临床样本中NUSAP1表达分析
验证NUSAP1在子宫内膜癌组织中的表达及其临床意义。
利用TIMER2.0和TCGA数据库分析NUSAP1表达,并通过免疫组化检测108例EC患者肿瘤及癌旁组织的NUSAP1蛋白水平,进行临床病理相关性分析。
NUSAP1 Drives Endometrial Carcinoma via IP3R Phosphorylation, Calcium Dyshomeostasis, and ER-Stress-Mediated Apoptosis.
整合生物信息学、临床组织IHC、细胞功能实验(增殖、侵袭、凋亡)、钙/ER应激检测及机制实验(Co-IP、IP3R敲低),但缺乏动物实验验证。
HEC-1-B细胞 ISK细胞 子宫内膜癌患者组织样本
NUSAP1在HEC-1-B和ISK细胞中的敲低和过表达效率(siRNA#3和OE质粒) IP3R敲低后对细胞内Ca2+水平、ER应激标志物(IRE1、PERK)及p-IP3R的影响 NUSAP1与IP3R的相互作用通过Co-IP验证 NUSAP1敲低对凋亡率、Bcl-2/Bax表达、PINK1/Parkin水平的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NUSAP1在子宫内膜癌组织中的表达及其临床意义。
利用TIMER2.0和TCGA数据库分析NUSAP1表达,并通过免疫组化检测108例EC患者肿瘤及癌旁组织的NUSAP1蛋白水平,进行临床病理相关性分析。
评估NUSAP1对子宫内膜癌细胞增殖、侵袭、凋亡、细胞周期及细胞骨架的影响。
在HEC-1-B和ISK细胞中敲低或过表达NUSAP1,通过CCK-8、Transwell、流式细胞术、细胞骨架染色、Western blot检测相关表型。
探究NUSAP1对细胞内Ca2+水平和内质网应激的影响。
使用Fluo-4 AM和ER-Tracker Green荧光探针检测细胞内Ca2+浓度和ER应激,并通过Western blot检测IRE1和PERK表达。
验证NUSAP1是否调控IP3R磷酸化,并确认两者间是否存在相互作用。
通过Western blot和免疫荧光检测p-IP3R和总IP3R水平;通过Co-IP实验验证NUSAP1与IP3R的结合。
验证IP3R在NUSAP1调控Ca2+和ER应激中的功能性作用。
敲低IP3R,单独或与NUSAP1过表达/敲低联合,检测细胞内Ca2+、ER应激标志物和p-IP3R水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipo8000转染试剂 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8溶液 | Beyotime Biotechnology | C0037 |
| 侵袭实验 | 基质胶 | -- | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI | KeyGEN BioTECH | KGA1102 |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | Beyotime Biotechnology | C1052 |
| 免疫荧光 | NUSAP1抗体 | Proteintech | 12024-1-AP |
| IP3R抗体 | Affinity | DF3000 | |
| p-IP3R抗体 | Affinity | DF2999 | |
| 二抗 | ZSGB-Bio | ZF-0511 | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | -- | -- | |
| 免疫组化 | NUSAP1抗体 | Proteintech | 12024-1-AP |
| 二抗 (PV-9000) | ZSGB-Bio | PV-9000 | |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| 苏木素 | -- | -- | |
| 蛋白质提取 | 总蛋白提取试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGB5303-100 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| NUSAP1抗体 | Proteintech | 12024-1-AP | |
| IP3R抗体 | Affinity | DF3000 | |
| p-IP3R抗体 | Affinity | DF2999 | |
| Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-IG | |
| Bcl-2抗体 | BD | 610538 | |
| IRE1抗体 | Proteintech | 27528-1-AP | |
| PERK抗体 | Proteintech | 20582-1-AP | |
| PINK1抗体 | Bioss | bsm-51265M | |
| Parkin抗体 | Bioss | bs-23687R | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | ZSGB-Bio | ZB-2301 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | ZSGB-Bio | ZB-2305 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A+G磁珠 | Beyotime Biotechnology | P2179 |
| 钙离子检测 | Fluo-4 AM | Beyotime Biotechnology | S1060 |
| 细胞骨架染色 | 肌动蛋白示踪绿色荧光染料 | Beyotime Biotechnology | C2201 |
| 内质网应激检测 | 内质网绿色荧光探针 | Beyotime Biotechnology | C1042 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系、培养基、转染试剂、siRNA序列及浓度、转染时间 阅读提示:Methods 2.1 |
| 临床样本分析 | 样本量、样本来源、伦理批件号、IHC评分标准 阅读提示:Methods 2.2 和 2.8,以及结果3.1 |
| 细胞增殖和侵袭检测 | CCK-8细胞密度、孵育时间;Transwell基质胶浓度、细胞数、孵育时间 阅读提示:Methods 2.3 和 2.4 |
| 凋亡和细胞周期检测 | Annexin V-FITC/PI染色条件;PI染色固定和染色时间 阅读提示:Methods 2.5 和 2.6 |
| 钙信号和ER应激检测 | Fluo-4 AM浓度、孵育时间;ER-Tracker Green孵育时间 阅读提示:Methods 2.11 和 2.13 |
| 机制验证 | IP3R siRNA效率、Co-IP所用抗体及磁珠 阅读提示:Methods 2.10 和 结果3.6 |