环境样本检测
验证DFA和dfa-miR-276-3p是否存在于居住环境中
收集居住环境灰尘样本,用PCR检测Der f1基因,qPCR检测dfa-miR-276-3p表达。
A novel role of Dermatophagoides farinae-derived miR-276-3p in aggravating mite-induced allergic airway inflammation.
文章包含体内外模型、靶基因验证和机制研究,但未提供具体实验步骤和重复次数等细节,实验完整度信息不足。
C57BL/6小鼠过敏性气道炎症模型 BEAS-2B细胞
小鼠模型:AAV-dfa-miR-276-3p肺内过表达,DFE致敏和激发(致敏100 μg,激发10 μg) 细胞模型:BEAS-2B细胞转染dfa-miR-276-3p mimic(50-100 nM) STC1靶向验证:双荧光素酶报告实验 机制验证:ROS/NF-κB通路检测 炎症指标:BALF细胞计数、IL-4/5/10、IgE、HE/PAS染色
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DFA和dfa-miR-276-3p是否存在于居住环境中
收集居住环境灰尘样本,用PCR检测Der f1基因,qPCR检测dfa-miR-276-3p表达。
在体内验证dfa-miR-276-3p对DFE诱导气道炎症的影响
小鼠通过鼻腔给予AAV-dfa-miR-276-3p过表达dfa-miR-276-3p,第21天DFE致敏,第28-32天激发,第35天处死分析。
在体外验证dfa-miR-276-3p对DFE诱导炎症的影响
BEAS-2B细胞转染dfa-miR-276-3p mimic或mimic NC,然后用DFE刺激,检测细胞因子释放、细胞活力和凋亡。
验证dfa-miR-276-3p是否直接靶向STC1
构建STC1野生型和突变型3'-UTR荧光素酶报告质粒,与dfa-miR-276-3p mimic共转染BEAS-2B细胞,检测荧光素酶活性。
探讨dfa-miR-276-3p是否通过抑制STC1激活ROS/NF-κB通路
Western blot检测STC1、NF-κB p65和p-p65表达,免疫荧光检测NF-κB核转位,DCFH-DA/DHE探针检测ROS水平,并加入rhSTC1观察逆转作用。
评估STC1在儿童过敏性气道炎症中的临床相关性
收集儿童血清样本,ELISA检测STC1浓度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | dfa-miR-276-3p模拟物 | RiboBio | -- |
| 模拟物阴性对照 | RiboBio | -- | |
| riboFECT CP转染试剂盒 | RiboBio | -- | |
| 动物实验 | 腺相关病毒- dfa-miR-276-3p | Zebrafish | -- |
| 腺相关病毒阴性对照 | Zebrafish | -- | |
| 粉尘螨提取物 | Greer Laboratories | -- | |
| 样本处理 | 组织DNA提取试剂盒 | Wuxi MedTech Biomedicine Co., Ltd. | -- |
| RNA提取 | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | -- |
| 逆转录 | HiScript IV All-in-One Ultra RT SuperMix for qPCR | Vazyme | -- |
| Bulge-Loop miRNA qRT-PCR Starter Kit | RiboBio | -- | |
| qPCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| LightCycler 480实时荧光定量PCR系统 | Roche | -- | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Absin | -- |
| IL-33 ELISA试剂盒 | 4A Biotech | -- | |
| TSLP ELISA试剂盒 | 4A Biotech | -- | |
| IL-4 ELISA试剂盒 | 4A Biotech | -- | |
| IL-5 ELISA试剂盒 | 4A Biotech | -- | |
| 总IgG ELISA试剂盒 | Mlbio | -- | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Mlbio | -- | |
| STC1 ELISA试剂盒 | Cloud-clone Corporation | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC | MeilunBio | -- |
| 碘化丙啶 | MeilunBio | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen | -- |
| Spark多功能酶标仪 | TECAN | -- | |
| 蛋白质印迹 | SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 脱脂牛奶 | Beyotime | -- | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | -- | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology, Inc. | -- | |
| 抗STC1抗体 | Gentex | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Bioss | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG抗体 | Bioss | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Vazyme | -- | |
| ImageQuant 800成像系统 | Cytiva | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | -- |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| 抗claudin 1抗体 | Proteintech | -- | |
| CY3标记的山羊抗兔IgG (H+L)抗体 | Boster | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| Zeiss Observer 7显微镜 | Zeiss | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | -- |
| DHE探针 | Biolab | -- | |
| Olympus BX63荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 临床样本检测 | CAP系统 | Pharmacia & Upjohn Diagnostics AB | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型(AAV介导过表达) | 小鼠品系:C57BL/6,雌性,5周龄;AAV9载体,鼻腔给药,DFE致敏量100μg,激发量10μg/天,时间点(第21天致敏,28-32天激发) 阅读提示:见“Modeling allergic airway inflammation in mice”和“Fig. 2A, 2E” |
| 细胞模型(BEAS-2B细胞) | 细胞来源:BEAS-2B;转染试剂:riboFECT CP;mimic浓度:50 nM和100 nM;DFE浓度:50 μg/mL 阅读提示:见“Cell culture and transfection”和“Fig. 3A” |
| STC1靶向验证 | STC1 3'UTR野生型和突变型荧光素酶质粒,dfa-miR-276-3p mimic,共转染48小时 阅读提示:见“Dual-luciferase report assay”和“Fig. 4C” |
| 机制验证(ROS/NF-κB通路) | rhSTC1处理,Western blot检测STC1、p-NF-κB p65、NF-κB p65,免疫荧光检测NF-κB核转位,DCFH-DA/DHE检测ROS 阅读提示:见“Western blotting”、“Immunofluorescence”、“ROS detection”及“Fig. 5” |
| 临床样本 | 儿童血清样本:DFA过敏(n=50,平均年龄6.98岁),健康对照(n=50,平均年龄6岁) 阅读提示:见“Serum samples collection”和“Table S3” |