNC+CDDP、siLINC00473+CDDP)、检测方法(CCK-8) 阅读提示:Materials and methods, CDDP sensitivity assay |