FtsZ序列分析和保守性鉴定
分析FtsZ在支原体中的进化关系和保守性,评估其作为疫苗靶点的潜力。
利用NCBI数据库获取FtsZ蛋白序列,进行Blastp比对、多序列比对和系统发育树构建,并用Western blot检测不同菌株中FtsZ表达。
FtsZ contributes to cytoadhesion and interaction with host extracellular matrix components and plasminogen in Mycoplasma bovis.
包含蛋白水平定位与免疫原性、体外结合实验(ELISA、dot blot)、基因敲除与回补株黏附功能验证、纤溶酶原激活实验等多层级验证。
牛支原体PG45参考株及临床分离株 胚胎牛肺(EBL)细胞 牛支原体ΔftsZ敲除株与回补株
M. bovis菌株:PG45、临床分离株、ΔftsZ突变株、ΔftsZ:ftsZ回补株 EBL细胞培养条件:DMEM培养基,37°C、5% CO2 感染复数(MOI)为1000,感染时间1.5h 黏附抑制实验:热灭活抗FtsZ血清(1:10和1:20稀释)预孵育 纤溶酶原激活实验:rFtsZ (1μg)、纤溶酶原 (1μg)、tPA (50ng)、ε-ACA (80mM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析FtsZ在支原体中的进化关系和保守性,评估其作为疫苗靶点的潜力。
利用NCBI数据库获取FtsZ蛋白序列,进行Blastp比对、多序列比对和系统发育树构建,并用Western blot检测不同菌株中FtsZ表达。
获取纯化的rFtsZ蛋白和特异性多克隆抗体,用于后续功能实验。
将ftsZ基因克隆至pET-30a载体,在大肠杆菌BL21(DE3)中表达并纯化rFtsZ蛋白;免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体,并用ELISA检测效价。
验证FtsZ在牛支原体中的免疫原性及膜定位。
通过Western blot检测rFtsZ与感染/免疫牛血清的反应性;通过菌落印迹和Western blot分析牛支原体全细胞、膜蛋白和胞质蛋白中FtsZ分布。
验证FtsZ能否直接结合宿主细胞及其粘附特性。
利用激光共聚焦显微镜观察rFtsZ与EBL细胞的黏附,并通过ELISA检测rFtsZ与EBL细胞膜提取物的剂量依赖性结合及抗血清抑制效果。
鉴定FtsZ与宿主ECM蛋白的结合能力。
通过dot blot和ELISA检测rFtsZ与纤连蛋白、层粘连蛋白、玻连蛋白、胶原IV的结合。
验证FtsZ是否通过tPA促进纤溶酶原转化为纤溶酶,从而促进组织扩散。
通过dot blot检测rFtsZ与纤溶酶原、tPA的结合,并用发色底物检测纤溶酶活性;加入ε-ACA验证赖氨酸残基的作用。
验证ftsZ基因在牛支原体黏附中的功能必要性。
构建ΔftsZ突变株和回补株,通过PCR和Western blot验证基因敲除和回补,通过平板计数和激光共聚焦显微镜比较黏附能力,并进行抗体抑制实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 马血清 | Gibco | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 基因克隆 | pET-30a-ftsZ | Sangon Biotech | -- |
| 质粒构建 | pOH/P | -- | -- |
| 基因克隆 | 细菌基因组DNA提取试剂盒 | TIANGEN | -- |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA树脂 | GenScript Biotech Corporation | -- |
| 免疫小鼠 | QuickAntibody-Mouse 5W佐剂 | Biodragon | KX0210041 |
| 蛋白提取 | 细胞膜提取试剂盒 | Thermo | 89842 |
| 免疫荧光 | HRP标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime Biotechnology | A0216 |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)Alexa FluorTM 488 | Thermo | A-11029 | |
| DiI | Beyotime Biotechnology | C1991S | |
| DAPI | Sigma | MBD0015 | |
| 黏附实验 | CFDA-SE | Beyotime Biotechnology | C0051 |
| 蛋白印迹 | PVDF膜 | Amersham | -- |
| HRP标记的山羊抗牛IgG(H+L) | Abcam | -- | |
| 化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ChemiDoc XR+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| dot blot | 硝酸纤维素(NC)膜 | Solarbio | -- |
| QuickBlock™ Western封闭液 | Beyotime Biotechnology | P0252 | |
| ELISA | TMB底物 | -- | -- |
| iMark酶标仪 | Bio-Rad | -- | |
| 显微镜成像 | 卡尔蔡司激光扫描共聚焦显微镜LSM980 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌和细胞培养 | M. bovis PG45及临床分离株培养在含10%马血清的PPLO培养基中;ΔftsZ突变株需补充卡那霉素(100μg/mL);回补株需补充嘌呤霉素(10μg/mL);EBL细胞培养于DMEM培养基。 阅读提示:Materials and methods - Bacterial strain and cell culture |
| 重组蛋白表达与抗体制备 | rFtsZ用Ni-NTA树脂纯化(约47kDa);6周龄BALB/c小鼠每次免疫20μg rFtsZ与佐剂1:1混合,共三次,间隔21天和35天。 阅读提示:Materials and methods - Preparation of recombinant protein and polyclonal antibodies |
| 黏附实验 | EBL细胞以MOI 1000感染M. bovis 1.5h;抗FtsZ血清预孵育1h;anti-FtsZ血清稀释1:10和1:20。 阅读提示:Materials and methods - Mycoplasma adhesion assay; Figure 6 |
| 分子相互作用检测 | rFtsZ与ECM蛋白结合实验:dot blot中rFtsZ浓度0.125-2μg,ECM蛋白10μg;ELISA中rFtsZ浓度1.56-800ng,ECM蛋白200ng/孔。 阅读提示:Materials and methods - Dot blot, ELISA; Figure 4 |
| 纤溶酶原激活 | rFtsZ(1μg)与纤溶酶原(1μg)37°C孵育1h;tPA(50ng)或ε-ACA(80mM)加入15min;底物0.5mM,检测405nm。 阅读提示:Materials and methods - Plasminogen activation assay; Figure 5 |