体外细胞模型验证ARF6功能
确定ARF6在OxLDL刺激的HASMCs中对脂质摄取、迁移、增殖和炎症反应的影响
使用shRNA敲低HASMCs中ARF6,用OxLDL(80 μg/ml)刺激,检测迁移(Boyden chamber)、增殖(alamarBlue)、脂质摄取(Oil Red O、AcLDL-488)、清道夫受体表达(Western blot)和IL-6分泌(ELISA)。
ARF6 controls VSMC phenotypic switching upon lipid stimulation to promote inflammatory signaling contributing to the progression of atherosclerosis.
包含体外HASMCs功能实验(脂质摄取、迁移、增殖、炎症因子分泌)及体内SMC特异性ARF6敲除小鼠模型,并进行机制验证(TLR4、NF-κB、p38通路)。
人主动脉平滑肌细胞(HASMCs) Acta2-Cre-ERT2+/−/Apoee−/−/Arf6f/f小鼠(SMC特异性ARF6敲除)
ARF6敲低(shRNA)效率及对照(shCtl) OxLDL浓度(80 μg/ml)及刺激时间(4h迁移,72h增殖/脂质摄取) 他莫昔芬(TAM)剂量(75 mg/kg/day,5天腹腔注射)及对照组(花生油) 小鼠高脂饮食(Envigo TD.96121)持续时间(10周) 小鼠数量(主动脉弓:TAM n=12,对照 n=14;主动脉窦:TAM n=14,对照 n=9)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ARF6在OxLDL刺激的HASMCs中对脂质摄取、迁移、增殖和炎症反应的影响
使用shRNA敲低HASMCs中ARF6,用OxLDL(80 μg/ml)刺激,检测迁移(Boyden chamber)、增殖(alamarBlue)、脂质摄取(Oil Red O、AcLDL-488)、清道夫受体表达(Western blot)和IL-6分泌(ELISA)。
阐明ARF6调节IL-6分泌和炎症信号的下游机制
使用TLR4抑制剂TAK-242、MyD88抑制剂TJ-m2010-5、p38抑制剂SB203580、NF-κB抑制剂BOT-4预处理细胞,检测IL-6分泌和ARF6激活(GTP-loading assay)。
在动脉粥样硬化小鼠模型中验证ARF6缺失对斑块形成和炎症的影响
构建Acta2-Cre-ERT2+/−/Apoee−/−/Arf6f/f小鼠,腹腔注射他莫昔芬诱导SMC特异性ARF6敲除,高脂饮食喂养10周,分析主动脉斑块面积(ORO染色)、胶原含量(Masson Trichrome、Sirius Red)和炎症标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 平滑肌细胞培养基 | ScienCell Research Laboratories | -- |
| 细胞感染 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 慢病毒包装 | psPax.2包装质粒 | Addgene | -- |
| pMD2.G包装质粒 | Addgene | -- | |
| RNA提取 | Qiagen AllPrep DNA/RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| Qiagen RNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 抗体 | 抗ARF6抗体 | Abcam | Ab131261 |
| 抗ICAM-1抗体 | Abcam | Ab53013 | |
| 抗LDLR抗体 | Abcam | Ab52818 | |
| 抗VCAM-1抗体 | BIOSS | bs-0920R | |
| 抗ARF1抗体 | Proteintech | 202260-1-ap | |
| 抗ICAM-1抗体 | Proteintech | 10020-1-AP | |
| 抗CD36抗体 | Proteintech | 18836-1-AP | |
| 抗TLR4抗体 | Proteintech | 19811-1-ap | |
| 抗LOX-1抗体 | Proteintech | 11837-1-AP | |
| 抗ARF6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7971 | |
| Western blot | Amersham ECL Prime Western检测试剂 | GE Healthcare | -- |
| 脂质摄取 | Alexa Fluor 488标记的鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Alexa Fluor 488标记的乙酰化LDL | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 氧化低密度脂蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 迁移实验 | Boyden小室 | 文中未明确说明 | -- |
| 增殖实验 | alamarBlue试剂 | Bio-Rad | -- |
| Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| 细胞因子检测 | IL-6 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质谱分析 | Amicon Ultra-15离心过滤装置 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| Easy-nLC 1200液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Orbitrap HF Biopharma质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 花生油 | -- | -- | |
| 高脂饮食(TD.96121) | Envigo | TD.96121 | |
| 组织染色 | Masson三色染色试剂盒 | Sigma | HT15 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 568标记的二抗 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验 | HASMCs代数(4-8代)和来源;ARF6 shRNA靶序列(TRCN0000380270);慢病毒感染时polybrene浓度(8 μg/ml);嘌呤霉素筛选浓度(2 μg/ml);OxLDL浓度(80 μg/ml)及刺激时间(迁移4h、增殖72h、脂质摄取72h、IL-6 24h);AcLDL浓度(1 μg/ml)及孵育时间(18h);迁移实验中使用胶原I包被的Boyden小室。 阅读提示:参见Methods中"HASMCs cell culture"、"Lipid uptake"、"Migration assay"、"Proliferation assay"、"IL-6 enzyme-linked immunosorbent assay"部分 |
| 信号通路抑制剂处理 | 抑制剂浓度:LY294002 50 μM,Dynasore 100 μM,TAK-242 30 μM,TJ-m2010-5 40 μM,SB203580 10 μM,BOT-4 10 μM;预处理时间为1h;ARF6激活检测时OxLDL刺激时间2分钟。 阅读提示:参见Methods中"ARF6 activation assay"及图1I、图3D-F图注 |
| 动物模型 | 小鼠基因型(Acta2-Cre-ERT2+/−/Apoee−/−/Arf6f/f);他莫昔芬剂量(75 mg/kg/day,连续5天腹腔注射);对照组(花生油);高脂饮食(Envigo TD.96121)喂养10周;动物性别(雄性)和年龄(8周龄);主动脉弓斑块面积(TAM组n=12,对照组n=14);主动脉窦斑块面积(TAM组n=14,对照组n=9)。 阅读提示:参见Methods中"Animal protocol"、"En face analysis of atherosclerosis in mice"及图5图注 |
| 组织学分析 | 组织固定(10%福尔马林24h);ORO染色(0.7%丙二醇,37°C 16h);胶原染色(Masson Trichrome、Sirius Red);免疫荧光染色(抗体浓度、孵育条件);切片厚度(4 μm石蜡切片,10 μm冰冻切片)。 阅读提示:参见Methods中"IHC and immunofluorescence"及图6图注 |